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2012 Fiscal Year Annual Research Report

AIDによるtopoisomerase1を介したゲノム不安定性誘導のメカニズム

Research Project

Project/Area Number 22000015
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

本庶 佑  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 客員教授 (80090504)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords体細胞突然変異 / クラススイッチ組換え / RNA編集 / DNA修復
Research Abstract

<AIDによるTop1翻訳阻害のメカニズムの解明>本年度はAgo2タンパク質がTop1 mRNAに結合する特異的部位をPAR - CLIP法によって同定した。一箇所はAIDに依存しない領域であり、一箇所はAID刺激時のみに結合する領域であった。さらにこの結合部位の近傍でmiRNAが直接結合する塩基配列の決定を行い、現在これに結合するmiRNAの同定を進めている。
<AID依存DNAターゲット切断の特異性決定メカニズムの解明>AIDによる切断ターゲット部位にはNon-B構造をとる塩基配列が存在することを明らかにした。さらにS領域の単鎖塩基配列に特異的に結合する人工タンパク質(TALE)を発現させると、転写を阻害せずにクラススイッチ(CSR)を阻害することを発見した。このことはS領域が部分的に単鎖構造をとり、それがCSRに重要なことを示し、我々のモデルと一致する。
<AID依存切断後のUNGによる体細胞突然変異(SHM)とクラススイッチ組換えの制御>Top1切断によって生じる単鎖ギャップにおいて、ウラシルDNAグリコシラーゼ(UNG)が酵素でなく、正しく修復する酵素群(BER)の足場タンパク質として働きRev1を足場タンパク質とする変異を導入する酵素群(error – proneポリメラーゼ)と競合的に結合することを発見した。CSR組換えを起こすためにはメガベース領域の離れた二箇所のS領域間でシナプスを形成することが重要である。UNGはこの段階において53BP1とDNA PKcsと協調して働くことを明らかにした。UNGはさらにその後のDNA切断後の修復にも関与し、DNA断端の接近保持に重要な役割をすることを明らかにした。なお、AIDのC末端側によるRNA編集によるあらたな産物もこの段階で協調的に働く証拠を得た。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初、予定していたAIDによるmiRNA制御に関しては、確実に進展を見せており、Top1 mRNAへのmiRNAの結合領域の確定まで進み、現在、大量の塩基配列決定によりmiRNAの同定を進めている。今回さらに特異的塩基結合人工タンパク質TALEを用いた新たな方法によるNon-B DNA形成の証拠を得た。またUNGが体細胞突然変異には抑制的に逆にクラススイッチには亢進に関わる分子的なメカニズムを明らかにし、従来DNAディアミネーション学説では説明できなかった現象をほぼ解明した。

Strategy for Future Research Activity

まず第一に、結合Top1 mRNAに、AID依存性に結合するmiRNAを同定することに大きな精力を費やす。さらに切断後のDNA修復の過程として生じるSHMとCSRのメカニズムについてUNGを通じた新たな制御機構を解明し、AIDによる抗体記憶形成の分子機構に関する全貌解明を目指す。

  • Research Products

    (15 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 4 results) Book (1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] The histone chaperone SPT6 is required for Activation-induced Cytidine Deaminase target determination through H3K4me3 regulation.2013

    • Author(s)
      Begum, N.A. et al.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 287 Pages: 32415-32429

    • DOI

      doi.10.1074/jbM112.351569

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNA editing of hepatitis B virus transcripts by activation-induced cytidine deaminase.2013

    • Author(s)
      Liang, G. et al.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 110 Pages: 2246-2251

    • DOI

      doi:10.1073/pnas.1221921110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Accumulation of the FACT complex as well as histone H3.3 serves as a target marker for somatic hypermutation.2013

    • Author(s)
      Aida, M. et al.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vivo analysis of Aicda gene regulation: critical balance between upstream enhancer and intronic repressor for the appropriate expression.2013

    • Author(s)
      Le Thi Huong et al.
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An evolutionary view of the mechanism for immune and genome diversity.2012

    • Author(s)
      Kato, L. et al.
    • Journal Title

      J. Immunol.

      Volume: 118 Pages: 3559-3566

    • DOI

      doi:10.4049/jimmunol.1102397

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The DSIF subunits Spt4 and Spt5 have distinct roles at various phases of immunoglobulin class switch recombination.2012

    • Author(s)
      Stanlie, A. et al.
    • Journal Title

      PLoS Genet.

      Volume: 8 Pages: 1-11

    • DOI

      doi:10.1371/journal.pgen.1002675

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolutionary comparison of the mechanism of DNA cleavage with respect to immune diversity and genomic instability.2012

    • Author(s)
      Begum, N.A. and Honjo, T.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 51 Pages: 5243-5256

    • DOI

      doi.org/10.1021/b13005895

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] An evolutionary view of the mechanism for immune and genome diversity

    • Author(s)
      本庶 佑
    • Organizer
      Max-Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics Special Guest Series
    • Place of Presentation
      Freiburg, Germany
    • Invited
  • [Presentation] Evolution of immune diversity from genome instability

    • Author(s)
      本庶 佑
    • Organizer
      2012 French-Japanese Meeting "Immune Defenses in Humans and in Model Organisms"
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Invited
  • [Presentation] Acquired immunity, genome instability, cancer

    • Author(s)
      本庶 佑
    • Organizer
      Robert Koch Lecture
    • Place of Presentation
      Berlin, Germany
    • Invited
  • [Presentation] Acquired immunity, genome instability, and cancer

    • Author(s)
      本庶 佑
    • Organizer
      Keystone Symposia: B Cell Development and Function
    • Place of Presentation
      Colorado, USA
    • Invited
  • [Book] ゲノムが語る生命像2012

    • Author(s)
      本庶 佑
    • Total Pages
      259
    • Publisher
      講談社
  • [Remarks] 京都大学大学院医学研究科 免疫ゲノム医学

    • URL

      http://www2.mfour.med.kyoto-u.ac.jp/

  • [Remarks] 京都大学大学院医学研究科・医学部 免疫ゲノム医学

    • URL

      http://www.med.kyoto-u.ac.jp/organization-staff/research/doctoral_course/r-070/

  • [Remarks] Immunology and Genomic Medicine

    • URL

      http://www.med.kyoto-u.ac.jp/E/grad_school/introduction/1513/

URL: 

Published: 2014-07-24  

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