2014 Fiscal Year Annual Research Report
ヒト染色体動態の全体像解明に向けた染色体情報システムの構築
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22221009
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
白髭 克彦 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90273854)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
広田 亨 公益財団法人がん研究会, その他部局等, その他 (50421368)
伊藤 武彦 東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (90501106)
須谷 尚史 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 (30401524)
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| Project Period (FY) |
2010-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | ゲノム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
26年度の成果は以下にまとめることができる
1. ヒト染色体動態の可視化システムとして従来のソフトをDROMPAIIにバージョンアップし、いくつかの標準化手法を取り入れた。また、新たに、マウス細胞をスパイクインすることによりより定量的にヒト染色体のChIP-seq解析を行う系の開発に着手した。
2. 染色体高次構造と転写の伸長反応をリンクさせる因子としてコヒーシンタンパクを同定した。この同期不全が原因で発症する疾患CHOPS症候群の分子病態を明らかにした。
3. 染色体凝縮因子であるコンデンシンがR-Loop構造をマスクすることで染色体分離に寄与していることを見出した。
4. 染色体高次構造に関わるタンパクのKOマウスの系統を幾つか作出し、それらの発生分化過程への寄与を明らかにするための材料を整えた。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Germline gain-of-function mutations in AFF4 cause a developmental syndrome functionally linking the super elongation complex and cohesin.2015
Author(s)
Izumi K, Nakato R, Zhang Z, Edmondson AC, Noon S, Dulik MC, Rajagopalan R, Venditti CP, Gripp K, Samanich J, Zackai EH, Deardorff MA, Clark D, Allen JL, Dorsett D, Misulovin Z, Komata M, Bando M, Kaur M, Katou Y, Shirahige K*, Krantz ID*.(Shared Corresponding Authors)
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Journal Title
Nat Genet.
Volume: 47
Pages: 338-344
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] The chromosomal association of the Smc5/6 complex depends on cohesion and predicts the level of sister chromatid entanglement.2014
Author(s)
Jeppsson K, Carlborg KK, Nakato R, Berta DG, Lilienthal I, Kanno T, Lindqvist A, Brink MC, Dantuma NP, Katou Y, Shirahige K, Sjogren C.
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Journal Title
PLoS Genet.
Volume: 10
Pages: e1004680
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Histone variants enriched in oocytes enhance reprogramming to induced pluripotent stem cells.2014
Author(s)
Shinagawa T, Takagi T, Tsukamoto D, Tomaru C, Huynh LM, Sivaraman P, Kumarevel T, Inoue K, Nakato R, Katou Y, Sado T, Takahashi S, Ogura A, Shirahige K, Ishii S.
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Journal Title
Cell Stem Cell.
Volume: 14
Pages: 217-224
DOI
Peer Reviewed
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