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2011 Fiscal Year Annual Research Report

地球環境保全を目指した海洋生物における石灰化の制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22228006
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

長澤 寛道  東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (60134508)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小暮 敏博  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (50282728)
Keywords海洋生物 / 石灰化 / 地球環境保全 / 有機無機相互作用 / 結晶多形 / 基質タンパク質 / バイオミネラリゼーション / その場観察
Research Abstract

今年度は、昨年度に引き続き数種のバイオミネラルを対象に有機基質と炭酸カルシウムの相互作用を解析した。
円石藻のココリスの有機基板に強固に結合しているタンパク質の部分配列を基にcDNAをクローニングし、全予想配列を得た。このタンパク質の機能を明らかにするために組換え体の作製中である。また、ノックダウン実験による機能解明についてもその方法から検討してきたが、未だに確立できていない。軟体動物アコヤガイの真珠層から抽出同定したPifタンパク質の類似の分子を数種の近縁種から探索したした結果、cDNAを取得できたが、近年の種ほど配列の類似性が高いことが分かった。また、真珠光沢を有さない変異体の貝殻成分を調べた結果、石灰化に重要な役割を果たしている炭酸脱水酵素が分解されていることが分かったが、これが原因かどうかは今後の課題である。さらに、アコヤガイ幼生の貝殻形成を結晶多形の観点から解析した。アザミサンゴの骨格の可溶性タンパク質として唯一同定されている基質タンパク質galaxinの機能解析のために様々な長さの組換え体を発現した。予備実験の結果、galaxinはキチンおよび炭酸カルシウム結晶に結合することが分かった。金魚のウロコの石灰化組織から同定したリン酸化タンパク質GSP-37はリン酸化がリン酸カルシウム結合に極めて重要であることが分かった。また、RT-PCRでの発現解析からGSP-37は主要な石灰化組織である骨や歯には発現していないと推定された。
以上の個々の石灰化組織から得られた結果を総合して、石灰化の共通のメカニズムを有機基質の所在と機能を基に初めてモデルを提出した。このモデルの確かさについては、さらに精査していく必要がある。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究の目的は、海洋生物における石灰化の制御機構の解明である。石灰化組織には炭酸カルシウムあるいはリン酸カルシウムのような無機鉱物のほかに微量の有機物が含まれ、この有機物が石灰化を制御していると考えられてきた。われわれは、その機能的な有機物を実際石灰化組織から抽出精製し、構造を明らかにするとともに実験を通してその機能を推定してきた。その結果、有機物には低分子から高分子まで多様な分子が含まれ、また石灰化組織内の存在様式も多様であることを様々な石灰化生物に由来する石灰化組織を用いて明らかにしてきた。それらの情報を総合して、石灰化機構の簡単なモデルを提出した。個々の材料に関する解析は進展の度合いが異なるが、そこから得られる結果は最終的にはモデルの精密化に役立つと考えられる。ただし、モデルは共通メカニズムの概要であり、個々のケースでの特殊性が存在し、それらをより詳細に明らかにすることも本研究の目的である。以上の2つの意味で、目的をほぼ達成していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

提出しているモデルの精密化は一つの大きな目標であるが、そのためには個々の材料を用いた石灰化の解析が重要である。あと1年であることを考えると、以下の4つのことに特に集中して実験を行いたい。
第一は、円石藻に対する機能解析のための遺伝子導入法の確立である。これまでだれも成功していないし、今後円石藻類のタンパク質の機能を解析するうえで必須の手段となることが予想される。われわれは一つ一つの関門を乗り越えてきてようやく完成にたどりつきつつある。第二は、アザミサンゴの骨格タンパク質のうち不溶性のタンパク質の同定である。これまでサンゴからはわずか1種類の基質タンパク質しか得られていない。海洋生物における石灰化のうち熱帯・亜熱帯域の沿岸での石灰化の主たる担い手はサンゴであるが、その石灰化の機構に関する知識はほとんどないのが現状である。われわれは、不溶性で界面活性剤を用いて初めて可溶化されてくる2種類のタンパク質をSDS-PAGE上で確認しているので、それらの構造情報を得たい。機能解析も行いたいが、十分な時間は残されていないと思われる。第三は、アコヤガイを用いた真珠養殖において真珠形成に先立って移植した外套膜片によって真珠袋が形成されるが、その機構は極めて重要であるにもかかわらず、ほとんどわかっていない。真珠袋形成およびその石灰化機構を解明するためにin vitroで外套膜片を培養することによって新たな情報を得たい。第四は、結晶多形制御のメカニズムである。無機塩組成、特にマグネシウム存在下で、あるいは有機基質存在下での結晶多形誘導を鉱物学的手段も併用して解明したい。

  • Research Products

    (47 results)

All 2012 2011

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (35 results) (of which Invited: 4 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] The crustacean cuticle: structure, composition and mineralization2012

    • Author(s)
      Hiromichi Nagasawa
    • Journal Title

      Frontiers in Bioscience, Elite

      Volume: 4 Pages: 711-720

    • DOI

      10.2741/412

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of Coccolith Polysaccharides Isolated from the Coccolithophorid, Emiliania huxleyi, on Calcite Crystal Formation in In Vitro CaCO3 Crystallization2011

    • Author(s)
      K. Kayano, K. Saruwatari, T. Kogure and Yoshihiro Shiraiwa
    • Journal Title

      Marine Biotechnology

      Volume: 13 Pages: 83-92

    • DOI

      doi:10.1007/s10126-010-9272-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallographic variability and uniformity in Cretaceous heterococcoliths2011

    • Author(s)
      Saruwatari, K., Y. Tanaka, H. Nagasawa, and T. Kogure
    • Journal Title

      Eur. J. Mineral

      Volume: 23 Pages: 519-528

    • DOI

      doi:10.1127/0935-1221/2011/0023-2129

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Glycolytic intermediates induce amorphous calcium carbonate formation in crustaceans2011

    • Author(s)
      Ai Sato
    • Journal Title

      Nature Chem. Biol.

      Volume: 7 Pages: 197-199

    • DOI

      10.1038/NCHEB10.532

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Morphological and crystallographic transformation from immature to mature coccoliths, Pleurochrysis carterae2011

    • Author(s)
      Kazuko Saruwatari
    • Journal Title

      Mar. Biotechnol.

      Volume: 13 Pages: 801-809

    • DOI

      10.1007/s10126-010-9342-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microstructures of the larval shell of a pearl oyster, Pinctada fucata, investigated by FIB-TEM technique2011

    • Author(s)
      Naoki Yokoo
    • Journal Title

      Amer. Mineral.

      Volume: 96 Pages: 1020-1027

    • DOI

      10.2138/am.2011.3657

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification and characterization of a calcium-carbonate binding protein, blue mussel shell protein (BMSP), from the nacreous layer2011

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Journal Title

      ChemBioChem.

      Volume: 12 Pages: 2478-2487

    • DOI

      10.1002/cbic.20110037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Localization of Intracrystalline Organic Macromolecules in Mollusk Shells2011

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Journal Title

      J. Cryst. Growth

      Volume: 337 Pages: 24-29

    • DOI

      10.1016/j.jcrysgro.2011.10.013

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Formation of aragonite crystals in the crossed lamellar microstructure of limpet shells2011

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Journal Title

      Cryst. Growth Des.

      Volume: 11 Pages: 4850-4859

    • DOI

      10.1021/cg2010997

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallographic characterization of the crossed lamellar structure in the bivalve Meretrix lamarckii using electron beam techniques2011

    • Author(s)
      Akiko Hayashi
    • Journal Title

      J. Struct. Biol.

      Volume: 176 Pages: 91-96

    • DOI

      10.1016/j.jsb.2011.06.11

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 円石藻Pleurochrysis carteraeのココリスに含まれる基質タンパク質に関する研究2012

    • Author(s)
      遠藤博寿
    • Organizer
      2011年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学、京都
    • Year and Date
      20120322-20120326
  • [Presentation] アメリカザリガニの害骨格に含まれるキチンに強固に結合しているタンパク質の構造・機能解析2012

    • Author(s)
      鈴木道生
    • Organizer
      2011年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学、京都
    • Year and Date
      20120322-20120326
  • [Presentation] アコヤガイ真珠層由来の基質タンパク質Pif 80におけるアラゴナイト結合部位の探索2012

    • Author(s)
      三木 匠
    • Organizer
      2011年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学、京都
    • Year and Date
      20120322-20120326
  • [Presentation] アコヤガイの殻皮タンパク質の分子生物学的解析2012

    • Author(s)
      中山誠志
    • Organizer
      2011年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学、京都
    • Year and Date
      20120322-20120326
  • [Presentation] 造礁サンゴの骨格タンパク質galaxin由来の組換えタンパク質を用いた機能解析2012

    • Author(s)
      川崎麻哉子
    • Organizer
      2011年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学、京都
    • Year and Date
      20120322-20120326
  • [Presentation] 水棲生物の石灰化を制御する有機基質の構造と機能に関する研究2012

    • Author(s)
      長澤寛道
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部大会
    • Place of Presentation
      筑波大学、茨城
    • Year and Date
      20120121-20120121
    • Invited
  • [Presentation] 生物由来のアラゴナイト結晶における{110}双晶密度の定量解析2011

    • Author(s)
      鈴木道生
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] カサガイ交差板構造のアラゴナイト結晶形成に関する研究2011

    • Author(s)
      鈴木道生
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] Lymnaea stagnalis, Notoacmea fuscoviridisにおける幼生貝殻微細構造2011

    • Author(s)
      横尾直樹
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] 結晶内有機高分子による生体由来カルサイト微細構造の変化2011

    • Author(s)
      奥村大河
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] 陸生甲殻類オカダンゴムシ外骨格の形成機構2011

    • Author(s)
      磯部雅子
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] Characterization of calcite formed in microbial mats in a hot spring2011

    • Author(s)
      Hye-jin Kim
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] 造礁サンゴの骨格タンパク質galaxin由来の組換えタンパク質の作製と機能解析2011

    • Author(s)
      川崎麻哉子
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] アコヤガイPinctada fucataの殻皮タンパク質の分子生物学的解析2011

    • Author(s)
      中山誠志
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] 円石藻Pleurochrysis carteraeにおけるココリス形成の分子生物学的解析2011

    • Author(s)
      遠藤博寿
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] アコヤガイ真珠層由来基質タンパク質Pif 80におけるアラゴナイト結合部位の探索2011

    • Author(s)
      三木 匠
    • Organizer
      第6回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂、東京
    • Year and Date
      20111203-20111203
  • [Presentation] Mechanism of nacreous layer formation in mollusk shells: structure and function of organic matrices2011

    • Author(s)
      Hiromichi Nagasawa
    • Organizer
      The International Symposium on Pearl Research
    • Place of Presentation
      The University of Tokyo, Tokyo
    • Year and Date
      20111004-20111006
    • Invited
  • [Presentation] Distribution and role of intracrystalline organic macromolecules in molluscan shells2011

    • Author(s)
      Toshiro Kogure
    • Organizer
      The International Symposium on Pearl Research
    • Place of Presentation
      The University of Tokyo, Tokyo
    • Year and Date
      20111004-20111006
    • Invited
  • [Presentation] A search for the critical domain for aragonite binding in Pif 80, a matrix protein of nacreous layer of Pinctada fucata2011

    • Author(s)
      Takumi Miki
    • Organizer
      The International Symposium on Pearl Research
    • Place of Presentation
      The University of Tokyo, Tokyo
    • Year and Date
      20111004-20111006
  • [Presentation] A search for periostracum-specific proteins in the pearl oyster Pinctada fucata2011

    • Author(s)
      Seiji Nakayama
    • Organizer
      The International Symposium on Pearl Research
    • Place of Presentation
      The University of Tokyo, Tokyo
    • Year and Date
      20111004-20111006
  • [Presentation] Identification and characterization of a calcium-carbonate binding protein, blue mussel shell protein (BMSP), from the nacreous layer2011

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Organizer
      The International Symposium on Pearl Research
    • Place of Presentation
      The University of Tokyo, Tokyo
    • Year and Date
      20111004-20111006
  • [Presentation] アコヤガイ幼生貝殻における炭酸カルシウム相について2011

    • Author(s)
      横尾直樹
    • Organizer
      日本地質学会第118年学術大会・日本鉱物科学会2011年年会合同学術大会
    • Place of Presentation
      茨城大学水戸キャンパス、茨城
    • Year and Date
      20110909-20110911
  • [Presentation] Superstructure in sulfur-containing calcite in a travertine carbonate rock2011

    • Author(s)
      Hye-jin Kim
    • Organizer
      日本地質学会第118年学術大会・日本鉱物科学会2011年年会合同学術大会
    • Place of Presentation
      茨城大学水戸キャンパス、茨城
    • Year and Date
      20110909-20110911
  • [Presentation] 貝殻に見る炭酸カルシウム-生体高分子ハイブリッド構造2011

    • Author(s)
      小暮敏博
    • Organizer
      日本セラミックス協会第24回秋期シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌
    • Year and Date
      20110907-20110907
    • Invited
  • [Presentation] The Formation Mechanism of Aragonite Crystals in the Crossed Lamellar Structure of Limpets2011

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Organizer
      11th International Symposium on Biomineralization
    • Place of Presentation
      Noosa Sheraton Hotel, Queensland, Australia
    • Year and Date
      20110710-20110714
  • [Presentation] Isolation and Expression Analysis of Two Coccoltih Matrix Proteins of Pleurochrysis carterae2011

    • Author(s)
      Hirotoshi Endo
    • Organizer
      11th International Symposium on Biomineralization
    • Place of Presentation
      Noosa Sheraton Hotel, Queensland, Australia
    • Year and Date
      20110710-20110714
  • [Presentation] Effect of Intracrystalline Organic Macromolecules on the Fine Structure and Mechanical Properties of Biogenic Calcite2011

    • Author(s)
      Taiga Okumura
    • Organizer
      11th International Symposium on Biomineralization
    • Place of Presentation
      Noosa Sheraton Hotel, Queensland, Australia
    • Year and Date
      20110710-20110714
  • [Presentation] Microstructures of the Larval Shell of a Pearl Oyster, Pinctada fucata, Investigated by FIB-TEM Technique2011

    • Author(s)
      Naoki Yokoo
    • Organizer
      11th International Symposium on Biomineralization
    • Place of Presentation
      Noosa Sheraton Hotel, Queensland, Australia
    • Year and Date
      20110710-20110714
  • [Presentation] 造礁サンゴの骨格タンパク質galaxinの組換えタンパク質の作製と機能解析2011

    • Author(s)
      川崎麻哉子
    • Organizer
      第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県コンベンションアーツセンター、静岡
    • Year and Date
      20110528-20110529
  • [Presentation] キンギョの鱗の新規基質タンパク質GSP-37の機能・局在解析2011

    • Author(s)
      宮部耕成
    • Organizer
      第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県コンベンションアーツセンター、静岡
    • Year and Date
      20110528-20110529
  • [Presentation] アコヤガイ殻皮に特異的なタンパク質の探索2011

    • Author(s)
      中山誠志
    • Organizer
      第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県コンベンションアーツセンター、静岡
    • Year and Date
      20110528-20110529
  • [Presentation] バイオミネラルにおける結晶内有機高分子に制御された微細構造と機械的性質2011

    • Author(s)
      奥村大河
    • Organizer
      第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県コンベンションアーツセンター、静岡
    • Year and Date
      20110528-20110529
  • [Presentation] 陸生甲殻類オカダンゴムシにおける非晶質炭酸カルシウムの構造と成因2011

    • Author(s)
      磯部雅子
    • Organizer
      第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県コンベンションアーツセンター、静岡
    • Year and Date
      20110528-20110529
  • [Presentation] STEM-HAADFトモグラフィーによる軟体動物貝殻における結晶内有機高分子の可視化2011

    • Author(s)
      奥村大河
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第67回学術講演会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20110516-20110516
  • [Presentation] FIB-TEMを用いたアコヤガイPinctada fucata幼生の貝殻の観察2011

    • Author(s)
      横尾直樹
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第67回学術講演会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20110516-20110516
  • [Book] Molecular Biomineralization: Aquatic Organisms Forming Extraordinary Materials2011

    • Author(s)
      Hiromichi Nagasawa
    • Total Pages
      403
    • Publisher
      Springer-Verlag
  • [Book] 脱皮・変態の生物学-昆虫と甲殻類のホルモン作用の謎を追う2011

    • Author(s)
      長澤寛道
    • Total Pages
      497
    • Publisher
      東海大学出版会

URL: 

Published: 2014-07-24  

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