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2012 Fiscal Year Annual Research Report

地球環境保全を目指した海洋生物における石灰化の制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22228006
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

長澤 寛道  東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (60134508)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小暮 敏博  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (50282728)
Project Period (FY) 2010-05-31 – 2013-03-31
Keywords海洋生物 / 石灰化 / 地球環境保全 / 有機無機相互作用 / 結晶多形 / 基質タンパク質 / バイオミネラリゼーション / その場観察
Research Abstract

本年度は最終年度であり、これまでの研究を継続するとともに、まとめを行った。
材料として、軟体動物の貝殻、円石藻のココリス、魚類の鱗、サンゴの骨格を用い、それぞれの材料における有機基質の構造機能解析を通して石灰化のメカニズムを解明することを目指した。新規の基質タンパク質として、アザミサンゴの骨格から1種の不溶性タンパク質を得た。また、すでに得られていたアコヤガイ真珠層のタンパク質Pif 80についてはアラゴナイト結合に寄与している部分配列を推定できた。また稜柱層の有機基質の3次元分布を明らかにした。キンギョの鱗の基質タンパク質GSP-37については組織内分布を明らかにするとともに、同じ石灰化組織である骨や歯にも発現していることを明らかにした。将来骨の研究に役立つ成果と考えられる。アザミサンゴの基質タンパク質であるgalaxinを大腸菌発現系を用いて組換え体を調製し、これが炭酸カルシウム結晶やキチンに結合能を示したことから石灰化に重要な役割を有することが推定された。
さらに、挑戦的な試みとして、円石藻に対する遺伝子導入方法の開発、アコヤガイ外套膜のin vitro培養下での石灰化、アザミサンゴから新規不溶性有機基質の同定、および結晶多形に関する実験を行った。円石藻のココリスの有機基板からすでにCSAP-2と名付けたタンパク質を得ているが、このタンパク質の機能を知るためにRNA干渉を試み、世界に先駆けてその方法をほぼ確立することができた。また、真珠養殖産業で最も鍵となる真珠袋の形成と石灰化のメカニズムの解明を目指して外套膜のin vitro培養で解析できないか試行錯誤したが、今のところ石灰化は成功していない。
これまで、さまざまな生物の石灰化組織に含まれる有機基質の重要性を明らかにしてきたが、有機基質の分布と機能を基に分類したこれまでの共通モデルを微修正し、より良いモデルを提案した。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (36 results)

All 2013 2012

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (24 results) (of which Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Initial formation of calcite crystals in the thin prismatic layer with the periostracum of Pinctada fucata2013

    • Author(s)
      M. Suzuki, S. Nakayama, H. Nagasawa and T. Kogure
    • Journal Title

      Micron

      Volume: 45 Pages: 136-139

    • DOI

      doi:10.1016/j.micron.2012.10.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Localization and Associative Strength of Acid Polysaccharides in Coccoliths of Pleurochrysis haptonemofera (Haptophyta) Predicted from Their Extractability from Partially Decalcified Coccoliths2013

    • Author(s)
      Yasutaka Hirokawa
    • Journal Title

      Open Journal of Marine Science

      Volume: 3 Pages: 48-54

    • DOI

      10.4236/ojms.2013.31005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The diversity of shell matrix proteins: genome-wide investigation of the pearl oyster Pinctada fucata2013

    • Author(s)
      Hiroshi Miyamoto
    • Journal Title

      Zoological Science

      Volume: 30 Pages: in press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molluskan shell structure and its formation mechanism2013

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Journal Title

      Can.J. Zool.

      Volume: 91 Pages: in press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microstructural variation of biogenic calcite with intracrystalline organic macromolecules2012

    • Author(s)
      T. Okumura, M. Suzuki, H. Nagasawa and T. Kogure
    • Journal Title

      Cryst. Growth Des

      Volume: 12 Pages: 224-230

    • DOI

      doi:10.1021/cg200947c

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A draft genome of the pearl oyster Pinctada fucata to provide a platform for understanding bivalve biology2012

    • Author(s)
      T. Takeuchi, T. Kawashima
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 19 Pages: 117-130

    • DOI

      doi:10.1093/dnares/dss005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quantitative XRD analysis of {110} twin density in biotic aragonites2012

    • Author(s)
      M. Suzuki, H. Kim, H. Mukai, H.Nagasawa and T. Kogure
    • Journal Title

      J. Struct. Biol

      Volume: 180 Pages: 458-468

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.jsb.2012.09.004

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The characterization of CaCO3 in a geothermal environment: A SEM/TEM-EELS study2012

    • Author(s)
      J.-W. Kim, T. Kogure, Y. Kiho, S.-T.Kim, Y.-N. Jang, H.-S. Baik and G. Geesey
    • Journal Title

      Clays Clay Miner

      Volume: 60 Pages: 484-495

    • DOI

      doi:10.1346/CCMN.2012.0600505

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The molecular evolution of the Pif family proteins in various species of mollusks2012

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Journal Title

      Mar. Biotechnol.

      Volume: 15 Pages: 145-155

    • DOI

      10.1007/s10126-012-9471

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GSP-37, a novel goldfish scale matrix protein: identification, localization and functional analysis2012

    • Author(s)
      Kousei Miyabe
    • Journal Title

      Faraday Discussions

      Volume: 159 Pages: 463-481

    • DOI

      10.1039/c2fd20051a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and functional analyses of a strongly chitin-binding protein-1 (SCBP-1) from the exoskeleton of the crayfish, Procambarus clarkii2012

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 77 Pages: 361-368

    • DOI

      10.1271/bbb.120787

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] キンギョの鱗におけるGSP-37の発現解析2013

    • Author(s)
      飯村九林
    • Organizer
      平成25年度日本水産学会春季大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学品川キャンパス、東京
    • Year and Date
      20130326-20130330
  • [Presentation] 円石藻Pleurochrysis carteraeにおけるRNAi法の確立2013

    • Author(s)
      遠藤博寿
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス、仙台
    • Year and Date
      20130324-20130327
  • [Presentation] アコヤガイ靭帯部に存在する低分子ペプチド(LICP)の構造・機能解析2013

    • Author(s)
      鈴木道生
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス、仙台
    • Year and Date
      20130324-20130327
  • [Presentation] 有機・無機ハイブリッド構造を持つ貝殻真珠層の形成に関与する基質タンパク質の機能と分子進化2013

    • Author(s)
      鈴木道生
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス、仙台
    • Year and Date
      20130324-20130327
    • Invited
  • [Presentation] バイオミネラリゼーション研究20 年2012

    • Author(s)
      長澤寛道
    • Organizer
      第7回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール、東京
    • Year and Date
      20121201-20121201
    • Invited
  • [Presentation] X線回折を用いた軟体動物貝殻を構成するあられ石中の{110}双晶密度評価2012

    • Author(s)
      小暮敏博
    • Organizer
      第7回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール、東京
    • Year and Date
      20121201-20121201
  • [Presentation] 魚鱗における基質タンパク質GSP37の発現解析2012

    • Author(s)
      飯村九林
    • Organizer
      第7回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール、東京
    • Year and Date
      20121201-20121201
  • [Presentation] 貝殻真珠層特異的基質タンパク質Pifの分子進化2012

    • Author(s)
      鈴木道生
    • Organizer
      第7回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール、東京
    • Year and Date
      20121201-20121201
  • [Presentation] 陸生甲殻類オカダンゴムシにおける殻形成プロセス2012

    • Author(s)
      横尾直樹
    • Organizer
      第7回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール、東京
    • Year and Date
      20121201-20121201
  • [Presentation] 貝殻中に存在する結晶内有機高分子による方解石の結晶成長制御2012

    • Author(s)
      奥村大河
    • Organizer
      第7回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール、東京
    • Year and Date
      20121201-20121201
  • [Presentation] 硫酸含有炭酸カルシウム結晶の合成および天然結晶との比較2012

    • Author(s)
      金惠眞
    • Organizer
      第7回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール、東京
    • Year and Date
      20121201-20121201
  • [Presentation] 硫酸イオンを含有する方解石の合成実験2012

    • Author(s)
      金惠眞
    • Organizer
      日本鉱物科学会2012年年会学術大会
    • Place of Presentation
      京都大学、京都
    • Year and Date
      20120919-20120921
  • [Presentation] Study on the formation mechanism of the aragonite crystals in the crossed lamellar microstructure of limpet shells2012

    • Author(s)
      Michio Suzuki
    • Organizer
      Gordon Research Conference (Biomineralization) 2012
    • Place of Presentation
      Colby-Sawyer College, New London, NH, USA
    • Year and Date
      20120812-20120817
  • [Presentation] Molecular analysis of coccoltih matrix proteins of Pleurochrysis carterae2012

    • Author(s)
      Hirotoshi Endo
    • Organizer
      Gordon Research Conference (Biomineralization) 2012
    • Place of Presentation
      Colby-Sawyer College, New London, NH, USA
    • Year and Date
      20120812-20120817
  • [Presentation] Structural control of calcite crystal growth by intracrystalline organic macromolecules in mollusk shells2012

    • Author(s)
      Taiga Okumura
    • Organizer
      Gordon Research Conference (Biomineralization) 2012
    • Place of Presentation
      Colby-Sawyer College, New London, NH, USA
    • Year and Date
      20120812-20120817
  • [Presentation] GSP-37, a novel goldfish scale matrix protein: identification, localization and functional analysis2012

    • Author(s)
      Hiromichi Nagasawa
    • Organizer
      Faraday Discussion
    • Place of Presentation
      Metropolitan University, Leads, UK
    • Year and Date
      20120723-20120725
    • Invited
  • [Presentation] Analysis of the GSP-37 Expression during the Scale Regeneration in Goldfish2012

    • Author(s)
      Hiromichi Nagasawa
    • Organizer
      The 9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
    • Place of Presentation
      Kochi city culture-plaza cul-port, Kochi, Japan
    • Year and Date
      20120713-20120716
  • [Presentation] Recombinant expression and functional analysis of Galaxin, a coral skeletal matrix protein2012

    • Author(s)
      Hiromichi Nagasawa
    • Organizer
      The 9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
    • Place of Presentation
      Kochi city culture-plaza cul-port, Kochi, Japan
    • Year and Date
      20120713-20120716
  • [Presentation] Crystallographic analyses of exoskeletal calcium carbonate in terrestrial isopod, Armadillidium vulgare2012

    • Author(s)
      Toshihiro Kogure
    • Organizer
      The 9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
    • Place of Presentation
      Kochi city culture-plaza cul-port, Kochi, Japan
    • Year and Date
      20120713-20120716
  • [Presentation] アコヤガイの真珠層形成に関与する基質タンパク質Pifの構造・機能解析2012

    • Author(s)
      鈴木道生
    • Organizer
      第12回 東京大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館、東京
    • Year and Date
      20120630-20120630
  • [Presentation] バイオミネラリゼーションを制御する有機基質―アコヤガイの真珠層形成を司る基質タンパク質Pifの構造・機能解析―2012

    • Author(s)
      鈴木道生
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合 2012年度連合大会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ、千葉
    • Year and Date
      20120520-20120525
    • Invited
  • [Presentation] 温泉炭酸塩岩中のイオウ含有方解石の結晶学的評価2012

    • Author(s)
      金惠眞
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合2012年大会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ、千葉
    • Year and Date
      20120520-20120525
  • [Presentation] 陸生甲殻類オカダンゴムシの外骨格における炭酸カルシウムの結晶学的解析2012

    • Author(s)
      横尾直樹
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合2012年大会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ、千葉
    • Year and Date
      20120520-20120525
  • [Presentation] 貝殻の方解石中に存在する有機高分子の結晶成長への影響2012

    • Author(s)
      奥村大河
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合2012年大会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ、千葉
    • Year and Date
      20120520-20120525
  • [Book] Recent Advances in Pearl Rsearch2013

    • Author(s)
      Hiromichi Nagasawa
    • Total Pages
      276
    • Publisher
      Terrapub

URL: 

Published: 2014-07-24  

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