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2013 Fiscal Year Annual Research Report

制限ナノ空間における量子・分子流動ダイナミクスの学理構築

Research Project

Project/Area Number 22246022
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

川野 聡恭  大阪大学, 基礎工学研究科, 教授 (00250837)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 土井 謙太郎  大阪大学, 基礎工学研究科, 准教授 (20378798)
花崎 逸雄  大阪大学, 基礎工学研究科, 助教 (10446734)
辻 徹郎  大阪大学, 基礎工学研究科, 助教 (00708670)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
Keywords分子流体工学 / マイクロ・ナノデバイス / 制限ナノ空間 / 量子・分子流動ダイナミクス / 表面・界面
Research Abstract

本研究は,制限ナノ空間における溶媒および溶質分子の高次構造,流動性および電気特性の高速・高精度解析を目指し,量子分子流動ダイナミクスに基づく新しい数理体系の構築とその応用技術を探索することを目的としている.
平成24度までに,制限ナノ空間における分子や微粒子の電気計測および可視化観察を行うための実験環境を整えてきており,具体的な計測結果が得られるようになった.一方で,理論的枠組みについても,分子流体力学の観点から独自の数理モデルを展開し,実測データとの比較を行う準備を進めてきた.
平成25年度は,さらに,電解質溶液中の電場とイオンの濃度場およびそこでの荷電粒子や分子の振る舞いについて調べ,現象の時間空間スケールについて議論することを可能とした.電極に電圧を印加した直後に溶液中には一様電場が印加されるが,それを遮蔽するようにイオンが流動し始める.この事実は,これまでにも知られていることであるが,ナノメートルスケールからミリメートルスケールで見られる現象を同一の理論モデルで扱えることを示した.溶液中における電解質イオンの振る舞いに加え,そのような場を泳動するDNA分子の運動についても考察した.流路中にナノワイヤーのような障害物を配置することにより,そこを通過するDNAは抵抗を受けて速度が低下するとともに,その凝集構造が伸長することを蛍光観察により示した.このことについて,分子動力学シミュレーションによる解析においても同様の傾向が示された.電気泳動する長鎖高分子の速度制御に関して,ナノ構造の障害物や壁面との摩擦または電気浸透流による逆向きの溶媒の流れを利用することが提案されているが,このような未知の分野に関してもこれまでの成果に基づき引き続き研究を進める予定である.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初の研究計画の中で,本年度は,電解質溶液中で局所的に電気的中性条件の破れた場における非定常イオン流動問題を扱うことを課題の一つとしていた.この点について,いくつかの系に関して実験と理論の両面からアプローチすることができている.ナノ流路デバイスにおけるイオン流動現象を明らかにするために,電解質溶液中の微小電流を計測し,その過渡応答から現象の時空間スケールを明らかにすることが可能となった.ナノアンペアオーダの電流信号には,溶液中における電解質イオンの流動に関する情報が多分に含まれており,電極表面を遮蔽しながら拡散と電気泳動により移動するイオンの振る舞いが理論的に説明された.本成果は,溶液中におけるイオン流動をさらに詳細に議論することを可能とするとともに,デバイスを最適化するための設計指針を与えることにつながるものである.また,電極表面と帯電した分子の相互作用により吸着する分子の振る舞いを調べた.グラファイト表面で帯電したDNAが自己集合化する過程を原子間力顕微鏡により観察し,吸着・脱離と拡散による構造緩和過程を分子動力学シミュレーションと反応拡散モデルにより解析した.その結果,静電相互作用による瞬時の吸着が起こった後に拡散により系が緩和することが示された.以上のことより,電解質溶液を含む様々な系に見られるイオンや電荷を帯びた分子の応答に関して,同様のメカニズムで現象が説明されることを見出した.さらに,細孔を通過する電気浸透流を観察するための実験系を構築し,予備実験の段階ではあるが,その可視化に成功している.引き続き,本実験を行うことにより,その詳細が明らかにされると期待される.

Strategy for Future Research Activity

これまでに,制限ナノ空間における非定常イオン流動現象の計測と理論モデルによる理解が進められてきており,学術的深化が推進されている.本年度は,研究計画の最終年度に当たることから,これまでの成果の集大成を図るとともに,残る課題を明確化し,引き続き研究の方向性を示す.また,研究成果については積極的に原著論文として出版し,国内外の専門会議にて発表することはもちろんのこと,さらに,その技術を発展させて社会に還元するため,工学的応用についても重視しながら新奇デバイスの提案を視野に入れた展開を試みる.

  • Research Products

    (46 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (15 results) (of which Peer Reviewed: 15 results) Presentation (27 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] Experimental Study of Vibration of Prototype Auditory Membrane2014

    • Author(s)
      Harto TANUJAYA and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      Applied Mechanics and Materials

      Volume: 493 Pages: 372-377

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nonequilibrium Ionic Response of Biased Mechanically Controllable Break Junction (MCBJ) Electrodes2014

    • Author(s)
      Kentaro DOI, Makusu TSUTSUI, Takahito OHSHIRO, Chih-Chun CHIEN, Michael ZWOLAK, Masateru TANIGUCHI, Tomoji KAWAI, Satoyuki KAWANO, and Massimiliano Di VENTRA
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry C

      Volume: 118 Pages: 3758-3765

    • DOI

      10.1021/jp409798t

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Measurement of Local Electric Field in Microdevices for Low-Voltage Electroporation of Adherent Cells2014

    • Author(s)
      Hirofumi SHINTAKU, Kazumi HAKAMADA, Hiroshi FUJIMOTO, Takeshi NAGATA, Jun MIYAKE, and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      Microsystem Technologies

      Volume: 20 Pages: 303-313

    • DOI

      10.1007/s00542-013-1797-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Statistical Characterisation of Single-stranded DNA Motion near Glass Surface beyond Diffusion Coefficient2014

    • Author(s)
      Satoshi UEHARA, Itsuo HANASAKI, Yoshiyuki ARAI, Takeharu NAGAI, and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      Micro & Nano Letters

      Volume: E-First articles Pages: 1-4

    • DOI

      10.1049/mnl.2013.0668

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA Manipulation and Separation in Sublithographic-Scale Nanowire Array2013

    • Author(s)
      Takao YASUI, Sakon RAHONG, Koki MOTOYAMA, Takeshi YANAGIDA, Qiong WU, Noritada KAJI, Masaki KANAI, Kentaro DOI, Kazuki NAGASHIMA, Masanobu TOKESHI, Masateru TANIGUCHI, Satoyuki KAWANO, Tomoji KAWAI, and Yoshinobu BABA
    • Journal Title

      ACS Nano

      Volume: 7 Pages: 3029-3035

    • DOI

      10.1021/nn4002424

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electrically Evoked Auditory Brainstem Response by Using Bionic Auditory Membrane in Guinea Pigs2013

    • Author(s)
      Hirofumi SHINTAKU, Takatoshi INAOKA, Takayuki NAKAGAWA, Satoyuki KAWANO, and Juichi ITO
    • Journal Title

      Journal of Biomechanical Science and Engineering

      Volume: 8 Pages: 198-208

    • DOI

      10.1299/jbse.8.198

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theoretical Study on Physicochemical Aspects of Single Molecular Junction: Application to the Bases of ssDNA2013

    • Author(s)
      Pawel SZAREK, Sawanya SUWANNAWONG, Kentaro DOI, and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry C

      Volume: 117 Pages: 10809-10817

    • DOI

      10.1021/jp402414n

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tracking Single-Particle Dynamics via Combined Optical and Electrical Sensing2013

    • Author(s)
      Naoya YUKIMOTO, Makusu TSUTSUI, Yuhui HE, Hirofumi SHINTAKU, Shoji TANAKA, Satoyuki KAWANO, Tomoji KAWAI, and Masateru TANIGUCHI
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 3 Pages: 1-7

    • DOI

      10.1038/srep01855

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fluid Dynamics and Electrical Detection of λDNA in Electrode-Embedded Nanochannels2013

    • Author(s)
      Satoshi UEHARA, Makusu TSUTSUI, Kentaro DOI, Masateru TANIGUCHI, Satoyuki KAWANO, and Tomoji KAWAI
    • Journal Title

      Journal of Biomechanical Science and Engineering

      Volume: 8 Pages: 244-256

    • DOI

      10.1299/jbse.8.244

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Trapping and Identifying Single-Nanoparticles Using a Low-Aspect-Ratio Nanopore2013

    • Author(s)
      Makusu TSUTSUI, Yoichi MAEDA, Yuhui HE, Sadato HONGO, Sou RYUZAKI, Satoyuki KAWANO, Tomoji KAWAI, and Masateru TANIGUCHI
    • Journal Title

      Applied Physics Letters

      Volume: 103 Pages: 013108 (5pp)

    • DOI

      10.1063/1.4813084

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Self-Assembly of 50 bp poly(dA)・poly(dT) DNA on Highly Oriented Pyrolytic Graphite via Atomic Force Microscopy Observation and Molecular Dynamics Simulation2013

    • Author(s)
      Kentaro DOI, Hiroshi TAKEUCHI, Ryosuke NII, Shingo AKAMATSU, Toshiya KAKIZAKI, and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics

      Volume: 139 Pages: 085102 (9pp)

    • DOI

      10.1063/1.4818595

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of Bacterial Motility from Non-Gaussianity of Finite-Sample Trajectories Using the Large Deviation Principle2013

    • Author(s)
      Itsuo HANASAKI and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      Journal of Physics: Condensed Matter

      Volume: 25 Pages: 465103 (9pp)

    • DOI

      10.1088/0953-8984/25/46/465103

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Wide-Range Frequency Selectivity in an Acoustic Sensor Fabricated Using a Microbeam Array with Non-Uniform Thickness2013

    • Author(s)
      Hirofumi SHINTAKU, Takayuki KOBAYASHI, Kazuki ZUSHO, Hidetoshi KOTERA, and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      Journal of Micromechanics and Microengineering

      Volume: 23 Pages: 115014 (7pp)

    • DOI

      10.1088/0960-1317/23/11/115014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Hardware Model of the Auditory Periphery to Transduce Acoustic Signals into Neural Activity2013

    • Author(s)
      Takashi TATENO, Jun NISHIKAWA, Nobuyoshi TSUCHIOKA, Hirofumi SHINTAKU, and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      Frontiers in Neuroengineering

      Volume: 6 Pages: 1-14

    • DOI

      10.3389/fneng.2013.00012

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Experimental and Analytical Study Approach of Artificial Basilar Membrane Prototype (ABMP)2013

    • Author(s)
      Harto TANUJAYA, Hirofumi SHINTAKU, Dai KITAGAWA, Adianto, Susilodinata, and Satoyuki KAWANO
    • Journal Title

      J. Eng. Technol. Sci.

      Volume: 45 Pages: 61-72

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 対称性を有する表面におけるパターン形成の反応拡散モデル2014

    • Author(s)
      土井謙太郎,新居良介,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会関西支部第89期定時総会講演会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
    • Year and Date
      20140318-20140319
  • [Presentation] 重力と非一様な壁面温度分布により誘起される半無限空間の定常自由分子流2014

    • Author(s)
      甲藤雄大,辻徹郎,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会 関西学生会学生員卒業研究発表講演会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
    • Year and Date
      20140317-20140317
  • [Presentation] ボルツマン方程式における分子無秩序の仮定に対する数値的検証2014

    • Author(s)
      白井真人,辻徹郎,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会 関西学生会学生員卒業研究発表講演会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
    • Year and Date
      20140317-20140317
  • [Presentation] 微粒子の拡散特性に及ぼす周囲流体分子との質量比の影響2014

    • Author(s)
      名倉諒,花﨑逸雄,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会 関西学生会学生員卒業研究発表講演会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
    • Year and Date
      20140317-20140317
  • [Presentation] 原子間力場に基づく単鎖DNA分子内塩基間相互作用の粗視化2014

    • Author(s)
      松岡慎也,花﨑逸雄,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会 関西学生会学生員卒業研究発表講演会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
    • Year and Date
      20140317-20140317
  • [Presentation] アルミナナノポアを用いた単一粒子トラップ2014

    • Author(s)
      山城拓也,筒井真楠,土井謙太郎,谷口正輝,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会 関西学生会学生員卒業研究発表講演会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
    • Year and Date
      20140317-20140317
  • [Presentation] 短い単鎖DNAの拡散に関する分子サイズ依存性の検討2014

    • Author(s)
      渡邉俊,花﨑逸雄,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会 関西学生会学生員卒業研究発表講演会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
    • Year and Date
      20140317-20140317
  • [Presentation] 非一様電場存在下のイオン流動に関する数値解析2014

    • Author(s)
      岩口尭史,土井謙太郎,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会 関西学生会学生員卒業研究発表講演会
    • Place of Presentation
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス
    • Year and Date
      20140317-20140317
  • [Presentation] Prediction and Experimental Validation of Electrophoretic Transport of Lambda DNA in Nano-Slit2014

    • Author(s)
      Satoshi UEHARA, Kentaro DOI, and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      ASME 2014 3rd Global Congress on NanoEngineering for Medicine and Biology (NEMB 2014)
    • Place of Presentation
      San Francisco, CA, U.S.A.
    • Year and Date
      20140202-20140205
  • [Presentation] Langevin Dynamics Simulation of Single-Stranded DNA Translocation though Nanopore in External Non-Uniform Electric Field2013

    • Author(s)
      Weixin QIAN, Kentaro DOI, and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      The 15th International Conference on Biomedical Engineering
    • Place of Presentation
      National University of Singapore, Singapore
    • Year and Date
      20131204-20131207
  • [Presentation] Fractal Dimension of Self-Assembled 50 bp Poly(dA)・Poly(dT) DNA on HOPG Surface2013

    • Author(s)
      Ryosuke NII, Hiroshi TAKEUCHI, Kentaro DOI, and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      The 15th International Conference on Biomedical Engineering
    • Place of Presentation
      National University of Singapore, Singapore
    • Year and Date
      20131204-20131207
  • [Presentation] Theoretical Study of Non-Equilibrium Ionic Response near Electrode Surface2013

    • Author(s)
      Kentaro DOI, Makusu TSUTSUI, Takahito OHSHIRO, Masateru TANIGUCHI, Tomoji KAWAI, Massimiliano DI VENTRA, and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      The 15th International Conference on Biomedical Engineering
    • Place of Presentation
      National University of Singapore, Singapore
    • Year and Date
      20131204-20131207
  • [Presentation] Detections of Fast Single-Particle Translocation through a Micro-Fluidic Channel via Combined Optical and Electrical Sensing2013

    • Author(s)
      Shoji TANAKA, Makusu TSUTSUI, Kentaro DOI, Satoyuki KAWANO, Tomoji KAWAI, and Masateru TANIGUCHI
    • Organizer
      The 2013 MRS Fall Meeting and Exhibit
    • Place of Presentation
      Boston, Massachusetts, U.S.A.
    • Year and Date
      20131201-20131206
  • [Presentation] Dynamics and Self-Assembled Pattern Formation of Short DNA Fragments2013

    • Author(s)
      Kentaro DOI, Ryosuke NII, Hiroshi TAKEUCHI, and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      Tenth International Conference on Flow Dynamics
    • Place of Presentation
      Sendai, Japan
    • Year and Date
      20131125-20131127
  • [Presentation] Computational Fluid Dynamics Modeling of Micro-Vibrating Flow Pumps2013

    • Author(s)
      Osman Omran OSMAN and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      Tenth International Conference on Flow Dynamics
    • Place of Presentation
      Sendai, Japan
    • Year and Date
      20131125-20131127
  • [Presentation] Poly(dA)・Poly(dT)DNA断片による自己集合化ネットワーク形成のダイナミクス2013

    • Author(s)
      土井謙太郎,新居良介,竹内博,松岡理人,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会 第91期 流体工学部門講演会
    • Place of Presentation
      九州大学伊都キャンパス
    • Year and Date
      20131109-20131110
  • [Presentation] 水溶液中の高分子の熱揺らぎに関する大偏差数値解析2013

    • Author(s)
      花崎逸雄,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会第5回マイクロ・ナノ工学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台国際センター
    • Year and Date
      20131105-20131107
  • [Presentation] Controlling Particle Position Using a Nanopore Trapping Method2013

    • Author(s)
      Yoichi MAEDA, Makusu TSUTSUI, Kentaro DOI, Satoyuki KAWANO, Tomoji KAWAI, and Masateru TANIGUCHI
    • Organizer
      The 17th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (Micro-TAS 2013)
    • Place of Presentation
      Freiburg, Germany
    • Year and Date
      20131027-20131031
  • [Presentation] Ab Initio Approach to Current-Voltage Characteristics of DNA Base Molecules2013

    • Author(s)
      Sawanya SUWANNAWONG, Pawel SZAREK, Kentaro DOI, and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      The 4th TSME International Conference on Mechanical Engineering
    • Place of Presentation
      Pattara, Chonburi, Thailand
    • Year and Date
      20131016-20131018
  • [Presentation] Theoretical Study of Nonequilibrium Ion Transport near Biased Electrode2013

    • Author(s)
      Kentaro DOI, Makusu TSUTSUI, Takahito OHSHIRO, Masateru TANIGUCHI, Tomoji KAWAI, Massimiliano DI VENTRA, and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      The 4th TSME International Conference on Mechanical Engineering
    • Place of Presentation
      Pattara, Chonburi, Thailand
    • Year and Date
      20131016-20131018
  • [Presentation] 液中ポールトラップ効果によるナノ粒子のマイクロポア通過速度の制御2013

    • Author(s)
      田中頌二,筒井真楠,土井謙太郎,川野聡恭,谷口正輝,川合知二
    • Organizer
      第74回応用物理学会秋季学術講演会
    • Place of Presentation
      同志社大学京田辺キャンパス
    • Year and Date
      20130916-20130920
  • [Presentation] ナノポアトラップ法による単一粒子の識別2013

    • Author(s)
      前田陽一, 筒井真楠, 土井謙太郎, 川野聡恭, 川合知二, 谷口正輝
    • Organizer
      第74回応用物理学会秋季学術講演会
    • Place of Presentation
      同志社大学京田辺キャンパス
    • Year and Date
      20130916-20130920
  • [Presentation] Experimental Study of Vibration of Prototype Auditory Membrane2013

    • Author(s)
      Harto TANUJAYA and Satoyuki KAWANO
    • Organizer
      The 1st International Conference on Mechanicl Engineering (ICOME 2013)
    • Place of Presentation
      Mataram, Lombok, Indonesia
    • Year and Date
      20130912-20130914
  • [Presentation] 大偏差原理に基づく微生物の自発的運動の検出2013

    • Author(s)
      花崎逸雄,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会2013年度年次大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      20130908-20130911
  • [Presentation] ナノ流路におけるDNAの電気泳動に関する粗視化分子動力学解析2013

    • Author(s)
      銭偉欣,森田介斗,土井謙太郎,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会2013年度年次大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      20130908-20130911
  • [Presentation] 微小電極表面におけるイオン電流の過渡応答に関する理論モデル2013

    • Author(s)
      土井謙太郎,筒井真楠,大城敬人,谷口正輝,川合知二,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会2013年度年次大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      20130908-20130911
  • [Presentation] TIRF顕微鏡法を用いた壁面近傍における単鎖DNAの拡散現象測定2013

    • Author(s)
      上原聡司,新井由之,永井健治,川野聡恭
    • Organizer
      日本機械学会2013年度年次大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      20130908-20130911
  • [Remarks] 大阪大学基礎工学研究科川野研究室

    • URL

      http://bnf.me.es.osaka-u.ac.jp/

  • [Remarks] 大阪大学研究者総覧/川野聡恭

    • URL

      http://www.dma.jim.osaka-u.ac.jp/view?l=ja&u=5013

  • [Remarks] 大阪大学研究者総覧/土井謙太郎

    • URL

      http://www.dma.jim.osaka-u.ac.jp/view?l=ja&u=6476

  • [Remarks] 大阪大学研究者総覧/花﨑逸雄

    • URL

      http://www.dma.jim.osaka-u.ac.jp/view?l=ja&u=10000535

URL: 

Published: 2015-05-28  

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