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2012 Fiscal Year Annual Research Report

シングルセル解析を目指したゲノムDNA単分子操作・解析マイクロデバイス開発

Research Project

Project/Area Number 22310080
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

小穴 英廣  東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (20314172)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywordsゲノム / バイオテクノロジー / ナノバイオ / マイクロ・ナノデバイス
Research Abstract

本研究課題においては、顕微鏡下・マイクロ流体デバイス中で、狙った1 個の細胞(シングルセル)から単離したクロマチンファイバーおよびゲノムDNAを対象とし、「顕微鏡下・その場」で特定の修飾を受けたヒストンの蛍光ラベル及びマッピンッグを行うという、個々のゲノムDNA に対するエピジェネティクス解析手法の基盤技術確立を目的としている。また、この手法を実施する際に有用な特異的塩基配列検出技術など周辺技術開発にも取り組む事としている。本年度は、前年度に引き続きクロマチンファイバーを展開・固定するためのマイクロ流体デバイスの改良を進め、個々のクロマチンファイバーを、より効率良く展開・固定する事が可能となった。そして、マイクロ流体デバイス内に展開・固定した個々のクロマチンファイバーに対する免疫染色実験を行い、クロマチンファイバー上のGFPに対する免疫染色が可能であることを確認することができた。またこれと並行し、免疫染色による空間的位置情報検出の際に併用することが可能な、任意の塩基配列を検出・捕捉する新奇プローブに開発についての研究にも取り組んだ。
一方、マイクロ流体デバイス中における局所的な環境場の形成・制御への応用が期待される、新奇ジャイアントベシクル形成についても研究を継続的に進め、この、マイクロ流体デバイス内で形成されるジャイアントベシクルは、ユニラメラ構造を持つという知見を得た。この研究結果は、Soft Matter誌において発表した。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (3 results)

All 2013 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Direct Formation of Giant Unilamellar Vesicles from Microparticles of Polyion Complexes and Investigation of Their Properties Using a Microfluidic Chamber2013

    • Author(s)
      Hidehiro Oana
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.1039/c3sm00089c

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 相同組換えタンパクを用いた特定塩基配列探索技術の開発

    • Author(s)
      小穴英廣
    • Organizer
      第25回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
    • Place of Presentation
      熊本県 熊本市 崇城大学
  • [Presentation] REAL-TIME FISH USING OPTICALLY-DRIVEN MICROSPHERES FUNCTIONALIZED BY THE HOMOLOGOUS RECOMBINATION PROTEIN, RecA

    • Author(s)
      Hidehiro Oana
    • Organizer
      16th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • Place of Presentation
      沖縄県 宜野湾市 沖縄コンベンションセンター

URL: 

Published: 2014-07-24  

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