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2010 Fiscal Year Annual Research Report

新規相同組換え因子の探索と組換え反応機構の解析

Research Project

Project/Area Number 22310119
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

胡桃坂 仁志  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (80300870)

Keywordsゲノム多様性 / ゲノム進化・再編 / 遺伝情報複製・再編 / ゲノム機能 / 活性発現の分子機構 / 染色体構築・機能・分配 / 生体高分子構造・機能 / 構造活性相関
Research Abstract

相同組換えは、DNAの二重鎖切断修復と遺伝的組換えに働く、ゲノムDNAの安定維持において重要な生命反応である。相同組換えの破綻は、細胞において染色体異常を引き起こすことが知られており、二重鎖切断によって誘起される発がんや、遺伝的組換え異常による不妊症発症の原因となる。ヒトにおける相同組換え経路では多数のタンパク質が働いていると考えられているが、いまだ多くの未同定な因子群が存在している。そこで本研究では、相同組換えにおいて働く新規のタンパク質を同定し、その生化学的機能および立体構造を明らかにすることで、相同組換え素過程の反応機構の解明を目指す。本年度では、まず、先行研究により得ている相同組換え因子候補群の情報から解析対象としてヒトEVL、GEMIN2、およびSPF45などを選定し、それら相同組換え因子候補をリコンビナントタンパク質として精製した。そして、それらの機能を生化学的解析によって検討した結果、以下のことが明らかになった。まずEVLに関して、これまで当研究グループによって明らかにされていた、相同組換え中心酵素RAD51のDNA組換え反応の活性化機能に加えて、EVLがトポイソメラーゼと直接相互作用し、環状単鎖DNAをカテネーションする活性を有することを発見した。次に、ヒトGEMIN2がRAD51と直接相互作用して、相同組換え修復を活性化する新規の因子であることを明らかにした。さらに、ショウジョウバエやアラビドプシスにおいて相同組換えへの関与が指摘されていたSPF45のヒトホモログを精製し、ヒトSPF45が組換え中間体であるHolliday構造特異的に結合するDNA結合タンパク質であることを明らかにした。これらの結果は、相同組換え反応の分子機構解明のための重要な知見を与えた。

  • Research Products

    (51 results)

All 2011 2010

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (41 results)

  • [Journal Article] Structural and biochemical analyses of the human PAD4 variant encoded by a functional haplotype gene2011

    • Author(s)
      Naoki Horikoshi, et al.
    • Journal Title

      Acta Cryst.D

      Volume: 67 Pages: 112-118

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-stranded DNA catenation mediated by human EVL and a type I topoisomerase2010

    • Author(s)
      Takaku M., Takahashi D., Machida S., Ueno H., Hosoya N., Ikawa S., Miyagawa K., Shibata T., Kurumizaka H
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 38 Pages: 7579-7586

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Holliday junction binding activity of human SPF452010

    • Author(s)
      Horikoshi N., Morozumi Y., Takaku M., Takizawa Y., Kurumizaka H
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 5 Pages: 373-383

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] KIAA1018/FAN1 nuclease protects cells against genomic instability induced by interstrand cross-linking agents2010

    • Author(s)
      Kazunori Yoshikiyo, et al.
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      Volume: 107 Pages: 21553-21557

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis of instability of the nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T2010

    • Author(s)
      Hiroaki Tachiwana, et al.
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      Volume: 107 Pages: 10454-10459

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deimination stabilizes histone H2A/H2B dimers as revealed by electrospray ionization mass spectrometry2010

    • Author(s)
      Shingo Shimoyama, et al.
    • Journal Title

      J.Mass Spectrom.

      Volume: 45 Pages: 900-908

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nucleosome formation activity of human sNASP2010

    • Author(s)
      Akihisa Osakabe, et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 285 Pages: 11913-11921

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GEMIN2 promotes accumulation of RAD51 at double-strand breaks in homologous recombination2010

    • Author(s)
      Yoshimasa Takizawa, et al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 38 Pages: 5059-5074

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The putative nuclear localization signal of the human RAD52 protein is a potential sumoylation site2010

    • Author(s)
      Kengo Saito, et al.
    • Journal Title

      J.Biochem.

      Volume: 147 Pages: 833-842

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 発がん防御に重要な相同組換えの分子機構2010

    • Author(s)
      齋藤健吾, 他
    • Journal Title

      最新医学

      Volume: 65 Pages: 1318-1330

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Atomic Resolution Structures of the Human Nucleosomes Containing Histone Variants2011

    • Author(s)
      Hitoshi Kurumizaka
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan(招待講演)
    • Year and Date
      2011-01-25
  • [Presentation] Roles of the N-terminal and C-terminal domains of the Rad52 protein in homologous recombination repair2011

    • Author(s)
      Wataru Kagawa, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-25
  • [Presentation] Biochemical and cell biological analyses of a novel histone interacting factor, SPT22011

    • Author(s)
      Akihisa Osakabe, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] Functional analyses of the Fanconi anemia protein FANCD22011

    • Author(s)
      Koichi Sato, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] The Crystal Structure of Centromere Specific Nucleosome2011

    • Author(s)
      Hiroaki Tachiwana, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] A novel homologous recomination factor, human EVL forms single-stranded DNA catemers with a type I topoisomerase2011

    • Author(s)
      Motoki Takaku, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] Regulation of Radiation-induced focus formation by SUMOylation2011

    • Author(s)
      Hiroki Shima, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] C-terminal Tail of Histone H2AX Reduces Intra-nucleosome Array Interaction2011

    • Author(s)
      Noriyuki Suka, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] Monitoring Histone Modifications in Single Cells using FabLEM (Fab-based Live Endogenous Modification Labeling)2011

    • Author(s)
      Yoko Hayashi-Takanaka, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] SLX4 links the Fanconi anemia pathway to structure-specific endonucleases, SLX1, XPF and MUS81 in interstrand crosslink repair2011

    • Author(s)
      Kimiyo N.Yamamoto, et al.
    • Organizer
      International Symposium of the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji, Japan
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] H2A.Bbdを含むヌクレオソームの生化学的解析2011

    • Author(s)
      有村泰宏, 他
    • Organizer
      第28回染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      加賀
    • Year and Date
      2011-01-12
  • [Presentation] ヒストンH3バリアントCENP-Aを含むヌクレオソームのX線結晶構造解析2011

    • Author(s)
      立和名博昭, 他
    • Organizer
      第28回染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      加賀
    • Year and Date
      2011-01-12
  • [Presentation] 出芽酵母Rad51によるD-loop形成促進のためのRad52第二DNA結合部位の機能2011

    • Author(s)
      新井直人, 他
    • Organizer
      第28回染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      加賀
    • Year and Date
      2011-01-12
  • [Presentation] 新規ヒストン結合因子ヒトSPT2のDNA損傷修復における機能解析2010

    • Author(s)
      越坂部晃永, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-10
  • [Presentation] セントロメア領域に特異的なヌクレオソームのX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      立和名博昭, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-10
  • [Presentation] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析2010

    • Author(s)
      森脇義仁, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] 質量分析を用いたヒストンH2A-H2Bのシトルリン化の解析2010

    • Author(s)
      浅野裕輝, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] CENP-Aターゲッティングドメインを含むH3変異体が形成するヌクレオソームのX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      志賀達也, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] ファンコニ貧血原因遺伝子産物FANCD2およびFANCIの複合体形成と機能解析2010

    • Author(s)
      佐藤浩一, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] Chd2 interacts with H3.3 to determine cell fate in myogenesis2010

    • Author(s)
      Akihito Harada, et al.
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] DNA結合活性を有するCCANタンパク質群の機能解析2010

    • Author(s)
      竹内康造, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] 酵母とヒトDNA修復タンパク質Rad52の機能ドメイン解析2010

    • Author(s)
      香川亘, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] ヒストンバリアントを含むヌクレオソームの構造多様性と機能2010

    • Author(s)
      胡桃坂仁志, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] 生細胞におけるメチル化およびアセチル化修飾ヒストンの可視化2010

    • Author(s)
      林陽子, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] RAD51によるparanemic joint molecule形成過程へのtopoisomerase III αの役割2010

    • Author(s)
      高久誉大, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] 新規RAD51組換え活性制御化合物の同定とその作用機序2010

    • Author(s)
      石田恭子, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] PSFによるDNA組換え酵素DMC1の活性化2010

    • Author(s)
      両角佑一, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] 出芽酵母Rad52の第二DNA結合部位も相同組換えに必要である2010

    • Author(s)
      新井直人, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] DNA修復タンパク質RAD52の翻訳後修飾による機能制御機構の解析2010

    • Author(s)
      齋藤健吾, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] ヌクレオソームの立体構造からみたエピジェネティクスの分子機構2010

    • Author(s)
      胡桃坂仁志
    • Organizer
      第21回フォーラム・イン・ドージン エピジェネティクスによる細胞のメタモルフォーゼ
    • Place of Presentation
      熊本(招待講演)
    • Year and Date
      2010-11-26
  • [Presentation] Structural and biochemical studies of DMC1 polymorphisms in the human population2010

    • Author(s)
      Hitoshi Kurumizaka
    • Organizer
      European Genomics Meeting & European Neurodegenerative Diseases-2010-Meeting
    • Place of Presentation
      Oxford, United Kingdom(招待講演)
    • Year and Date
      2010-09-20
  • [Presentation] ヒトと酵母のDNA修復タンパク質Rad52の機能比較2010

    • Author(s)
      齋藤健吾, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-28
  • [Presentation] ブーケ配向形成因子S.japonicus Bqt1-Bqt2複合体の生化学的解析2010

    • Author(s)
      市川雄一, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-28
  • [Presentation] シトルリン化タンパク質PAD4のSNP変異体の解析2010

    • Author(s)
      堀越直樹, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-28
  • [Presentation] 低分子化合物によるRAD51依存的相同組換え反応の制御2010

    • Author(s)
      石田恭子, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-28
  • [Presentation] Fanconi貧血原因遺伝子FANCD2及びFANCIの機能解析2010

    • Author(s)
      佐藤浩一, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-28
  • [Presentation] ヒストンシャペロンsNASPの生化学的解析2010

    • Author(s)
      越坂部晃永, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-28
  • [Presentation] SUMO修飾システムによるRAD51核内ドメイン形成の制御2010

    • Author(s)
      島弘季, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-28
  • [Presentation] 新規RAD51活性化因子GEMIN2の相同組換え修復における機能2010

    • Author(s)
      高久誉大, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-27
  • [Presentation] ヒストンバリアントH3Tを含むヌクレオソームの構造解析および生化学的解析2010

    • Author(s)
      立和名博昭, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-27
  • [Presentation] Rad52タンパク質のDNA positive supercoiling活性の役割2010

    • Author(s)
      香川亘, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Year and Date
      2010-05-27

URL: 

Published: 2012-07-19  

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