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2010 Fiscal Year Annual Research Report

無細胞プロテインアレイを用いたカスパーゼ依存シグナル伝達経路の網羅的同定

Research Project

Project/Area Number 22310127
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

澤崎 達也  愛媛大学, 無細胞生命科学工学研究センター, 准教授 (50314969)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 酒巻 和弘  京都大学, 生命科学研究科, 准教授 (20271017)
Keywords無細胞蛋白質合成系 / カスパーゼ3 / 蛋白質代謝 / 細胞死 / プロテアーゼ / 蛋白ライブラリー / プロテインカイネース / 細胞内シグナル
Research Abstract

I.シグナル伝達経路のビオチン化プロテインアレイの作製
研究代表者らが既に保有している1万5千種類のヒト完全長cDNAライブラリーおよび3年間費やしてクローニングした200種類のcDNAクローンを用いて、シグナル伝達関連クローンのデータベース(http://www.biochemweb.org/signaling.shtml)から予測される約1,000種類のシグナル伝達経路遺伝子のcDNAクローンを選択し、それらから、N末端にFlagタグ、C末端にビオチン化した組換えプロテインアレイを合成し、超低温フリーザーに保存した(担当:澤崎達也)。
II.アポトーシスの3次元細胞膜動態評価法確立
これまでの研究から、アポトーシスの際に細胞膜のダイナミックな運動(メンブラン・ブレッビング)が観察されている。この細胞膜動態は、アポトーシスの特徴の1つとされており、この制御には細胞骨格タンパク質のリン酸化を中心としたシグナル伝達経路が関与していることが知られている。研究分担者らのこれまでの研究で、この細胞膜動態を共焦点顕微鏡下で生きたまま画像解析処理することにより、細胞膜動態の定量的な測定が可能となった。そこで、これまでに研究代表者らが同定した31種類のカスパーゼ3で切断される新規プロテインカイネース分子の中には、細胞骨格タンパク質をリン酸化する分子を5つ含まれていることから、既に決定している切断部位情報を基にカスパーゼ3切断型遺伝子を構築後、細胞へ導入し、細胞膜動態の経時的変化の測定を行う。これにより、今まで、困難であったカスパーゼ切断により惹起される細胞膜動態の解明に繋がった(担当:酒巻和弘)。

  • Research Products

    (22 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (14 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (7 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Use of domain enzymes from wheat RNA ligase for in vitro preparation of RNA molecules.2011

    • Author(s)
      Makino S, et al.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 404 Pages: 1050-1054

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Wheat germ cell-free protein production system for post-genomic research.2011

    • Author(s)
      Madono M, et al.
    • Journal Title

      N Biotechnol.

      Volume: 28 Pages: 211-217

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Simple screening method for autoantigen proteins using the N-terminal biotinylated protein library produced by wheat cell-free synthesis.2010

    • Author(s)
      Matsuoka K, Komori H, Nose M, Endo Y, Sawasaki T.
    • Journal Title

      J Proteome Res.

      Volume: 9 Pages: 4264-4273

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluating the role of rheumatoid factors for the development of rheumatoid arthritis in a mouse model with a newly established ELISA system.2010

    • Author(s)
      Tanaka Y, Komori H, Mori S, Soga Y, Tsubaki T, Terada M, Miyazaki T, Fujino T, Nakamura S, Kanno H, Sawasaki T, Endo Y, Nose M
    • Journal Title

      Tohoku J Exp Med.

      Volume: 220 Pages: 199-206

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Wheat-Germ Cell-Free Expression System.2010

    • Author(s)
      Takai K, Sawasaki T, Endo Y.
    • Journal Title

      Curr Pharm Biotechnol.

      Volume: 11 Pages: 272-278

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of a caspase-3-substrate kinome using an N- and C-terminally tagged protein kinase library produced by a cell-free system.2010

    • Author(s)
      Tadokoro D, et al.
    • Journal Title

      Cell death & Dis.

      Volume: 1 Pages: e89

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vitro dissection revealed that the kinase domain of wheat RNA ligase is physically isolatable from the flanking domains as a non-overlapping domain enzyme.2010

    • Author(s)
      Makino S, et al.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 397 Pages: 762-726

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biotinylated-sortase self-cleavage purification (BISOP) method for cell-free produced proteins.2010

    • Author(s)
      Matsunaga S, et al.
    • Journal Title

      BMC Biotechnol.

      Volume: 10 Pages: 42

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of Arabidopsis defense responses against Spodoptera littoralis by CPK-mediated calcium signaling.2010

    • Author(s)
      Kanchiswamy CN, et al.
    • Journal Title

      BMC Plant Biol.

      Volume: 10 Pages: 97

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Practical cell-free protein synthesis system using purified wheat embryos.2010

    • Author(s)
      Takai K, et al.
    • Journal Title

      Nat Protoc.

      Volume: 5 Pages: 227-238

  • [Journal Article] Characterization of a caspase-3-substrate kinome using an N- and C-terminally tagged protein kinase library produced by a cell-free system.2010

    • Author(s)
      Sawasaki T, et al.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 607 Pages: 63-72

  • [Journal Article] An efficient approach to the production of vaccines against the malaria parasite.2010

    • Author(s)
      Tsuboi T, et al.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 607 Pages: 73-83

  • [Journal Article] Cell-free protein synthesis for structure determination by X-ray crystallography.2010

    • Author(s)
      Watanabe M, et al.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 607 Pages: 149-160

  • [Journal Article] Arabidopsis CPK3 plays extensive roles in various biological and environmental responses.2010

    • Author(s)
      Arimura GI., Sawasaki T.
    • Journal Title

      Plant Signal Behav.

      Volume: 5 Pages: 1263-1265

  • [Presentation] コムギ無細胞系を基盤としたがん化促進ユビキチン化E3リガーゼの構築2010

    • Author(s)
      安岡左起, ら
    • Organizer
      BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)(口頭およびポスター発表)
    • Year and Date
      2010-12-10
  • [Presentation] Caspase-3により切断されるプロテインカイネースの比較2010

    • Author(s)
      林祥太, ら
    • Organizer
      BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] Caspase-3 cleavage of stress-responsible TRB3 attenuates activated Akt and activates caspase-3 activity2010

    • Author(s)
      清水康平, ら
    • Organizer
      BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)(口頭およびポスター発表)
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] 無細胞基質プロテオリポソームを用いた細胞への膜タンパク質導入技術の開発2010

    • Author(s)
      高橋守, ら
    • Organizer
      BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] 無細胞系を用いた機能プロテオミクス技術とウイルス研究への応用2010

    • Author(s)
      澤崎達也
    • Organizer
      日本ウイルス学会
    • Place of Presentation
      徳島県郷土文化会館
    • Year and Date
      2010-11-08
  • [Presentation] TRB3がcaspase-3に切断されるかどうかは細胞生存と細胞死のターニングポイントの一つである2010

    • Author(s)
      清水康平, ら
    • Organizer
      日本細胞生物学会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場(大阪市)(口頭およびポスター発表)
    • Year and Date
      2010-05-20
  • [Presentation] アポトーシス時におけるミオシンホスファターゼ活性調節機構2010

    • Author(s)
      岩崎隆宏, ら
    • Organizer
      日本細胞生物学会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場(大阪市)(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-05-20
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.ehime-u.ac.jp/~cellfree/endolab/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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