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2012 Fiscal Year Final Research Report

Reverse genetics and recombination

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 22370001
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Genetics/Genome dynamics
Research InstitutionUniversity of Shizuoka

Principal Investigator

IIDA Shigeru  静岡県立大学, 大学院・食品栄養環境科学研究院, 客員教授 (30012777)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) JOHZUKA Yasuyo (HISATOMI Yasuyo)  静岡県立大学, 大学院・薬学研究科, 博士研究員 (60517887)
KINOSHITA Tetsu  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 研究チーム長 (60342630)
ISHIZAKI Kimitsune  京都大学, 大学院・生命科学研究科, 助教 (00452293)
Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) KOBAYASHI Hirokazu  静岡県立大学, 大学院・食品栄養環境科学研究院, 教授 (80170348)
NOGUCHI Hiroshi  静岡県立大学, 薬学部, 教授 (60126141)
WATANABE Kenji  静岡県立大学, 薬学部, 准教授 (50360938)
JOHZUKA Yasuyo (HISATOMI Yasuyo)  静岡県立大学, 大学院・食品栄養環境科学研究院, 客員研究員 (60517887)
Project Period (FY) 2010 – 2012
Keywords植物 / 分子遺伝 / 逆遺伝学 / 遺伝子 / 突然変異 / バイオテクノロジー
Research Abstract

To facilitate reverse genetic approaches, which include homologous recombination-mediated gene targeting using positive-negative selection and gene tagging employing endogenous nDart1-related DNA transposons, we were attempting to elucidate recombination mechanisms and their regulation mechanisms associated with gene targeting and tagging. We also characterized the functions of the genes identified by gene targeting and tagging.

  • Research Products

    (34 results)

All 2013 2012 2011 2010

All Journal Article (14 results) (of which Peer Reviewed: 14 results) Presentation (19 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Homologous recombination-mediated gene targeting in the liverwort Marchantia polymorpha2013

    • Author(s)
      K. Ishizaki, Y. Johzuka-Hisatomi, S. Ishida, S. Iida and T. Kohchi
    • Journal Title

      L. Sci. Rep

      Volume: 3 Pages: 1532

    • DOI

      DOI:10.1038/srep04532 (2013)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] TAWAWA1, a regulator of rice inflorescence architecture, function through the suppression of meristem phase transition2013

    • Author(s)
      A. Yoshida, M. Sasao, N. Yasuno, K. Takagi, Y. Daimon, R. Chen, R. Yamazaki, H. Tokunaga, Y. Kitaguchi, Y. Sato, Y. Nagamura, T. Ushijima, T. Kumamaru, S. Iida, M. Maekawa and J. Kyozuka
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 110 Pages: 767-772

    • DOI

      DOI:10.1073/pnas. 1216151110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A null mutation of ROS1a for DNA demethylation in rice is not transmittable to progeny2012

    • Author(s)
      A. Ono, K. Yamaguchi, S. Fukada-Tanaka, R. Terada, T. Mitsui and S. Iida
    • Journal Title

      Plant J

      Volume: 71 Pages: 564-574

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-313X.2012.05009.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Activation and epigenetic regulation of DNA transposon nDart1 in rice2012

    • Author(s)
      C.-H. Eun, K. Takagi, K.-I. Park, M. Maekawa, S. Iida and K. Tsugane
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol

      Volume: 53 Pages: 857-868

    • DOI

      DOI:10.1093/pcp/pcs060

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of EST -SSR markers of Ipomoea nil2012

    • Author(s)
      T. Ly, H. Fukuoka, A. Otaka, A. Hoshino, S. Iida, E. Nitasaka, N. Watanabe and T. Kuboyama
    • Journal Title

      Breed. Sci.

      Volume: 62 Pages: 99-104

    • DOI

      DOI:10.1270/jsbbs.62.99

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The molecular basis of incomplete dominance at the A locus of CHS-D in the common morning glory, Ipomoea purpurea2011

    • Author(s)
      Y. Johzuka-Hisatomi, H. Noguchi and S. Iida
    • Journal Title

      J. Plant Res

      Volume: 124 Pages: 299-304

    • DOI

      DOI:10.1007/s10295-010-0369-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Examination of transpositional activity of nDart1 at different stages of rice development2011

    • Author(s)
      M. Hayashi-Tsugane, M. Maekawa, H. Kobayashi, S. Iida and K. Tsugane
    • Journal Title

      Genes Genet, Syst

      Volume: 86 Pages: 215-219

    • URL

      https://www.jstage.jst.go.jp/article/ggs/86/3/86_3_215/_article

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A bHLH transcription factor, DvIVS, is involved in regulation of anthocyanin synthesis in dahlia (Dahlia variabilis2011

    • Author(s)
      S. Ohno, M. Hosokawa, A. Hoshino, Y. Kitamura, Y. Morita, K.-I. Park, A.Nakashima, A. Deguchi, F. Tatsuzawa, M. Doi, S, Iida and S. Yazawa
    • Journal Title

      J. Exp. Bot

      Volume: 62 Pages: 5105-5116

    • DOI

      DOI:10.1093/jxb/err216

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Anthocyanin pigmentation controlled by speckled and c-1 mutations of Japanese morning glory2011

    • Author(s)
      N. Saito, F. Tatsuzawa, A. Hoshino, Y. Abe, M. Ichimura, M. Yokoi, K. Toki, Y. Morita, S. Iida and T. Honda
    • Journal Title

      J. Japan Soc. Hort. Sci

      Volume: 80 Pages: 452-460

    • URL

      https://www.jstage.jst.go.jp/article/jjshs1/80/4/80_4_452/_article

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Constitutive expression of the GIGANTEA ortholog affects circadian rhythms and suppresses one-shot induction of flowering in Pharbitis nil, a typical short-day plant2011

    • Author(s)
      Y. Higuchi, K. Sage-Ono, R. Sasaki, N. Ohtsuki, A. Hoshino, S. Iida, H. Kamada and M. Ono
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol

      Volume: 52 Pages: 638-650

    • DOI

      DOI:10.1093/pcp/pcr023

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A rice mutant displaying a heterochronically elongated internode carries a 100 kb deletion2011

    • Author(s)
      M. Hayashi-Tsugane, M. Maekawa, Q. Qian, H. Kobayashi, S. Iida and K. Tsugane
    • Journal Title

      J. Genet. Genomics

      Volume: 38 Pages: 123-128

    • DOI

      DOI:10.1016/j-jgg.2011.02.004

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] メンデルの法則における不完全優性と植物の遺伝子量効果2011

    • Author(s)
      定塚(久富) 恵世、山内卓樹、飯田滋
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 83 Pages: 638-642

    • URL

      http://www.jbsoc.or.jp/event/magazine/pdf/83-07-09.pdf

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transposition and target preferences of an active nonautonomous DNA transposon nDart1 and its relatives belonging to the hAT superfamily in rice2010

    • Author(s)
      K. Takagi, M. Maekawa, K. Tsugane and S. Iida
    • Journal Title

      Mol. Genet. Genomics

      Volume: 284 Pages: 343-355

    • DOI

      DOI:10.1007/s00438-010-0569-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cre-loxP mediated marker elimination and gene reactivation at the waxy locus created in rice genome based on strong positive-negative selection2010

    • Author(s)
      R. Terada, M. Nagahara, K. Furukawa, M. Shimamoto, K. Yamaguchi and S. Iida
    • Journal Title

      Plant Biotechnol

      Volume: 27 Pages: 29-37

    • URL

      http://www.wdc-jp.biz/pdf_store/jspcmb/pdf/pb27_1/27_29.pdf

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A transposon suppressor Dart-canceller in the wild rice2013

    • Author(s)
      K. Tsugane, H. Nishimura, Mhayashi-Tsugane, S. Iida and M. Maekawa
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      20130300
  • [Presentation] Identification of the transposon-tagged gene essential for chloloplast biogenesis in rice2013

    • Author(s)
      M. Hayashi-Tsugane, H. Takahara, N. Ahmed, E. Himi, K. Takagi, S. Iida, M.Maekawa and K. Tsugane
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      20130300
  • [Presentation] EST-SSR と EST-SNP を用いたアサガオ連鎖地図の作成2013

    • Author(s)
      伊東拓朗、奥野菫、勝山弘章、森山拳斗、仁田坂英二、星野敦、飯田滋、福岡浩之、磯部祥子、佐藤修正、渡部信義、久保山勉
    • Organizer
      日本育種学会第123回講演会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20130300
  • [Presentation] イネ内在性 DNA トランスポゾン nDart1 のエピジェネティックな転移活性の制御2012

    • Author(s)
      栂根一夫、Eun Chang-Ho、高木恭子、栂根美佳、飯田滋
    • Organizer
      日本育種学会第122回講演会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120900
  • [Presentation] コシヒカリ nDart1-0 タグラインの育成2012

    • Author(s)
      西村秀希、氷見英子、 飯田滋、栂根一夫、前川雅彦
    • Organizer
      日本育種学会第122回講演会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120900
  • [Presentation] 野生イネゲノム中の栽培イネトランスポゾンを抑制する新規因子2012

    • Author(s)
      栂根一夫、栂根美佳、 飯田滋、前川雅彦
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20120900
  • [Presentation] アサガオの模様にみるエピジェネティックな遺伝子発現制御の獲得機構2012

    • Author(s)
      星野敦、朴慶一、飯田滋
    • Organizer
      日本進化学会第14回東京大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20120800
  • [Presentation] Epigenetic regulation of flower variegation in Ipomoea tricolor2012

    • Author(s)
      A. Hoshino, K.-I. Park and S. Iida
    • Organizer
      第8回生物学国際高等コンファレンス(OBC8)
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      20120300
  • [Presentation] アサガオの模様を生み出す small RNA の機能と制御2012

    • Author(s)
      森田裕将、星野敦、飯田滋
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120300
  • [Presentation] DNA トランスポゾン nDart1 挿入により生じたイネ半優性矮化多分げつ変異体の解析2011

    • Author(s)
      栂根(林)美佳、前川雅彦、 飯田滋、栂根一夫
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20111200
  • [Presentation] イオンビーム処理によるイネのDNA トランスポゾン Dart の活性化2011

    • Author(s)
      前川雅彦、西村秀希、氷見英子、 飯田滋、栂根一夫
    • Organizer
      日本育種学会第122回講演会
    • Place of Presentation
      福井
    • Year and Date
      20110900
  • [Presentation] アザシチジン処理で活性化した自律性因子 Dart の特定2011

    • Author(s)
      西村秀希、氷見英子、 飯田滋、栂根一夫、前川雅彦
    • Organizer
      第122回日本育種学会講演会
    • Place of Presentation
      福井
    • Year and Date
      20110900
  • [Presentation] アサガオの模様から RNA サイレンシングの制御と機能を探る2011

    • Author(s)
      森田裕将、星野敦、飯田滋
    • Organizer
      日本遺伝学会第83回大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20110900
  • [Presentation] ソライロアサガオの模様に係わるエピジェネティクス2011

    • Author(s)
      星野敦、朴慶一、崔丁斗、飯田滋
    • Organizer
      第52回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20110300
  • [Presentation] イネ DNA トランスポゾン nDart1 の挿入領域の特徴と利用2011

    • Author(s)
      栂根一夫、高木恭子、栂根(林)美佳、前川雅彦、飯田滋
    • Organizer
      日本育種学会第121回講演会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20110300
  • [Presentation] Functional analysis of OsROS1aby homologous recombination-promoted gene targeting2010

    • Author(s)
      A. Ono, K. Yamaguchi, Y. JohtsukaHisatomi, T. Mitsui, R. Terada and S. Iida
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会及び第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20101200
  • [Presentation] 大規模欠失によるイネ節間伸張異常変異体の遺伝学的解析2010

    • Author(s)
      栂根美佳、前川雅彦、Qian Qian、小林裕和、飯田滋、栂根一夫
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会及び第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20101200
  • [Presentation] mRNA の網羅的塩基配列解読によるアサガオ SNP マーカーの作出2010

    • Author(s)
      リートン、福岡浩之、星野敦、飯田滋、仁田坂英二、久保山勉
    • Organizer
      日本育種学会第118回講演会
    • Place of Presentation
      秋田
    • Year and Date
      20100900
  • [Presentation] イネ内在性 DNA トランスポゾン nDart の挿入部位指向性と遺伝子タギングへの応用2010

    • Author(s)
      栂根一夫、高木恭子、前川雅彦、 飯田滋
    • Organizer
      イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2010
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20100700
  • [Book] Effective contribution of the nDart transposon-tagging system to rice functional genomics. K. V. Urbano ed2011

    • Author(s)
      M. Maekawa, K. Tsugane and S. Iida
    • Publisher
      Advances in Genetics Research rice functional genomics. K. V. Urbano ed

URL: 

Published: 2014-08-29  

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