2011 Fiscal Year Annual Research Report
藻類における雌雄非対称性の成立とオルガネラ遺伝の方向を決める形態と構造の探索
Project/Area Number |
22370024
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
河野 重行 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (70161338)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
本村 泰三 北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 教授 (30183974)
宮村 新一 筑波大学, 生命環境科学研究科, 准教授 (00192766)
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Keywords | ヒラアオノリ / 雌雄非対称性 / マイクロサテライト / 接合装置 / 免疫サブトラクション / ESTライブラリー / 全ゲノム解析 / プロテオーム |
Research Abstract |
免疫サブトラクション法の再現性を検討するとともに、正逆のサブトラクションで雄(♂)の接合装置に特異的な抗体の調製に挑戦し、それをプロテオーム解析するための基盤を構築した。 1.ヒラアオノリの培養方法を再検討して雌雄配偶子の大量供給を可能にした。このことで雌雄配偶子のESTライブラリー構築、ゲノムシーケンス、プロテオーム解析が可能となった。 2.ヒラアオノリのマイクロサテライトマーカー、葉緑体とミトコンドリアのDNAマーカーを取得することができ、葉緑体とミトコンドリアの遺伝様式の大規模解析を続行している。 3.免疫サブトラクション法で配偶子の細胞表層に接合装置の性的二形性を検出している。アオノリに限らずノリの葉状体タンパク質の電気泳動は極めて難しい。これを克服する方法を考案し、ウェスタンブロット解析などが容易になった。免疫サブトラクション法を拡張して、抗雌(♀)抗血清と抗雄(♂)抗血清を調整して、雌(♀)では200kDa、雄(♂)では40kDaの特異抗原を見いだすことができた。また、雄(♂)に特異的な60kDaと40kDaのバンドも検出した。北大グループと共同で、野外採集した褐藻の配偶子でも調査予定である。 4.抗雌(♀)抗血清と抗雄(♂)抗血清を用いて蛍光抗体染色をおこない、雌雄に特異的な細胞構造の発見に務めている。接合装置だけでなく雌雄の膜が融合する領域の染色にも成功した。FE-SEM免疫電顕に関しては筑波大グループと共同研究する予定である。 5.雌雄配偶子で67~69万リード規模のESTを構築した。また、雌雄配偶子で77~95万リード数程度ではあるが全ゲノム解析を行った。さらに、共同研究で、雌雄配偶子の細胞膜分画をマスでプロテオーム解析した。いずれも限られた規模なので、3つのデータをそれぞれ補完することで、雌雄特異的な遺伝子群の同定を可能にした。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究課題の「オルガネラ遺伝の方向性」と「雌雄配偶子の非対称性」を調べるためには、1)マイクロサテライトマーカー、葉緑体とミトコンドリアのDNAマーカーを取得と2)免疫サブトラクション法の再現性調査が欠かせない。この両方ともにクリアできたので、達成度はおおむね順調に進展していると考えられる。
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Strategy for Future Research Activity |
免疫サブトラクション法の再現性をヒラアオノリの異なる株と褐藻などの他の藻類で見る必要がある。調製された雌雄特異的な抗血清の利用方法についても検討する必要があろう。プロテオーム的な解析とリンクさせるためには、雌雄特異的な抗血清を用いた免疫沈降法によるマス解析が是非とも必要になろう。
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Research Products
(27 results)
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[Journal Article] Chloroplast division and differentially regulated expression of FtsZ1 and FtsZ2 in Nannochloris bacillalis (Chlorophyta, Trebouxiophyceae)2012
Author(s)
Sumiya, N., Watanabe, K., Owari, S., Yamamot, M., Kawano, S.
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Journal Title
Cytologia
Volume: 77
Pages: 59-66
Peer Reviewed
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[Journal Article] Imbalanced functional-disorders between pollen germination and seed formation by heavy-ion beam and γ-ray irradiation2012
Author(s)
Aonuma, W., Ishii, K., Fujita, N., Shimizu, Y., Kazama, Y., Abe, T., Kawano, S.
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Journal Title
RIKEN Accel.Prog.Rep.
Volume: 45(印刷中)(掲載確定)
Peer Reviewed
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[Journal Article] Isolation of mitochondrial and plastid ftsZ genes and analysis 1 of the organelle targeting sequence in the diatom Chaetoceros neogracile (Diatoms, Bacillariophyceae)2012
Author(s)
Nishikawa, T., Moriyama, Y., Sato, M., Sano, T., Hasezawa, S., Ota, S., Kawano, S.
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Journal Title
Phycol.Res.
Volume: 60(印刷中)(掲載確定)
Peer Reviewed
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[Journal Article] DNA Packaging Proteins Glom and Glom2 Coordinately Organize the Mitochondrial Nucleoid of Physarum polycephalum2011
Author(s)
Itoh, K., Izumi, A., Mori, T., Dohmae, N., Yui, R., Maeda-Sano, K., Shirai, Y., Kanaoka, M.M., Kuroiwa, T.,Higashiyama, T., Sugita, M., Murakami-Murofushi, K., Kawano, S. and Sasaki, N
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Journal Title
Mitochondria
Volume: 11
Pages: 575-586
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Chlamydomonas reinhardtii : Duration of its cell cycle and phases at growth rates affected by light intensity2011
Author(s)
Vitova, M., Bisova, K., Umysova, D., Hlavova, M., Kawano, S., Zachleder, V., Cizkova, M.
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Journal Title
Planta
Volume: 233
Pages: 75-86
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Chlamydomonas reinhardtii : duration of its cell cycle and phases at growth rates aVected by temperature2011
Author(s)
Vitova, M.; Binova, K., Hlavova, M., Kawano, S., Zachleder, V., Biqkova, M.
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Journal Title
Planta
Volume: 234
Pages: 599-608
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Involvement of elongation factor-1α, but not an actomyosin contractile ring, in cytokinesis in the primitive red alga Cyanidioschyzon merolae2011
Author(s)
Imoto, Y., Nishida, K., Yagisawa, F., Yoshida, Y., Ohnuma, M., Yoshida, M., Fujiwara, T., Kuroiwa, H., Kawano, S., Kuroiwa, T.
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Journal Title
Cytologia
Volume: 76
Pages: 431-437
Peer Reviewed
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[Journal Article] Aurora kinase of the red alga Cyanidioschyzon merolae is related to both mitochondrial division and mitotic spindle formation2011
Author(s)
Kato, S., Imoto, Y., Ohnuma, M., Matsunaga, T.M., Kuroiwa, H., Kawano, S., Kuroiwa, T., Matsunaga, S.
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Journal Title
Cytologia
Volume: 76
Pages: 455-462
Peer Reviewed
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[Journal Article] Narrowing Down the Mapping of Plant Sex-Determination Regions Using New Y Chromosome-Specific Markers and Heavy-Ion-Beam Irradiation-Induced Y Deletion Mutants in Silene latifolia2011
Author(s)
Fujita, N., Torii, C., Ishii, K., Aonuma, W., Shimizu, Y., Kazama, Y., Abe, T., Kawano, S.
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Journal Title
G3
Volume: 2
Pages: 271-278
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] A petal-less flower caused by a Microbotryum violaceum mutant2011
Author(s)
Fujita, N., Aonuma, W., Shimizu, Y., Yamanaka, K., Hirata, A., Hood, M.E., Kawano, S.
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Journal Title
Int.J.Plant Sci
Volume: 173
Pages: 1-11
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] The filament and colony formation caused by deficiency of cleavage and dissociation of the mother cell wall in Trebouxiophyceae2011
Author(s)
Yamamoto, M., Handa, S., Miyamura, S., Nagumo, T., Kawano, S.
Organizer
The 6th Asian Pacific Phycological Forum
Place of Presentation
Yeosu, Korea(招待講演)
Year and Date
20111009-20111014
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