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2012 Fiscal Year Annual Research Report

相同組み換えを制御する新規メディエーターの構造科学的研究

Research Project

Project/Area Number 22370045
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

清水 敏之  東京大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (30273858)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywords相同組み換え / メディエーター / リコンビナーゼ / X線結晶解析
Research Abstract

相同組み換えにおいて中心的な役割を果たす鎖交換反応はリコンビナーゼであるRad51が行う。しかしながらRad51が効率よく働くためにはメディエータと呼ばれるタンパク質が必要である。Swi5-Sfr1はそのようなメディエータのひとつとして同定されてきたものである。分裂酵母由来のSwi5単独およびSwi5-Sfr1C(Swi5は全長、Sfr1はN末側約半分を削ったもの)の構造解析に成功し、さらにこの複合体の生化学的な実験を行い以下のことを明らかにした。Swi5とSfr1Cは全長同士と同様1:1の複合体を形成すること、Swi5-Sfr1Cは全長Swi5-Sfr1とほぼ同等の最大活性をもつが、そのためには約10倍程度の量が必要であること、Swi5単独では一本の長いαヘリックスを形成していたが、Swi5-Sfr1C複合体では3つのαヘリックスに分かれコイルドコイル構造を作っていること、また全体の形として鋭く屈曲していることなどがわかった。この屈曲構造はRad51リコンビナーゼが形成するフィラメント構造の溝にちょうどあてはまることから、Swi5-Sfr1のメディエータとしての働きはRad51の溝に入り込むことでフィラメントを安定化することが強く示唆された。Rad51にSwi5-Sfr1を混合した電子顕微鏡像をみると、この仮説を裏付けるように
フィラメントの溝が消失していることがわかった。一方、今回構造解析されなかった領域であるSfr1のN末側領域(Sfr1N)はDNAやRad51フィラメントに対し親和性を有することがわかった。以上のことからSwi5-Sfr1による活性化機構は、Sfr1Nがフィラメントに結合その後Swi5-Sfr1Cがフィラメントの溝の入り込みフィラメントを安定化するものと考えられた。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (5 results)

All 2012 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Mechanistic insights into the activation of rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, the swi5-sfr12012

    • Author(s)
      Kuwabara N, et al.
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 20 Pages: 440, 449

    • DOI

      10.1016/j.str.2012.01.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal Structure of Human β-Galactosidase: The Structural Basis of GM1 Gangliosidosis and Morquio B Diseases2012

    • Author(s)
      Ohto U, et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 287 Pages: 1801, 1812

    • DOI

      10.1074/jbc.M111.293795

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural analyses of human Toll-like receptor 4 polymorphisms2012

    • Author(s)
      Ohto U, et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 287 Pages: 40611, 40617

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.404608

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural study of recombination activator, Swi5-Sfr1 complex2012

    • Author(s)
      Shimizu T
    • Organizer
      New frontier of the research in RecAfamily recombinases and their accessory proteins (RecA family 2012)
    • Place of Presentation
      Kyoto Royal Hotel & Spa, Kyoto, Japan
    • Year and Date
      20121128-20121130
    • Invited
  • [Presentation] Mechanistic insights into the activation of the Rad51-mediated strand exchange from the structure of recombination activator, Swi5-Sfr1 complex

    • Author(s)
      Shimizu T
    • Organizer
      Program for Young Researcher Symposium in Europe
    • Place of Presentation
      Oxford, UK
    • Invited

URL: 

Published: 2014-07-24  

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