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2013 Fiscal Year Annual Research Report

ヘム・銅酸素還元酵素のエネルギー変換機構解明のための構造・機能解析

Research Project

Project/Area Number 22370060
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

村本 和優  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 准教授 (50305679)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
Keywords生物物理 / ナノバイオ / 蛋白質 / 酵素 / 呼吸鎖 / 生体エネルギー変換 / X線結晶構造解析
Research Abstract

呼吸鎖電子伝達系のヘム・銅酸素還元酵素はO2還元反応とプロトンポンプのエネルギー変換を効率的に実現する。ヘム・銅酸素還元酵素は原核生物から高等生物まで普遍的に存在し、スーパーファミリーを形成する。スーパーファミリーは数タイプのサブファミリーに分類され、aa3とcbb3タイプではプロトン輸送経路とエネルギー変換効率が異なり、O2分圧の異なる環境に適応して機能する。
効率の高いエネルギー変換機構を解明することを目的として、aa3タイプのX線構造解析を行った。O2アナログ(CO, CN-, N3-)が結合した構造、ならびに電子伝達を担う4つの金属部位が酸化状態と還元状態の混合型構造の構造を決定した。その結果、O2アナログの結合に伴う構造の変化を明らかにするとともに、酸化還元に伴う構造変化を引き起こす金属部位を決定した。
エネルギー変換効率を決定する構造化学的要因を解明することを目的として、aa3タイプの構造をcbb3タイプと比較解析する。cbb3タ イプの大量発現条件、精製方法、結晶化条件の検討を引き続き進めた。細胞膜の可溶化条件、ならびにカラムクロマトグラフィーの条件を改変した結果、精製標品の収率および純度が有意に向上した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

aa3タイプ酵素の構造解析  O2アナログ結合構造、ならびに酸化還元混合型構造の解析から、電子伝達とプロトン輸送のエネルギー変換機能上重要と考えられる構造変化を見出す成果が得られた。
cbb3タイプ酵素の構造・機能解析  cbb3タイプの精製方法が改良され、高純度の標品が得られるようになったが、構造解析可能な結晶を得るまでには至らなかった。

Strategy for Future Research Activity

aa3タイプ酵素の構造解析  ウシ由来aa3タイプ酵素結晶のOR型およびR型の1.4 Å分解能までの回折データを用いた構造解析、ならびにO2アナログ(CO, CN-, N3-)が結合した構造の解析を引き続き進める。酸化状態とO2アナログの結合に伴う構造変化に基づき、O2還元反応とプロトンポンプの共役機構の構造基盤を明らかにする。P型、F型、O型反応中間体結晶の1.8 Å分解能でのX線構造解析を引き続き進める。反応中間体の構造変化に基づき、O2還元反応とプロトンポンプの共役機構の構造基盤を明らかにする。
現在までの達成度を踏まえて、研究計画の一部を以下のとおり変更する。
cbb3タイプ酵素の構造・機能解析  これまでに他の研究グループから報告されたcbb3タイプ酵素の酸化型構造情報を用いて、aa3タイプとの構造比較解析を行う。
NO還元酵素の構造・機能解析  ヘム・銅酸素還元酵素スーパーファミリーに属し、近年X線結晶構造解析が可能になったNO還元酵素も研究対象に含め、エネルギー変換機構解明を目指した構造機能解析に取り組む。NO還元酵素と電子伝達体タンパク質等の複合体、およびNO還元酵素アミノ酸変異体の構造解析を行う。得られた構造を用いてaa3タイプ、cbb3タイプとの構造比較解析を行う。本酵素の構造を決定した研究グループと連携して研究を実施する。

  • Research Products

    (6 results)

All 2013

All Presentation (6 results)

  • [Presentation] C型プロトンポンプ性酸素還元酵素の精製結晶化2013

    • Author(s)
      村本和優、岩本唯、大畠海人、城宜嗣
    • Organizer
      生体エネルギー研究会第39回討論会
    • Place of Presentation
      静岡県コンベンションアーツセンター (静岡県)
    • Year and Date
      20131218-20131220
  • [Presentation] pH dependence of the oxygen consumption activity of the C-type heme-copper oxygen reductase2013

    • Author(s)
      岩本唯、安藤友里子、城宜嗣、村本和優
    • Organizer
      日本生物物理学会第51回年会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都府)
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] Structural analysis of bovine heart cytochrome c oxidase in the cyanide- and azide-bound fully oxidized states2013

    • Author(s)
      村本和優、望月正雄、矢野直峰、武村秀平、川原貴子、蓼原瞳、前田友子、伊藤・新澤恭子、山下栄樹、月原冨武、吉川信也
    • Organizer
      日本生物物理学会第51回年会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都府)
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] Structural analysis of bovine heart cytochrome c oxidase in the CO- and cyanide-bound mixed valence states2013

    • Author(s)
      村本和優、望月正雄、谷口槇、矢野直峰、武村秀平、長尾修平、馬場淳平、前田友子、伊藤・新澤恭子、山下栄樹、月原冨武、吉川信也
    • Organizer
      日本生物物理学会第51回年会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都府)
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] ウシ心筋チトクロム酸化酵素のMgを含む水クラスターの機能の高分解能X線構造解析による研究2013

    • Author(s)
      矢野直峰、加藤公児、山下栄樹、村本和優、伊藤・新澤恭子、月原冨武、吉川信也
    • Organizer
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      とりぎん文化会館(鳥取県)
    • Year and Date
      20130612-20130614
  • [Presentation] ウシ心筋チトクロム酸化酵素の賛成アミノ酸残基のイオン化状態のX線結晶学的解析2013

    • Author(s)
      武村秀平、加藤公児、矢野直峰、山下栄樹、村本和優、伊藤・新澤恭子、月原冨武、吉川信也
    • Organizer
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      とりぎん文化会館(鳥取県)
    • Year and Date
      20130612-20130614

URL: 

Published: 2015-05-28  

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