• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2010 Fiscal Year Annual Research Report

大腸菌の複製開始複合体の新たな分子解剖と新たな制御因子の作動機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22370064
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

片山 勉  九州大学, 大学院・薬学研究院, 教授 (70264059)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 植田 正  九州大学, 大学院・薬学研究院, 教授 (90184928)
KeywordsDnaA / DnaB / oriC / ATP / 細胞周期制御 / 染色体複製開始制御 / タンパク質高次複合体 / 試験管内再構成
Research Abstract

大腸菌の複製開始複合体は、複製起点oriC上で形成されるATP型DnaA-DiaA多量体である。この複合体にDnaBヘリカーゼ(ホモ6量体)が適時的に装着される。複製開始反応後、DNAポリメラーゼIIIのクランプ因子を含む複合体により、DnaA-ATP加水分解が活性化される(RIDA)。これにより不活性なADP-DnaAが産生し、過剰開始が抑制される。次サイクルの複製開始前には、特異的なゲノムDNA部位(DARS)を含む複合体により、ヌクレオチド交換反応が進められADP-DnaAがATP-DnaAに変換し再活性化する。本計画では、これまでの基盤にもとづき、分子生物学的、生化学的、合成生物学的、構造生物学的解析を進め、複製開始複合体やDnaA活性の制御装置という動的高次複合体の作動機構と制御機構を解明することを目的とする。そのため、3年間の計画に沿って研究を進め、その初年度である本年度は以下のような進展や成果が得られた。
(1)複製開始複合体の分子解剖による開始機構解析
多様なDnaA box変異を含むoriC変異体やDnaA変異体を設計、作成して、機能解析と複合体構造解析を進めた。最小oriC複合体の結晶解析のため複合体の分離条件を見いだした。
(2)DnaBヘリカーゼ装着に関わる主要機構
変異DnaB, DnaA蛋白質を新たに多数作成し精製標品を得た。またDnaBヘリカーゼ機能の試験管内アッセイ系も新たに作成した。
(3)RIDAにおけるHda機能制御機構とクランプ-Hda-DnaA複合体における主要相互作用機構
変異クランプ蛋白質を新たに多数作成し精製標品を得た。
(4)ADP-DnaAをATP-DnaAに変換する「DARS」の主要機能メカニズム
新たに見いだしたDARS制御蛋白質の変異などを用いDARS機能への影響を見いだした。

  • Research Products

    (21 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (16 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Suppressors of DnaA-ATP imposed overinitiation in Escherichia coli2011

    • Author(s)
      Charbon, G., 他
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Volume: 79 Pages: 914-928

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of the replication cycle : Conserved and diverse regulatory systems for DnaA and oriC2010

    • Author(s)
      Katayama, T., 他
    • Journal Title

      Nature Review Microbiology

      Volume: 8 Pages: 163-170

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DnaA, ORC, and Cdc6 : Similarity beyond the domains of life and diversity2010

    • Author(s)
      Kawakami, H., 他
    • Journal Title

      Biochemistry and Cell Biology

      Volume: 88 Pages: 49-62

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel essential residues of Hda for interaction with DnaA in the regulatory inactivation of DnaA : Unique roles for Hda AAA+Box VI and VII motifs2010

    • Author(s)
      Nakamura, K., 他
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Volume: 76 Pages: 302-317

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌の複製クランプに結合する新規因子による染色体分配制御の機構解析2011

    • Author(s)
      片山勉
    • Organizer
      国立遺伝学研究所共同研究会「単細胞システムの細胞構築と増殖機構の研究」
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所(静岡県)
    • Year and Date
      20110330-20110331
  • [Presentation] Interaction modes between DnaA and DiaA in initial complexes in E.coli2011

    • Author(s)
      Keyamura, K., 他
    • Organizer
      Keystone Symposia on Molecular and Cellular Biology : DNA replication and Recombination
    • Place of Presentation
      Keystone, Colorado, USA
    • Year and Date
      20110227-20110304
  • [Presentation] DnaA, The Replication Initiator, Is Activated for The Timely Initiation of The Chromosomal Replication by A Specific DNA Element, DARS2011

    • Author(s)
      Fujimitsu, K, 他
    • Organizer
      International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県)
    • Year and Date
      20110124-20110126
  • [Presentation] 大腸菌染色体の複製開始因子DnaAによる超高次複合体の分子解剖2011

    • Author(s)
      片山勉
    • Organizer
      九州大学P&P拡大研究会
    • Place of Presentation
      九州大学
    • Year and Date
      2011-01-12
  • [Presentation] 高次複合体形成による大腸菌染色体の複製開始因子DnaAの機能制御2010

    • Author(s)
      片山勉, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会/第83回日本生化学会合同大会ワークショップ
    • Place of Presentation
      ポートピアホテル国際会議場(兵庫県)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 大腸菌染色体複製を開始する超高次DnaA-oriC複合体の機能的制御機構2010

    • Author(s)
      尾崎省吾, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会/第83回日本生化学会合同大会ワークショップ
    • Place of Presentation
      ポートピアホテル国際会議場(兵庫県)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] DNA複製クランプ依存性DnaA不活性化機構(RIDA)におけるDnaA-Hda相互作用メカニズム2010

    • Author(s)
      毛谷村賢司, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会/第83回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      ポートピアホテル国際会議場(兵庫県)(一般口頭発表)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 大腸菌の染色体分配に機能する新規因子RisAと相互作用する因子の探索とその機能解析2010

    • Author(s)
      永田小桃, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会/第83回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      ポートピアホテル国際会議場(兵庫県)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 大腸菌のhda変異による過剰な染色体複製開始を抑制する遺伝子の探索と機能解析2010

    • Author(s)
      野口泰徳, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会/第83回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      ポートピアホテル国際会議場(兵庫県)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] Identification of DARS regulators in E.coli2010

    • Author(s)
      Bayoumi, A.M.A., 他
    • Organizer
      The 7th 3R Symposium
    • Place of Presentation
      富山国際会議場(富山県)
    • Year and Date
      20101026-20101030
  • [Presentation] 大腸菌のDNA複製開始を適時的に制御する分子動態システム2010

    • Author(s)
      毛谷村賢司, 他
    • Organizer
      第82回日本遺伝学会プレナリーワークショップ
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      20100920-20100923
  • [Presentation] ヒストン様蛋白質による複製開始促進因子DARS2(DnaA-reactivating sequence 2)の制御様式の解明2010

    • Author(s)
      加生和寿, 他
    • Organizer
      第82回日本遺伝学会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      20100920-20100923
  • [Presentation] DARS, DnaA-reactivating sequence promotes exchange of DnaA-bound ADP to ATP2010

    • Author(s)
      Fujimitsu, K., 他
    • Organizer
      EMBO Conference ; Replication/Repair & Segregation of Chromosomes
    • Place of Presentation
      Freiburg-Munzingen, Germany
    • Year and Date
      20100613-20100617
  • [Presentation] Mechanism for ATP-DnaA-dependent unwinding of duplex DNA within the chromosomal replication origin2010

    • Author(s)
      Ozaki, S., 他
    • Organizer
      EMBO Conference ; Replication/Repair & Segregation of Chromosomes
    • Place of Presentation
      Freiburg-Munzingen, Germany
    • Year and Date
      20100613-20100617
  • [Presentation] 大腸菌染色体複製開始を制御するDnaA-oriC複合体の機能構造2010

    • Author(s)
      尾崎省吾, 他
    • Organizer
      第7回 21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      グリーンピア南阿蘇(熊本県)
    • Year and Date
      20100603-20100604
  • [Presentation] DiaAによるDnaB装着制御機構の解明2010

    • Author(s)
      東雅裕, 他
    • Organizer
      第7回 21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      グリーンピア南阿蘇(熊本県)
    • Year and Date
      20100603-20100604
  • [Remarks]

    • URL

      http://bunsei.phar.kyushu-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2012-07-19  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi