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2010 Fiscal Year Annual Research Report

バキュロウイルスをモデルとした長鎖非コードRNAの機能解析

Research Project

Project/Area Number 22380033
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

勝間 進  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 准教授 (20378863)

Keywordsバキュロウイルス / 昆虫 / 非コードRNA / 発現制御 / 遺伝子 / 転写 / 昆虫ウイルス / ウイルス
Research Abstract

昆虫ウイルスの一種であるバキュロウイルスは、100kbp以上の2本鎖DNAをゲノムとして持つ大型のDNAウイルスであり、高度な宿主制御を行うことが知られている。バキュロウイルスゲノムには100個以上のタンパク質コード遺伝子が存在するが、非コードRNAの存在は知られていない。申請者は、ウイルス感染培養細胞のトランスクリプトーム解析によって、既報のORFをコードしない長鎖非コードRNAがウイルスゲノムから転写されている可能性を見いだしていた。今年度は、まず、ウイルス感染培養細胞から作成した完全長cDNAライブラリーのランダムシークエンシングから得られた5',3'端各約10,000クローンをウイルスゲノムにマップし、4679個の転写ユニットを同定した。また、ゲノム上に存在する後期遺伝子転写モチーフ(TAAG)のうち70%程度は実際に使用されていることを明らかにした。さらに、転写ユニットのなかには、50~100種の長鎖非コードRNAと思われる転写産物が存在した。そのうちの一部は、遺伝子ORFの5'端にクラスターをなしてマップされたことから、ORFの転写制御に何らかの役割を果たしていると考えられた(Katsuma et al., 2011, Journal of General Virology)。現在、非コードRNAだと考えられる転写物のプロモーターを欠損した組換えウイルスを作成中である。今後、それらのウイルスの性状を調べることで、ウイルスの長鎖非コードRNAの機能を知ることができると考えている。

  • Research Products

    (13 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (7 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Role of the ubiquitin-proteasome system in Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection2011

    • Author(s)
      Katsuma S, Tsuchida A, Imai-Matsuda N, Kang W-K, and Shimada T
    • Journal Title

      Journal of General Virology

      Volume: 92 Pages: 699-705

    • DOI

      DOI:10.1099/vir.0.027573-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mass identification of transcriptional units expressed from the Bombyx mori nucleopolyhedrovirus genome2011

    • Author(s)
      Katsuma S, Kang W-K, Shin-i T, Ohishi K, Kadota K, Kohara Y, and Shimada T
    • Journal Title

      Journal of General Virology

      Volume: 92 Pages: 200-203

    • DOI

      DOI:10.1099/vir.0.025908-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] BmDJ-1 is a key regulator for the developmental oxidative modification of the silkworm, Bombyx mori2011

    • Author(s)
      Hiroko Tabunoki
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 6(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of a Bombyx mori nucleopolyhedrovirus mutant lacking both fp25K and p352010

    • Author(s)
      Nakanishi T, Shimada T, and Katsuma S
    • Journal Title

      Virus Genes

      Volume: 41 Pages: 144-148

    • DOI

      DOI:10.1007/s11262-010-0492-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hsc70/Hsp9O chaperone machinery mediates ATP-dependent RISC loading of small RNA duplexes2010

    • Author(s)
      Shintaro Iwasaki
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 39 Pages: 292-299

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] バキュロウイルスによる宿主行動制御におけるPTPタンパク質の役割2010

    • Author(s)
      小谷野泰枝
    • Organizer
      第9回昆虫病理研究会シンポジウム・第16回BT研究会
    • Place of Presentation
      財団法人人材開発センター富士研修所
    • Year and Date
      20100923-20100925
  • [Presentation] BmNPVの宿主行動制御におけるpolh領域の役割2010

    • Author(s)
      國生龍平
    • Organizer
      第9回昆虫病理研究会シンポジウム・第16回BT研究会
    • Place of Presentation
      財団法人人材開発センター富士研修所
    • Year and Date
      20100923-20100925
  • [Presentation] バキュロウイルス感染におけるユビキチン・プロテアソーム経路の役割2010

    • Author(s)
      土田歩未
    • Organizer
      第9回昆虫病理研究会シンポジウム・第16回BT研究会
    • Place of Presentation
      財団法人人材開発センター富士研修所
    • Year and Date
      20100923-20100925
  • [Presentation] エクジソン糖転移酵素はカイコ個体におけるウイルス増殖部位の決定に関与する2010

    • Author(s)
      勝間進
    • Organizer
      日本蚕糸学会第80回記念大会
    • Place of Presentation
      信州大学繊維学部
    • Year and Date
      20100403-20100404
  • [Presentation] バキュロウイルス感染におけるユビキチン・プロテアソーム経路の役割2010

    • Author(s)
      土田歩未
    • Organizer
      日本蚕糸学会第80回記念大会
    • Place of Presentation
      信州大学繊維学部
    • Year and Date
      20100403-20100404
  • [Presentation] Baculoviruses control host physiology and behavior by captured cellular homologs2010

    • Author(s)
      勝間進
    • Organizer
      Silkworm Genome Symposium-New Silk Road : Silkworm Genome to Sustainable Agriculture
    • Place of Presentation
      Tsukuba Center for Institutes
    • Year and Date
      2010-11-09
  • [Presentation] 昆虫ウイルスの巧みな宿主制御戦略2010

    • Author(s)
      勝間進
    • Organizer
      日本昆虫科学連合設立記念・日本学術会議公開シンポジウム「新時代の昆虫科学を拓く」
    • Place of Presentation
      日本学術会議講堂
    • Year and Date
      2010-07-24
  • [Remarks]

    • URL

      http://papilio.ab.a.u-tokyo.ac.jp./igb/index-J.html

URL: 

Published: 2012-07-19  

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