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2012 Fiscal Year Annual Research Report

デジタル遺伝子発現解析による微細藻類CO2濃縮・水素発生関連遺伝子の同定と利用

Research Project

Project/Area Number 22380059
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

福澤 秀哉  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (30183924)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山野 隆志  京都大学, 生命科学研究科, 助教 (70570167)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywords光合成 / 微細藻類 / 緑藻クラミドモナス / バイオ燃料 / 炭酸固定 / 二酸化炭素 / 代謝工学 / 形質転換
Research Abstract

微細藻類におけるデンプンや脂肪酸の合成を律速する要因であるCO2輸送の改良を目指して、無機炭素濃縮の調節因子と無機炭素輸送体を網羅的に探索した。培養中のCO2濃度を5%から0.04%に変化させた前後の細胞から経時的にRNAを抽出し、RNA-seq法による転写応答を調べた。30倍以上の発現誘導を示す新規な膜タンパク質遺伝子を7種類同定した。その中のヒトHCO3-/Cl-アニオンチャネルの相同性遺伝子について、過剰発現株の単離に成功した。無機炭素濃縮の調節に関わる因子としては、アデニル酸/グアニル酸シクラーゼ、リン酸化酵素、亜鉛フィンガードメインを持つタンパク質の遺伝子が、無機炭素濃縮のマスター因子CCM1の下流で誘導された。これらの調節因子と膜タンパク質遺伝子の情報は、無機炭素濃縮機構の強制発現や高効率の光合成を達成するために有用であると考えられる。低CO2条件で顕著に誘導されるミトコンドリア型炭酸脱水酵素CAH4のプロモーター配列を取得し、人工ルシフェラーゼ遺伝子と連結したキメラ遺伝子を保持する株5-54を取得した。本株は、低CO2条件でルシフェラーゼ活性が安定的に上昇した。CO2濃縮の制御に関わる制御因子の単離を目的として、5-54株からDNAタギングにより低CO2条件でルシフェラーゼ活性が低下する変異株を11株得た。その中には光依存的CO2ガス交換活性が低下する株が含まれていた。今後はこれらの変異株の原因遺伝子を同定することで、無機炭素濃縮を制御する新規な因子が同定できると考えられた。低CO2誘導性遺伝子の2個を同時に強制発現する株を作出したところ、特定の培養環境で光合成能が上昇するという予備的結果を得たので、更に検証を進めている。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 2 results) Book (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Rapid transformation of Chlamydomonas reinhardtii without cell-wall removal.2013

    • Author(s)
      Takashi Yamano
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng.

      Volume: 115 Pages: 691-694

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2012.12.020

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 緑藻クラミドモナスにおける無機炭素濃縮機構と脂質代謝2012

    • Author(s)
      福澤秀哉、山野隆志、梶川昌孝
    • Journal Title

      光合成研究

      Volume: 22 Pages: 174-184

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Low-CO2 inducible Ci transport system in a green alga, Chlamydomonas reinhardtii.2013

    • Author(s)
      山野 隆志
    • Organizer
      16th International Workshop on Plant Membrane Biology
    • Place of Presentation
      倉敷
    • Year and Date
      20130326-20130331
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスにおけるCCM1複合体を介したCO2応答性遺伝子の転写調節機構2012

    • Author(s)
      山野 隆志
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学
    • Year and Date
      20120915-20120917
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスにおける低CO2誘導性無機炭素輸送体の解析2012

    • Author(s)
      佐藤 江美
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学
    • Year and Date
      20120915-20120917
  • [Presentation] Engineering of Carbon-Concentrating Mechanism, Genomes and Metabolic Pathways in a Green Alga, Chlamydomonas reinhardtii.2012

    • Author(s)
      福澤 秀哉
    • Organizer
      9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
    • Place of Presentation
      高知
    • Year and Date
      20120713-20120716
    • Invited
  • [Presentation] Genome-wide response to CO2 deficiency in Chlamydomonas reinhardtii revealed by RNA-seq analysis.2012

    • Author(s)
      山野 隆志
    • Organizer
      15th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
    • Place of Presentation
      ポツダム、ドイツ
    • Year and Date
      20120605-20120610
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスにおけるCO2の濃縮とセンシングならびに代謝変換2012

    • Author(s)
      福澤 秀哉
    • Organizer
      日本光合成学会
    • Place of Presentation
      東京工業大学すずかけキャンパス
    • Year and Date
      20120601-20120602
    • Invited
  • [Book] 微細藻類によるエネルギー生産と事業展望-微細藻類のCO2濃縮機構 -モデル緑藻におけるゲノム発現情報の利用-2012

    • Author(s)
      山野隆志
    • Total Pages
      261
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] 「藻類ハンドブック」藻類の核酸(DNAとRNA)-遺伝子の特徴と解析法2012

    • Author(s)
      山野隆志
    • Total Pages
      2012
    • Publisher
      エヌティーエス
  • [Book] Plastid Biology, Energy Conversion and Carbon Assimilation2012

    • Author(s)
      Hideya Fukuzawa
    • Total Pages
      34巻: 625-650
    • Publisher
      Springer, Advances in Photosynthesis and Respiration
  • [Remarks] 京都大学大学院生命科学研究科微生物細胞機構学分野

    • URL

      http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/labs/molecule/

URL: 

Published: 2014-07-24  

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