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2012 Fiscal Year Annual Research Report

最新のデータサイエンスに基づく養殖および種苗放流の遺伝的影響の実証的解明

Research Project

Project/Area Number 22380110
Research InstitutionTokyo University of Marine Science and Technology

Principal Investigator

北田 修一  東京海洋大学, 海洋科学技術研究科, 教授 (10262338)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岸野 洋久  東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (00141987)
北門 利英  東京海洋大学, 海洋科学技術研究科, 准教授 (40281000)
濱崎 活幸  東京海洋大学, 海洋科学技術研究科, 准教授 (90377078)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywords種苗放流 / 養殖 / 野生集団への影響 / アサリ / サワラ / マダイ / 種苗性 / 遺伝子発現
Research Abstract

【アサリ】日本8カ所、中国4カ所から採集された1,200個体以上の標本の外部形態及び遺伝子データに基づき、有明海では初めに中国アサリ(仮称、外来種)♂が侵入してハイブリッド集団になっており、中国アサリ由来の遺伝子が約50%を占めることを明らかにした。
【サワラ】5,005個体の0歳魚(内551個体は放流魚)の体長と体重を解析し、環境収容量を超えて放流が行われた場合には放流魚は天然魚のバイオマスを置き換えたことを明らかにした。また、日本周辺の11海域から合計1,424個体の天然魚と香川県で生産された人工種苗230個体を収集し、ミトコンドリアDNA調節領域の塩基配列(861個体)とマイクロサテライトDNA 5遺伝子座(1,654個体)の遺伝子型を決定した。
【マダイ】愛媛県宇和海から養殖魚100個体と天然魚116個体、瀬戸内海東部の岡山県寄島から98個体を採集した。また、鹿児島湾から、天然魚60個体、放流魚36個体を、鹿児島県東シナ海側の江口から93個体を採集した。養殖魚と天然魚249個体の外部形態を計測・解析するとともに、マイクロサテライトDNA 5座位(584個体)の遺伝子型とミトコンドリアDNA COI領域の塩基配列(437個体)を決定した。
【データサイエンス】人工種苗と天然魚の質的差異とその発現メカニズムをとらえるには、内分泌と遺伝子発現の関連を明らかにすることが不可欠である。これらの関連を尤度ベースのグラフィカルモデルでとらえ、形質の背後にある分子レベルのメカニズムの全体像をとらえる新たな手法を開発した。適用例として、ベニザケを産卵期の河川遡上行動とともに追跡したデータとタイセイヨウサケを受精から孵化し浮上するまでの初期発生にそって追跡した公開データを解析した結果、内分泌が遺伝子発現を促し、それが行動を決定づける様子が明確に描かれた。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Molecular and morphological evidence of hybridization between native Ruditapes philippinarum and the introduced Ruditapes form in Japan2013

    • Author(s)
      Kitada S, Fujikake C, Asakura Y, Yuki H, Nakajima K, Vargas K M, Kawashima S, Hamasaki K, Kishino H (Kitada S)
    • Journal Title

      Conservation Genetics

      Volume: 14(3) Pages: in press

    • DOI

      10.1007/s10592-013-0467-x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ecological interactions between hatchery and wild fish: A case study based on the highly piscivorous Japanese Spanish mackerel2013

    • Author(s)
      Nakajima K , Kitada S, Yamazaki H, Takemori H, Obata Y, Iwamoto A, Hamasaki K (Kitada S)
    • Journal Title

      Aquaculture Environment Interactions

      Volume: 3 (4) Pages: 231-243

    • DOI

      10.3354/aei00065

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Catch fluctuation of Kuruma prawn Penaeus japonicus in Japan relative to ocean climate variability and a stock enhancement programme2013

    • Author(s)
      Hamasaki K, Kitada S (Hamasaki K)
    • Journal Title

      Review in Fisheries Science

      Volume: 21 (3) Pages: in press

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Directed graphical modeling of gene expression profile underlying salmonids reproductive behavior2012

    • Author(s)
      Nakamichi R, Kishino H, Kitada S (Kishino H)
    • Organizer
      Friday Seminar, Center for Ecological and Evolutionary Synthesis, University of Oslo
    • Place of Presentation
      Oslo, Norway
    • Year and Date
      20121005-20121005
  • [Presentation] Genetic effects of aquaculture on wild populations: A case study of the red sea bream in the western Japan2012

    • Author(s)
      Nakajima K et al. (Kitada S)
    • Organizer
      Norway-Japan workshop on evaluating impacts of aquaculture
    • Place of Presentation
      Bergen, Norway
    • Year and Date
      20121001-20121002
  • [Presentation] Japan marine stock enhancement programme and concerns of fitness decline of hatchery fish. Norway-Japan workshop on evaluating impacts of aquaculture2012

    • Author(s)
      Kitada S, Kishino H (Kitada S)
    • Organizer
      Norway-Japan workshop on evaluating impacts of aquaculture
    • Place of Presentation
      Bergen, Norway
    • Year and Date
      20121001-20121002
  • [Presentation] グラフィカルモデリングによる遺伝子と内分泌の発現ネットワーク推定2012

    • Author(s)
      中道 礼一郎, 岸野洋久, 北田修一 (岸野洋久)
    • Organizer
      平成24年度日本水産学会秋季大会
    • Place of Presentation
      水産大学校, 下関
    • Year and Date
      20120915-20120915
  • [Presentation] 質的付加情報を利用した遺伝子発現有向グラフの定量的推定2012

    • Author(s)
      中道 礼一郎, 岸野洋久, 北田修一 (岸野洋久)
    • Organizer
      2012年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      北海道大学, 札幌
    • Year and Date
      20120910-20120910
  • [Presentation] Inference of direct effect and module structure of transcriptome behind phenotype via graphical modeling2012

    • Author(s)
      Nakamichi R, Kishino H, Kitada S (Kishino H)
    • Organizer
      2012 International Biometric Scociety Meeting
    • Place of Presentation
      Kobe, Japan
    • Year and Date
      20120826-20120831
  • [Remarks] 北田修一ホームページ

    • URL

      http://www2.kaiyodai.ac.jp/~kitada/index_kitada.html

  • [Remarks] 保全遺伝学研究グループホームページ

    • URL

      http://popgene.co-site.jp/

URL: 

Published: 2014-07-24  

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