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2012 Fiscal Year Annual Research Report

野生マウスの遺伝子プールから発掘したヘテローシスQTLの候補遺伝子解析

Research Project

Project/Area Number 22380149
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

石川 明  名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (20211724)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2014-03-31
Keywords育種学 / 遺伝学 / マウス / QTL / ヘテローシス
Research Abstract

昨年度までに、ヘテローシスQTLが存在すると考えられる染色体領域約44Mb内に存在する153個の遺伝子のエクソン領域を次世代シークエンサーRoche GS FLXを用いてシークエンス解析を行った。また、C57BL/6J近交系に導入したコンジェニック系統と2種類のサブコンジェニック系統を交配し、150~310個体のF2世代を生産した。本年度は、以下のことを実施した。
(1)新たなサブコンジェニック系統の樹立:昨年度に得られたF2個体群の中で有用な組換え個体を発見した。この個体は、着目したヘテローシスQTLの存在領域をさらに狭めることができるものと考えられたので、この組換え個体を用いて新たなサブコンジェニック系統を樹立した。
(2)サブコンジェニック系統とC57BL/6J系統間F2交雑群の作製および表現型の特徴解析:上記(1)で樹立したサブコンジェニック系統をC57BL/6Jと交配してF1とF2世代を生産し、得られたF2個体の耳介からゲノムDNAを抽出し、マイクロサテライトマーカーの遺伝子型をPCR法とアガロースゲル電気泳動法により決定した。また、F2個体の体重、体長と臓器重量を計測し、データを蓄積した。
(3)候補遺伝子の探索と発現解析:一昨年得られたシークエンス解析結果とバイオインフォマティクスによる検索結果に基づき、着目した染色体領域内においてヘテローシスQTLの候補遺伝子を探索した。得られた一部の候補遺伝子について、リアルタイムPCR解析を行った。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2013 2012

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Fine mapping of quantitative trait loci affecting organ weights by mouse intersubspecific subcongenic strain analysis2013

    • Author(s)
      Mollah, Md. B. R. and Ishikawa, A.
    • Journal Title

      Animal Science Journal

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1111/asj.12004

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] マウス第2染色体上の体重・肥満QTLが存在するコンジェニック領域のエクソーム解析2013

    • Author(s)
      石川 明
    • Organizer
      第60回日本実験動物学会総会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      20130515-20130517
  • [Presentation] マウス白色脂肪組織重量QTLが存在するサブコンジェニック領域のRNA-seq解析2013

    • Author(s)
      石川 明
    • Organizer
      日本畜産学会第116回大会
    • Place of Presentation
      安田女子大学
    • Year and Date
      20130327-20130330
  • [Presentation] Improved mapping of a body weight QTL on mouse chromosome 2 discovered from wild Mus musculus castaneus.2012

    • Author(s)
      Ishikawa, A. and Okuno, S.
    • Organizer
      The Fourth International Conference of Quantitative Genetics
    • Place of Presentation
      Edinburgh International Conference Centre
    • Year and Date
      20120617-20120622

URL: 

Published: 2014-07-24  

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