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2010 Fiscal Year Annual Research Report

中性子回折による創薬標的タンパク質のリガント認識機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22390010
Research InstitutionJapan Atomic Energy Agency

Principal Investigator

黒木 良太  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究主席 (30391246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 城所 俊一  長岡技術科学大学, 工学部, 教授 (80195320)
玉田 太郎  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究主幹 (50391248)
安達 基泰  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究副主幹 (60293958)
大原 高志  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究副主幹 (60391249)
栗原 和男  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究副主幹 (50354890)
Keywords蛋白質 / 分子認識 / 水和 / 分子設計
Research Abstract

平成22年度は、下記の2つの課題を重点的に実施した。
1.水素原子位置の決定を目的とした解析用タンパク質試料作製
i)ガン治療標的となるSer/Thrキナーゼ、ii)強毒性インフルエンザウイルス由来のノイラミニダーゼ、およびiii)薬剤耐性ヒト免疫不全ウイルス由来のプロテアーゼなどの創薬標的タンパク質の発現系構築および精製を試みた。キナーゼおよび薬剤耐性ウイルス由来プロテアーゼ試料は、大腸菌発現によって作製に成功し、さらにX線回折法による結晶構造解析を実施した。強毒性インフルエンザウイルス由来ノイラミニダーゼは、大腸菌およびブレビバチルス発現系を用いて発現を試みたが目的タンパク質を得ることはできなかった。そこで新たにβラクタマーゼを試料として作製し、X線による結晶構造解析を実施した。その結果、中性子解析に適した格子長を有する3種類のタンパク質結晶の取得に成功した。
2.大型結晶作製に向けての準備(タンパク質物性の改良)
中性子構造解析用の大型結晶試料の作製において、タンパク質分子の溶解度や分子の均一性の向上を目的として物性の改変を試みた。上記の課題のタンパク質について、分子内に存在する遊離型Cys残基を系統的に除去することにより、非特異的なジスルフィド形成の抑制に成功した。また化学的に弱いアミノ酸配列(Asn-Gly)におけるAsnを、Glnへ置換することによって、脱アミド化に伴うイソアスパラギン酸生成を抑制し、良質な大型結晶を得ることができた。

  • Research Products

    (13 results)

All 2010

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] 中性子と放射光の相補的な利用による創薬標的タンパク質の立体構造解析2010

    • Author(s)
      黒木良太, 他4名
    • Journal Title

      薬学雑誌

      Volume: 130 Pages: 957-964

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Towards investigation of the inhibitor-recognition mechanisms of drug-target proteins by neutron crystallography2010

    • Author(s)
      R.Kuroki, et al
    • Journal Title

      Acta Crystallogr.D Biol.Crystallogr.

      Volume: 66 Pages: 1126-1130

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] X-ray and neutron protein crystallographic analysis of the trypsin-BPTI complex2010

    • Author(s)
      K.Kawamura., et al.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr.D Biol.Crystallogr.

      Volume: 67 Pages: 140-148

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 生体高分子専用高分解能中性子結晶回折計I)装置のコンセプト~装置を使った研究の展開2010

    • Author(s)
      黒木良太
    • Organizer
      日本中性子科学会・サテライトシンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学多元物質科学研究所
    • Year and Date
      2010-12-11
  • [Presentation] 原子力機構におけるタンパク質中性子構造解析の現状2010

    • Author(s)
      玉田太郎, 他
    • Organizer
      日本結晶学会
    • Place of Presentation
      大阪大学コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-12-05
  • [Presentation] 変異導入と結晶構造解析によるナガガジ由来不凍タンパク質の抗凍結機構の解析2010

    • Author(s)
      大原高志, 他
    • Organizer
      日本結晶学会
    • Place of Presentation
      大阪大学コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-12-05
  • [Presentation] 高効率なトレハロース合成をつかさどる古細菌由来の2つの酵素の立体構造解析2010

    • Author(s)
      岡崎伸生, 他
    • Organizer
      日本結晶学会
    • Place of Presentation
      大阪大学コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-12-05
  • [Presentation] 中性子結晶構造解析を目指したフェレドキシン依存性還元酵素PcyAの結晶成長2010

    • Author(s)
      石川久美子, 他
    • Organizer
      日本結晶学会
    • Place of Presentation
      大阪大学コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-12-05
  • [Presentation] 中性子線構造解析に向けたタンパク質大型結晶の高効率育成新技術の開発2010

    • Author(s)
      垣之内啓介, 他
    • Organizer
      日本結晶学会
    • Place of Presentation
      大阪大学コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-12-03
  • [Presentation] 中性子構造解析を目指したヒトMAPキナーゼJNK1変異導入による結晶パッキングの改変2010

    • Author(s)
      仲庭哲津子, 他
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] 薬剤耐性A17型HIV-1プロテアーゼと阻害剤複合体のX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      安達基泰, 他
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] 研究用原子炉JRR-3におけるタンパク質結晶中性子回折実験2010

    • Author(s)
      栗原和男, 他
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 生産性および不凍活性を向上させた改変型不凍タンパク質とその製造方法2010

    • Inventor(s)
      黒木良太, 他5名
    • Industrial Property Rights Holder
      独立行政法人日本原子力研究開発機構, 他名
    • Industrial Property Number
      特許、特願2010-105583
    • Filing Date
      2010-04-30

URL: 

Published: 2013-06-26  

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