2011 Fiscal Year Annual Research Report
多戦略的グライコプロテオミクスによる消化器癌のバイオマーカー開発と臨床応用
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22390114
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
野村 文夫 千葉大学, 大学院・医学研究院, 教授 (80164739)
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| Keywords | プロテオーム / ペプチドマーカー / 蛋白質 / 癌 / 臨床 / 検査医学 |
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| Research Abstract |
血清プロテオーム解析では原理の異なる複数の手法を組み合わせる必要がある。質量分析計をベースとしたプロテオーム解析では検出しにくい10kDa以上のタンパク質に注目し、immunodepletion,HPLC,2DEを組み合わせた3 Step法を用いて新たな飲酒マーカーの探索を行った結果、Pigment epithelium-derived factor(PEDF)が見出された(Sogawa K et al:Alcohol Clin Exp Res.35:211-217,2011).同様に3 Step法を乳がんマーカー探索に応用した結果、マーカー候補としてvitronectinが同定され、その結果は免疫組織化学染色でも確認された(Kadowaki M et al:JCance rRes Clin Oncol. 137:1105-1115,2011)慢性血栓塞栓性肺高血圧症(CETPH)は、主症状が非特異的であり有効なバイオマーカーが求められている。MALDI-TOF MSによる血清ペプチドーム解析の結果、m/z2989のペプチドが、健常群および他疾患患者群と比較し、CTEPH群において有意に高値を示すことを見出した(Yano T et al:Circulation Journal.75:2675-2682,2011).
当研究室で以前に習慣飲酒マーカーとして見出したfibrinogen alpha C-chain 5.9 kDa fragment(FIC5.9)の測定を実用的にするためにELISA法を構築した。その結果、飲酒マーカーに加えて、早期の肝線維化マーカーとしての可能性が示唆された(Noda K et al:Proteomics Clin Appl 5:141-146,2011)
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
複数のプロテオーム解析法を組み合わせた血清バイオマーカー探索を行い、種々の病態化で変動する蛋白質・ペプチドの同定に成功し、その診断的意義を明らかにして論文発表もできている。
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| Strategy for Future Research Activity |
deep proteomeを超選択的に解析することは容易でない。そこで、今年度はいわゆるtissue to serum strategyによるマーカー探索を行う。すなわち原発性肝細胞癌、膵癌を対象に、切除標本をもちいて癌部・非癌部の発現プロテオーム比較解析を行い、違いの見られた蛋白質の fragment あるいはそれに対する自己抗体が血中で認められるか否かを検証するアプローチを行う。肝癌では40例、膵癌では20例を対象とする。平行して、両者の細胞株(少なくとも各3種類)の培養上清のsecretome解析をおこないマーカー候補を探索し、有望なものについては血中での存在の有無を確認する。上記を検証するための臨床検体はすでに保存されている。
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[Journal Article] Identification of vitronectin as a novel serum marker for early breast cancer detection using a new proteomic approach2011
Author(s)
Kadowaki M, Sangai T, Nagashima T, Sakakibara M, Yoshitomi H, Takano S,Sogawa K, Umemura H, Fushimi K, Nakatani Y, Nomura F, Miyazaki M
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Journal Title
J Cancer Res Clin Oncol
Volume: 137(7)
Pages: 1105-15
Peer Reviewed
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[Journal Article] Identification of a high molecular weight kininogen fragment as a marker for early gastric cancer by serum proteome analysis2011
Author(s)
Umemura H, Togawa A, Sogawa K, Satoh M, Mogushi K, Nishimura M, Matsushita K, Tanaka H, Takizawa H, Kodera Y, Nomura F
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Journal Title
J Gastroenterol
Volume: 46(5)
Pages: 577-85
Peer Reviewed
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[Journal Article] The application of a three-step proteome analysis for identification of new biomarkers of pancreatic cancer2011
Author(s)
Abulaizi M, Tomonaga T, Satoh M, Sogawa K, Matsushita K, Kodera Y, Obul J, Takano S, Yoshitomi H, Miyazaki M, Nomura F
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Journal Title
Int J Proteomics
Volume: 628787
Peer Reviewed
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