2011 Fiscal Year Annual Research Report
クロマチンリモデリングを介したABO式血液型遺伝子の発現調節機構の解明
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22390140
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| Research Institution | Gunma University |
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Principal Investigator |
小湊 慶彦 群馬大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (30205512)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中島 たみ子 群馬大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (40008561)
佐野 利恵 群馬大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (70455955)
浅尾 高行 群馬大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (40212469)
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| Keywords | ABO式血液型遺伝子 / エンハンサー |
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| Research Abstract |
ABO式血液型は個人識別に重要な指標として法医学、犯罪鑑識において利用されている。しかしながら、細胞特異的発現、コード領域に変異を伴わない亜型等の原因は未だ解明されていない。これらを解明するため、ABO式血液型遺伝子の転写調節機構を調べてきた。近年、転写調節領域を示唆するDNase I hypersensitive site(DHS)やクロマチン修飾がゲノムワイドに示され、ABO遺伝子周辺にいくつかのエンハンサー候補が示唆されている。我々はABO遺伝子の周辺約35kbについて、DHSを含む6箇所の領域をPCR増幅若しくはゲノムDNAクローンHG-1から準備し、それらをプロモーター領域上流に組み込んだレポータープラスミドを作製した。それらを赤白血病細胞K562、胃がん細胞KATOIII、胚線維芽細胞OUMS-36T-1に遺伝子導入した。ルシフェラーゼアッセイにより各領域における転写活性を調べたところ、ABO遺伝子第1イントロン内の+5.8kb siteに転写活性化領域を見出した。また、その活性は赤血球系細胞特異的であった。そこで、赤血球上では抗原量が減少しているが、分泌液中ではその量に変化がない、血液型亜型Bmにおいて第1イントロンの構造を解析することとした。Bm及びABm型112人及び正常血液型1005人から、同意を得てDNAを採取した。本研究は群馬大学医学部倫理委員会で承認済である。Bm型の+5.8kb siteの転写活性化領域周辺を数種類のプライマーでPCR増幅した結果、Bm型では第1イントμンの転写活性化領域を含む約5.8kbが欠損していることが判明した。Bm及びABm型112例中111例に同様の欠損が認められ、1例にはその欠損が認められなかった。以上より、+5.8kb siteが赤血球系細胞においてエンハンサーとして機能している可能性が示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
赤血球系細胞特異的エンハンサーを発見し、そのエンハンサーを含む第1イントロンの欠失が血液型亜型Bmの原因であることを究明でき、Bm型の遺伝子診断方法を確立できたため。
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| Strategy for Future Research Activity |
(1)赤血球系細胞特異的エンハンサーに働く、転写因子の同定を行うこと
(2)細胞分化において赤血球系細胞特異的エンハンサーが果たす役割を検索すること
(3)血液型亜型Bmの原因をさらに確かめるため、遺伝子の発現低下と遺伝子の欠損による影響を検索すること
(4)エンハンサーを含む第1イントロンの欠失がないBm型があるが、その原因を調べること
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[Journal Article] Nonsynonymous single-nucleotide polymorphisms of the htman apoptosis-related endonuclease--DNA fragmentation factor beta polypeptide, endonuclease G, and Flap endonuclease-1--genes show a lowdegree of genetic heterogeneity2012
Author(s)
Takeshita H, Fujihara J, Ueki, M, Iida R, Koda Y, Soejima M, Yuasa I, Kato H, Nakajima T, Kominato Y, Yasuda T
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Journal Title
DNA Cell Biol
Volume: 31
Pages: 36-42
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Identification of the Brackish Water Clam Corbicula Japonica (Japanese Name, Yamato-Shijimi) and Specification of the Growing District by Polymerase Chain Reaction (PCR)-Based Analysis of Mitochondrial DNA2011
Author(s)
Fujihara J, Yasuda T, Ueki M, Fujita Y, Nakamura M, Oshiumi C, Hosozawa T, Nabika T, Harada Y, Kobayashi T, Nakajima T, Takeshita H
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Journal Title
Environmental Forensics
Volume: 12
Pages: 156-161
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genetic variation of FUT2 in a Vietnamese population : identification of two novel Se enzyme-inactivating mutations
Author(s)
Soejima M, Fujimoto R, Agusa T, Iwata H, Fujihara J, Takeshita H, Minh TB, Trang PT, Viet PH, Nakajima T, Yoshimoto J, Tanabe S, Koda Y
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Journal Title
Transfusion
Volume: (in press)
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Expression of ABO blood-group genes is dependent upon an erythroid cell-specific regulatory element, which is deleted in individuals with the Bm phenotype
Author(s)
Sano R, Nakajima T, Takahashi K, Kubo R, Kominato Y, Tsukada J, Takeshita H, Yasuda T, Ito K, Maruhashi T, Yokohama A, Isa K, Ogasawara K, Uchikawa M
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Journal Title
DOI
Peer Reviewed
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