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2012 Fiscal Year Annual Research Report

アジアを席巻する新変異型、新興型ロタウイルス感染症の流行動態と蔓延の分子機序

Research Project

Project/Area Number 22406017
Section海外学術
Research InstitutionSapporo Medical University

Principal Investigator

小林 宣道  札幌医科大学, 医学部, 教授 (80186759)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鷲見 紋子  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (10363699)
ゴッシュ ソウビック  札幌医科大学, 医学部, 助教 (30597175)
漆原 範子  札幌医科大学, 医学部, 講師 (80396308)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywordsロタウイルス / 全遺伝子分節 / 遺伝子配列 / 系統解析 / アジア / 変異型 / リアソートメント
Research Abstract

本年度は、アジアにおける新変異型のヒトロタウイルスとして、遺伝子型G9P[19]、G3P[9]、P[10]のウイルス株、およびコモンな型G1P[8]の全遺伝子配列を解析した。タイで分離されたMc323、Mc345株のG,P遺伝子型はG9P[19]、全ゲノムによる遺伝子型はG9-P[19]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1 と決定された。両株の遺伝子配列は互いに高い一致率を示し、かつ多くの遺伝子分節がブタロタウイルスと高い相同性を示した。従ってこれらはブタから直接ヒトに伝播したウイルスであると推定された。G3P[9]はヒトロタウイルスにおける稀な遺伝子群でイヌ、ネコのロタウイルスに近いことが知られるが、今回の研究において中国で2株のG3P[9]株が分離された。全遺伝子配列の解析の結果、これらの株はイヌ、ネコのロタウイルスに近縁であり、それらの動物を起源としていることが示唆された。P[10]はヒトロタウイルスではきわめて稀なP型であるが、インドネシアで下痢症から分離された69M、57M株は各々G8P[10]、G4P[10]型を有する。これらの株の全遺伝子配列の解析では、遺伝子分節がヒトロタウイルスの2種類の遺伝子群(WaおよびDS1)、偶蹄類のロタウイルスの遺伝子分節が組み合わされたリアソータントであることが明らかとなった。G1P[8]ロタウイルスはヒトにおける最も多い型として、世界中に普遍的に見られる。中国ではしばらく優勢であったG3P[8]が最近減少し、G1P[8]が最も高頻度になっている。今回中国武漢市で検出された最近の3株のG1P[8]ロタウイルスのゲノムを解析したところ、1株のみブタロタウイルス由来と思われるNSP3遺伝子を有していた点以外は、いずれも近年アジアに分布する主流行型のウイルスと近縁であることがわかった。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2013 2012

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] The origin of two rare human P[10] rotavirus strains.2013

    • Author(s)
      Ghosh S, Urushibara N, Kawaguchiya M, Shintani T, Kobayashi N
    • Journal Title

      Infect Genet Evol

      Volume: 13 Pages: 292-300

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Whole genomic analyses of asymptomatic human G1P[6], G2P[6] and G3P[6] rotavirus strains reveal intergenogroup reassortment events and genome segments of artiodactyl origin.2013

    • Author(s)
      Ghosh S, Urushibara N, Chawla-Sarkar M, Krishnan T, Kobayashi N.
    • Journal Title

      Infect Genet Evol

      Volume: 16C Pages: 165-173

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2012.12.019

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complex evolutionary patterns of two rare human G3P[9] rotavirus strains possessing a feline/canine-like H6 genotype on an AU-1-like genotype constellation.2013

    • Author(s)
      Wang YH, Pang BB, Zhou X, Ghosh S, Tang WF, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Kobayashi N.
    • Journal Title

      Infect Genet Evol

      Volume: 16C Pages: 103-112

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2013.01.016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Whole genomic analysis of human G1P[8] rotavirus strains from different age groups in China.2012

    • Author(s)
      Shintani T, Ghosh S, Wang Y-H, Zhou X, Zhou D-J, Kobayashi N.
    • Journal Title

      Viruses

      Volume: 4 Pages: 1289-1304

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Whole genomic analysis reveals the porcine origin of human G9P[19] rotavirus strains Mc323 and Mc345.2012

    • Author(s)
      Ghosh S, Urushibara N, Taniguchi K, Kobayashi N
    • Journal Title

      Infect Genet Evol

      Volume: 12 Pages: 471-477

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2011.12.012

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evidence for the porcine origin of equine rotavirus strain H-1.2012

    • Author(s)
      Ghosh S, Shintani T, Kobayashi N
    • Journal Title

      Vet Microbiol

      Volume: 158 Pages: 410-414

    • DOI

      10.1016/j.vetmic.2012.02.037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Whole-genomic analysis of a human G1P[9] rotavirus strain reveals intergenogroup-reassortment events.2012

    • Author(s)
      Ghosh S, Shintani T, Urushibara N, Taniguchi K, Kobayashi N.
    • Journal Title

      J Gen Virol

      Volume: 93 Pages: 1700-1705

    • DOI

      10.1099/vir.0.043026-0

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Interspecies transmission of rotaviruses evidenced by whole genomic sequence analysis.2013

    • Author(s)
      Kobayashi N, Ghosh S
    • Organizer
      The 17th FAVA (Federation of Asian Veterinary Association) congress
    • Place of Presentation
      台北
    • Year and Date
      20130105-20130106
    • Invited
  • [Presentation] Whole genomic analysis of a rare human G4P[10] rotavirus strain.2012

    • Author(s)
      ゴッシュ ソウビック、漆原範子、川口谷充代、新谷つづみ、小林宣道
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20121113-20121115
  • [Presentation] 全遺伝子配列に基づく中国のG1P[8]ロタウイルス株の系統遺伝学的解析.2012

    • Author(s)
      新谷つづみ、ゴッシュ ソウビック、ワン ユアンホン、小林宣道
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20121113-20121115
  • [Presentation] Whole genomic analysis of G3P[9] rotaviruses fromdiarrheal patients in China.2012

    • Author(s)
      小林宣道、ゴッシュ ソウビック、新谷つづみ、ワン ユアンホン
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20121113-20121115
  • [Presentation] Moleculae epidemiological analysis of G3P[9] rotaviruses from diarrheal patients in China.2012

    • Author(s)
      Kobayashi N, Wang YH, Zhou X, Pang BB, Liu MQ, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Ghosh S
    • Organizer
      The 13th Asia-Pacific congress of Clinical Microbiology and Infection,
    • Place of Presentation
      北京
    • Year and Date
      20121026-20121028
  • [Presentation] Whole genomic analysis of a rare human G1P[9] rotavirus strain.2012

    • Author(s)
      Ghosh S, Shintani T, Taniguchi K, Kobayashi N
    • Organizer
      9th Japan-China Conference of Virology
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20120612-20120613

URL: 

Published: 2014-07-24  

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