2012 Fiscal Year Annual Research Report
ＴＤＰ－４３標的遺伝子・結合タンパク質の網羅的解析
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22500322
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| Research Institution | Meiji Pharmaceutical University |
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Principal Investigator |
佐藤 準一 明治薬科大学, 薬学部, 教授 (30274591)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
天竺桂 弘子 明治薬科大学, 薬学部, 助教 (80434190)
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| Project Period (FY) |
2010-10-20 – 2013-03-31
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| Keywords | TDP-43 / 標的遺伝子 / 結合タンパク質 / 分子ネットワーク / 筋萎縮性側索硬化症 / 神経細胞死 / 次世代シークエンサー / バイオインフォマティクス |
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| Research Abstract |
【目的】TDP-43はN末端側RNA結合ドメインとC末端側タンパク結合ドメインを有する核タンパクある。ALS/FTD脳では、TDP-43が異常リン酸化・ユビキチン化・C末端切断の修飾を受け細胞質へ移行し、封入体を形成する。しかしTDP-43の生理的な機能は明らかでない。最近Freibaumらは質量分析によりヒトTDP-43結合タンパク数百種類を同定した。SephtonらはRIP-seq解析によりラットTDP-43結合RNA数千種類を同定した。本研究ではこれらの網羅的解析データを用いて、TDP-43標的遺伝子と結合タンパクの分子ネットワークの生物学的意味付けを行った。【結果】ラットTDP-43標的遺伝子(n = 4163)の分子ネットワークは、axon guidance, RNA post-transcriptional modification, transcriptional regulation by p53と、ヒトTDP-43結合タンパク(n = 227)の分子ネットワークは、ribosome, spliceosome, protein synthesis, spliceosome assemblyと密接に関連していた。ラット遺伝子IDをヒトに変換しヒトTDP-43標的遺伝子(n = 4063)と結合タンパク(n = 227)を統合した包括的分子ネットワークを解析すると、ribosome, axon guidance, spliceosome, RNA-binding, RNA post-transcriptional modification, transcriptional regulation by p53と関連性を認めた。【結論】TDP-43は核ではspliceosomeと細胞質ではribosomeと密接にリンクし、神経細胞機能維持を制御していると考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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