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2012 Fiscal Year Annual Research Report

臨床検体を用いた統合的オミクス解析による骨転移関連遺伝子の網羅的探索と臨床応用

Research Project

Project/Area Number 22501057
Research Institution独立行政法人国立がん研究センター

Principal Investigator

近藤 格  独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (30284061)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 川井 章  独立行政法人国立がん研究センター, 中央病院, 医長 (90252965)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywords転移性骨腫瘍 / 創薬標的
Research Abstract

蛍光二次元電気泳動法によって同定された転移巣に特徴的なタンパク質について、培養細胞を用いた機能解析を行った。転移巣で発現が増加または減少していたタンパク質について、生理的に重要な役割を果たしていることは知られていたが骨転移に関連した研究は行われていなかったタンパク質を選択し、大腸癌、乳癌、肺癌などの複数の細胞株を用いて抑制実験を行い、増殖・浸潤との機能的な関係を確認した。これらのタンパク質について動物実験にて骨への転移の役割を調べるために、安定抑制系および過剰発現系の細胞を作製する実験に着手した。
PROTOMAP法の予備実験として、分子量分離はするものの分子量情報は用いないGeLC-MS/MS法による発現解析を行った。原発巣に比べ転移巣で発現が有意に変化しているタンパク質を多数同定した。一部は蛍光二次元電気泳動法と共通した結果だったが、同法で検出できなかった差異を多数同定した。同定された分子の中には、機能的に重要な役割を果たす酵素、膜タンパク質、リン酸化酵素が含まれており、抗体で確認もできたことから、PROTOMAP法が効果的なアプローチであることが確認できた。
miRNAについて、原発巣と転移巣の比較を肺癌を対象に行った。851種類のmiRNAをマイクロアレイを用いて観察し、有意な発現差をもつmiRNAを同定した。同定されたmiRNAの中には転移との関連がどの悪性腫瘍においても報告されていなかったものや、転移については調べられているものの骨転移については調べられていなかったものなどが含まれていた。
臨床検体を用いた解析により、骨転移に関連するタンパク質およびmiRNAとして重要と考えられる分子を多数同定した。次のステップに向けて、培養細胞による実験データをもとに動物実験による機能的な検証実験に着手でき、また、新しい手法の有用性を確認することができた。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (14 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 3 results) Book (2 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis reveal proteomic intra-tumor heterogeneity in colorectal cancer2013

    • Author(s)
      Sugihara Y, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Kubota D, Ichikawa H, Fujita S, Kondo T
    • Journal Title

      J Proteomics

      Volume: 78 Pages: 134-47

    • DOI

      doi: 10.1016/j.jprot.2012.11.009.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Proteomic identification of the macrophage-capping protein as a protein contributing to the malignant features of hepatocellular carcinoma2013

    • Author(s)
      Kimura K, Ojima H, Kubota D, Sakumoto M, Nakamura Y, Tomonaga T, Kosuge T, Kondo T
    • Journal Title

      J Proteomics

      Volume: 78 Pages: 362-73

    • DOI

      doi: 10.1016/j.jprot.2012.10.004.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Proteomic-based identification of the APC-binding protein EB1 as a candidate of novel tissue biomarker and therapeutic target for colorectal cancer2012

    • Author(s)
      Sugihara Y, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Kubota D, Ichikawa H, Sakamoto K, Nakamura Y, Tomonaga T, Fujita S, Kondo T
    • Journal Title

      J Proteomics

      Volume: 75 Pages: 5342-55

    • DOI

      doi: 10.1016/j.jprot.2012.06.013.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Decreased selenium-binding protein 1 enhances glutathione peroxidase 1 activity and downregulates HIF-1α to promote hepatocellular carcinoma invasiveness2012

    • Author(s)
      Huang C, Ding G, Gu C, Zhou J, Kuang M, Ji Y, He Y, Kondo T, Fan J
    • Journal Title

      Clin Cancer Res

      Volume: 18 Pages: 3042-53

    • DOI

      doi: 10.1158/1078-0432.CCR-12-0183.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel application for pseudopodia proteomics using excimer laser ablation and two-dimensional difference gel electrophoresis2012

    • Author(s)
      Ito A, Mimae T, Yamamoto YS, Hagiyama M, Nakanishi J, Ito M, Hosokawa Y, Okada M, Murakami Y, Kondo T
    • Journal Title

      Lab Invest

      Volume: 92 Pages: 1374-85

    • DOI

      doi: 10.1038/labinvest.2012.98.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Proteomics and immunohistochemistry validation established pfetin as a novel prognostic biomarker in gastrointestinal stromal tumor2013

    • Author(s)
      近藤格
    • Organizer
      Proteomics Forum 2013
    • Place of Presentation
      ベルリン ドイツ
    • Year and Date
      20130317-20130321
    • Invited
  • [Presentation] Proteomic approach revealed novel prognostic biomarkers in gastrointestinal stromal tumor (GIST)2012

    • Author(s)
      近藤格
    • Organizer
      17th Annual Connective Tissue Oncology Society Meeting
    • Place of Presentation
      プラハ チェコ
    • Year and Date
      20121114-20121117
  • [Presentation] Cancer proteomics for biomarker development for personalized medicine; lessons from biomarker study in gastrointestinal stromal tumor2012

    • Author(s)
      近藤格
    • Organizer
      6th Central and Eastern European Proteomic Conference
    • Place of Presentation
      ブダペスト ハンガリー
    • Year and Date
      20121014-20121017
    • Invited
  • [Presentation] Proteomic approach for biomarker discovery towards personalized medicine2012

    • Author(s)
      近藤格
    • Organizer
      Human Proteome Organisation, 11th Annual World Congress
    • Place of Presentation
      シエナ イタリア
    • Year and Date
      20120909-20120913
    • Invited
  • [Presentation] Proteomics for biomarker development to personalized medicine2012

    • Author(s)
      近藤格
    • Organizer
      Asia Oceania Human Proteome Organization 6th Congress
    • Place of Presentation
      北京 中国
    • Year and Date
      20120505-20120507
  • [Book] 新臨床腫瘍学2012

    • Author(s)
      近藤格
    • Total Pages
      755
    • Publisher
      南江堂
  • [Book] 金原出版2012

    • Author(s)
      近藤格
    • Total Pages
      383
    • Publisher
      臨床プロテオミクス
  • [Remarks] 創薬プロテオーム研究分野

    • URL

      http://www.ncc.go.jp/jp/nccri/divisions/p09prote/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 分析方法2013

    • Inventor(s)
      木下英樹、鵜沼豊、近藤格
    • Industrial Property Rights Holder
      国立がん研究センター、シャープ株式会社
    • Industrial Property Number
      特許,特願2013-71753
    • Filing Date
      2013-03-29

URL: 

Published: 2014-07-24  

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