2011 Fiscal Year Annual Research Report
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22510223
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
石川 淳 国立感染症研究所, 生物活性物質部, 室長 (40202957)
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| Keywords | ゲノム / 抗生物質 / 創薬 / 生物活性物質 / 応用微生物 / 次世代シークエンサー |
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| Research Abstract |
本研究は、次世代シークエンサーを用いてNocardia brasiliensis IFM 0406のゲノムをシークエンスし、本菌が生産する複数の生物活性物質の生合成遺伝子の同定を試み、より多くの未知ゲノムにアプローチするための手法の確立を目指すことを目的とする。
前年度に見出した二次代謝産物生合成遺伝子クラスターのうち、II型ポリケチド合成酵素遺伝子と予測される遺伝子を含むクラスター(hsnと命名)をクローニングするために、コスミドライブラリーをRed-ET法を用いてスクリーニングした結果、複数のコスミドによりhsnクラスター全体を得ることができた。次にRed-ET法で用いたマーカー遺伝子を取り除く事を試みたが、マーカー遺伝子を取り除くと宿主大腸菌に毒性を持つらしく、いまだ成功していない。
一方、hsnクラスターには、二次代謝産物生合成遺伝子クラスターに特徴的に存在するSARPファミリーに属すると予測される遺伝子が2個(SARP1およびSARP2)存在するため、これを人為的に過剰発現することで、クラスター全体の発現の活性化を試みた。まずSARP1とSARP2それぞれをNocardia-E.coliシャトルベクターにクローニングし、さらにSARP1とSARP2をタンデムに連結し、同時に発現されるようにしたものも構築した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
クラスター全体をひとつのベクターに組み込む計画だが、クラスター内の遺伝子(あるいはその産物)のどれかが大腸菌に毒性を持つなどの理由で、いまだ達成されていない。
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| Strategy for Future Research Activity |
クラスター全体をひとつのベクターに組み込む計画を大腸菌以外を宿主として試みる。調節遺伝子の過剰現発現株に関しては、生産物を特定できるところまで進めたい。
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