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2012 Fiscal Year Annual Research Report

ブルー銅蛋白質の電子状態を制御する弱い相互作用に関する研究

Research Project

Project/Area Number 22550145
Research InstitutionIbaraki University

Principal Investigator

高妻 孝光  茨城大学, 理工学研究科, 教授 (50215183)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 海野 昌喜  茨城大学, フロンティア応用原子科学研究センター, 准教授 (10359549)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywordsブルー銅蛋白質 / シュウドアズリン / X線結晶構造解析 / X線吸収スペクトル
Research Abstract

蛋白質において、アミノ酸側鎖間に働く弱い相互作用は、蛋白質機能の発現に重要な役割を果たしていると考えられているが、水素結合以外の弱い相互作用を検出して、その構造と機能、ダイナミクスとの相関を系統的に検討した例は、研究代表者である高妻らによるもの以外は、ほとんどない。本研究では、弱い相互作用の検出が比較的容易なブルー銅蛋白質を主として用い、蛋白質における弱い相互作用の伝達様式、加成性等を、各種分光法、X線結晶構造解析によって実験的に、詳細に調べ、弱い相互作用と蛋白質構造・機能・ダイナミクスとの相関を明らかにする。
蛋白質における弱い相互作用の役割を調べるために、シュウドアズリンの活性中心近傍に相互作用可能な側鎖をもつアミノ酸の導入を行なった蛋白質、および野生型シュウドアズリンのX線結晶構造解析を高分解能で行なったところ、野生型シュウドアズリンでは、活性中心の銅原子がAxialとRhombicの2つの位置をとることが見いだされ、これまでEPRで評価していたそれぞれのコンフォーマーの割合と一致することが判明した。また、Met16His、Met16Phe、Met16Ile、His6Val変異体のX線結晶構造解析に成功し、Met16X変異体においては、置換したアミノ酸の側鎖と銅原子に配位しているHis81のイミダゾール環との間の相互作用が生じており、相互作用の強さによって、構造の変化の度合いが影響を受け、分光学的性質が著しく変化することが明らかとなった。
シュウドアズリンのCuのK吸収端でのX線吸収スペクトルの計測を行なったところ、Met16Phe変異体のK吸収端のエネルギーは、野生型に比べて低エネルギー側にシフトしていることが見いだされ、活性中心の電子密度が高くなっていることが判明した。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (14 results)

All 2013 2012

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (12 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] X-ray Absorption Spectroscopy of an Unusual Plastocyanin from a Fern, Dryopteris crassirhizoma2013

    • Author(s)
      Hiromi Togashi, Junko Yano, Vittal K. Yachandra, and Takamitsu Kohzuma
    • Journal Title

      Chem. Lett

      Volume: 42 Pages: 89-90

    • DOI

      DOI:10.1246/cl.2013.89

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Direct electron transfer from pseudoazurin to nitrous oxide reductase in catalytic N2O reduction2012

    • Author(s)
      Koyu Fujita
    • Journal Title

      Journal of Inorganic Biochemistry

      Volume: 115 Pages: 163-173

    • DOI

      10.1016/j.jinorgbio.2012.07.013

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Alcaligenes xylosoxidans由来シトクロムc’の全体構造及び電子状態のpH依存性と相関2013

    • Author(s)
      高階明子, Michael Tiedemann, 海野昌喜, Martin Stillman, (高妻孝光)
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      立命館大学
    • Year and Date
      20130322-20130325
  • [Presentation] ブルー銅タンパク質シュウドアズリンH6V変異体の構造と性質2013

    • Author(s)
      坂入剛、海野昌樹、(高妻孝光)
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      立命館大学
    • Year and Date
      20130322-20130325
  • [Presentation] Unique Electronic Structure and Dynamics of Cytochrome c' from Alcaligenes xylosoxidans2012

    • Author(s)
      高階明子, Michael Tiedemann, 海野昌喜, Martin Stillman, (高妻孝光)
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡
    • Year and Date
      20121213-20121214
  • [Presentation] Alcaligenes xylosoxidas由来シトクロームc'の分光学的性質及びpH依存性2012

    • Author(s)
      高階明子, Michael Tiedemann, 海野昌喜, Martin Stillman, (高妻孝光)
    • Organizer
      第85回日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡
    • Year and Date
      20121211-20121212
  • [Presentation] ヘムタンパク質シトクロームc’の特異的pH依存性2012

    • Author(s)
      高階明子, Michael Tiedemann, 海野昌喜, Martin Stillman, (高妻孝光)
    • Organizer
      第23回日本化学会関東支部茨城地区研究交流会
    • Place of Presentation
      日立市シビックセンター
    • Year and Date
      20121130-20121130
  • [Presentation] 福島第一原子力発電所事故に伴う放射性物質放出と環境・食品への影響, リスクコミュニケーション2012

    • Author(s)
      (高妻孝光)
    • Organizer
      日本分析化学会第61年会
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      20120921-20120921
    • Invited
  • [Presentation] Dynamic and Static Structures and Properties of Cytochrome c’ from Alcaligenes xylosoxidans NCIMB 110152012

    • Author(s)
      Akiko Takashina, Michael Tiedemann, Martin Stillman, (Takamitsu Kohzuma)
    • Organizer
      11th European Biological Inorganic Chemistry Conference
    • Place of Presentation
      Granada, Spain
    • Year and Date
      20120911-20120915
  • [Presentation] Weak Interaction Effects on the Protein Stability of Blue Copper Protein, Pseudoazurin from Achromobacter cycloclastes IAM 10132012

    • Author(s)
      T. Yamaguchi, Y, Nihei, S. Asamura, D. Sutherland, M. Stillman, (T. Kohzuma)
    • Organizer
      11th European Biological Inorganic Chemistry Conference
    • Place of Presentation
      Granada, Spain
    • Year and Date
      20120911-20120915
  • [Presentation] Switch Effect Induced by the Newly Introduced Uncoordinated Histidine in the Vicinity of the Blue Copper Active Site: High Resolution X-ray Crystallographic, Spectroscopic, and Electrochemical Studies of Met16His Pseudoazurin2012

    • Author(s)
      (Takamitsu Kohzuma), Sayaka Asamura, Yuko Nihei, Masaki Unno
    • Organizer
      11th European Biological Inorganic Chemistry Conference
    • Place of Presentation
      Granada, Spain
    • Year and Date
      20120911-20120915
  • [Presentation] シトクロームc’のダイナミクスに関する検討2012

    • Author(s)
      高階明子, Michael Tiedemann, 海野昌喜, Martin Stillman, (高妻孝光)
    • Organizer
      第22回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      20120531-20120601
  • [Presentation] Structure and Properties of a Blue Copper Protein, Pseudoazurin His6Val Mutant2012

    • Author(s)
      坂入剛、松儀可奈子、海野昌樹、(高妻孝光)
    • Organizer
      第22回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      20120531-20120601
  • [Presentation] Two steps alkaline transition of stellacyanin from lacquer tree sap of Okukuji Urushi2012

    • Author(s)
      室矢知徳、高橋里佳、寺門秀人、神長正則、Michael Tiedemann、Martin j. Stillman、 Roman S. Czernuszewicz、(高妻孝光)
    • Organizer
      第22回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      20120531-20120601

URL: 

Published: 2014-07-24  

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