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2012 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝子制御ネットワークに着目した超好熱菌からの有用遺伝子探索

Research Project

Project/Area Number 22550151
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

金井 保  京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 講師 (10346083)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywords超好熱菌 / アーキア / 遺伝子 / 転写制御因子
Research Abstract

精製したTK1136タンパク質に対して、様々なα多糖やp-Nitrophenyl基等の吸光基で修飾された糖基質など、総計40種類の基質と反応させ、その糖加水分解活性・糖転移活性をTLC解析で観察した。しかしながら、これまでに明確な活性を確認するには至っていない。
続いてTK1136遺伝子破壊株を作製した。作成した遺伝子破壊ベクターを用いて、T. kodakarensis KUW1株を形質転換し、ウラシル非要求性を指標として、シングルクロスオーバー相同組換株を単離した。その後、5-フルオロオロチン酸耐性を指標とした単離により、pyrFマーカー脱離して本ORFのみがゲノムより除去された遺伝子破壊株を得た。この遺伝子破壊株の生育が培地中に含まれる炭素源により異なるかを調べるために、基本培地(人工海水塩に酵母エキスとトリプトンを添加)にピルビン酸ナトリウムを添加した培地と、基本培地にマルトデキストリンを添加した培地でそれぞれ生育測定を行った。その結果、TK1136破壊株はどちらの条件でもホスト株と同様に生育し、明確な差は観察されなかった。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2013 2012

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Genetic studies on the virus-like regions in the genome of hyperthermophilic archaeon, Thermococcus kodakarensis2013

    • Author(s)
      Tagashira, K., W. Fukuda, M. Matsubara, T. Kanai, H. Atomi, and T. Imanaka
    • Journal Title

      EXTREMOPHILES

      Volume: 17 Pages: 153-160

    • DOI

      10.1007/s00792-012-0504-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An archaeal histone is required for transformation of Thermococcus kodakarensis2012

    • Author(s)
      Cubonova, L., M. Katano, T. Kanai, H. Atomi, J. N. Reeve, and T. J. Santangelo
    • Journal Title

      J. Bacteriol

      Volume: vol.194 Pages: 6864-6874

    • DOI

      DOI:10.1128/JB.01523-12

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 超好熱性アーキアの環境適応に関わる転写調節因子の解析2013

    • Author(s)
      金井保、武富尚吾、小谷徹、釜下知之、中之庄正弘、今中忠行、跡見晴幸
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス
    • Year and Date
      20130327-20130327
    • Invited
  • [Presentation] 超好熱性アーキアにおける熱ショック応答転写制御因子の機能解析2012

    • Author(s)
      金井保、小谷徹、釜下知之、今中忠行、跡見晴幸
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      20121022-20121022
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisゲノムからの新規転写制御因子の同定2012

    • Author(s)
      山本康之、金井保、跡見晴幸
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      20121022-20121022
  • [Book] Protein Engineering Handbook, vol.3 chap.72013

    • Author(s)
      Kanai, T., H. Atomi
    • Total Pages
      18
    • Publisher
      Wiley-VCH

URL: 

Published: 2014-07-24  

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