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2010 Fiscal Year Annual Research Report

バクテリア型色素体RNA結合因子による葉緑体分化制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22570045
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

楠見 健介  九州大学, 大学院・理学研究院, 助教 (00304725)

Keywords葉緑体 / RNA結合タンパク質 / リボソームRNA / rrnオペロン / 転写制御 / イネ / シロイヌナズナ / 色素体
Research Abstract

(1)大腸菌のリボソームタンパク質情報を基に、NUS1のバクテリアオルソログであるNusBと相互作用する因子の葉緑体オルソログを推定しcpNUSEと命名した。cpNUSEの組換え蛋白質を合成しそれを抗原とした抗体を作成した。これらの因子はリボゾームタンパク質と相互作用し、プレrRNAの認識特異性と結合活性を高める可能性がある。また、これらはP-NIJSに含まれるタンパク質の同定に用いる。(2)rrnオペロンの5'隣接配列に対応するRNAプローブを合成し、NUS1との結合を調べた。すでにNUS1結合領域として、既知の転写開始点を含む250bpの範囲をin vitroタンパク質-RNAゲルシフト解析で同定しているが、さらに相互にオーバーラップする約60bpの9つの領域に分けて、組換えNUS1タンパク質とのin vitroでの結合活性を調べた。シロイヌナズナNUS1とrrn配列を用いて調べたところ、転写開始点PC付近の配列に対応するRNAに最も結合活性が高く、その他の領域では低いことがわかった。また、NUS1と同様にNUS機能ドメインを持つNUS2タンパク質についても、組換え蛋白質を合成し同様の実験を行ったが、NUS1に比べ結合パターン、活性共に異なる結果が得られたため、rrnオペロンに関してはNUS1とは異なる機能を持つと推定される。これらの結果はイネのデータと比較したうえで、NUS1の機能推定の基礎データとする。(3)NUS1タンパク質が他の葉緑体プレRNAに結合する可能性を探索するため、複数の遺伝子の5'UTR領域を対象としてin vitroゲルシフトアッセイにより結合活性を調べ、clpPおよびrbcLの5'UTR領域に結合することが分かった。

  • Research Products

    (5 results)

All 2010 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Chloroplast biogenesis during the early stage of leaf development in rice2010

    • Author(s)
      Kusumi, et al
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 27 Pages: 85-90

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Contribution of chloroplast biogenesis to carbon-nitrogen balance during early leaf development in rice2010

    • Author(s)
      Kusumi, et al
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 123 Pages: 617-622

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] バクテリア型RNA結合領域を持つ葉緑体タンパク質NUSの解析2010

    • Author(s)
      溝山泰徳
    • Organizer
      日本植物学会第74回大会
    • Place of Presentation
      中部大学(愛知)
    • Year and Date
      2010-09-10
  • [Presentation] 原核型RNA結合領域を持つ葉緑体タンパク質NUS1の解析2010

    • Author(s)
      楠見健介
    • Organizer
      日本植物学会九州支部(第60回大会)
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡)
    • Year and Date
      2010-05-22
  • [Remarks]

    • URL

      http://plant.biology.kyushu-u.ac.jp/Index.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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