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2011 Fiscal Year Annual Research Report

クロマチン構造変換にかかわるRNA分子の新規機能

Research Project

Project/Area Number 22570132
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

奥脇 暢  筑波大学, 医学医療系, 准教授 (50322699)

Keywords遺伝子 / 核小体 / 細胞核 / リボソーム / クロマチン / RNA
Research Abstract

本研究では、クロマチン構造制御にかかわるRNA-タンパク質複合体に着目し、クロマチン構造制御にかかわる新規のRNA分子を同定することを目的として研究を進めている。目的達成のため、以下3点について実験を進めた。
1.クロマチン構造変換にかかわるRNA複合体の精製
2.目的RNA分子の配列決定
3.RNA複合体の試験管内再構成
1、2については、核小体タンパク質Nucleophosmin/B23を細胞抽出液から精製し、精製画分に含まれるRNAの配列決定を行った。幾つかのRNA分子がB23とともに精製されることが明らかとなり、B23-RNAの細胞内での相互作用の確認を行った。同定されたRNAはいずれもB23とともに共沈降されるが、どの程度特異性を持って相互作用しているのかは今後さらに検討する必要がある。また、精製されたB23-RNA複合体は、モノヌクレオソームから、ヒストンをはがす活性を有することを見出した。今後、複合体の中のB23とRNAがどのように協調してクロマチン構造変換にかかわるのか、その分子機構を明らかにする。さらに、核小体に局在するヒストンシャペロンNucleolinについてもB23と同様の解析を進めた。NucleolinはB23と同様に、RNA結合依存的に核小体クロマチンにリクルートされ、RNAの転写調節にかかわることを明らかにした。今後、Nucleolin、B23とともに機能するRNA分子を明らかにし、RNA-タンパク質複合体によるクロマチン構造制御機構を明らかにするとともに、これらの複合体の細胞内機能の解明も進める。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

二つのRNA結合活性を有するヒストンシャペロンについて解析を進め、それぞれについて特異的に相互作用するRNAの実体が明らかになりつつある。また、細胞内でのこれらのRNA-タンパク質複合体の機能の解析も進めており、研究計画全般としてはおおむね順調に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

B23の解析を中心にクロマチン構造変換にかかわるRNA分子の候補はすでにいくつか同定された。しかし、これまでのところ、同定されたRNAがどの程度特異的にB23と相互作用し、機能的な複合体を形成しうるのか、明らかにできていない。これまでの解析から、B23はRNAの何らかの構造に親和性を持つものと考えられ、様々な構造をとるRNAを合成し、B23との相互作用を検討していく。また、RNA-タンパク質複合体の細胞内機能についても、核小体クロマチン制御に着目して研究を進める。

  • Research Products

    (11 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (8 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Function of homo- and hetero-oligomers of human nucleoplasmin/nucleophosmin family proteins NPM1, NPM2 and NPM3 during sperm chromatin remodeling2012

    • Author(s)
      Okuwaki M, Sumi A, Hisaoka M, Saotome-Nakamura A, Akashi S, Nishimura Y, Nagata K
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 40(11) Pages: 4861-78

    • DOI

      doi:10.1093/nar/gks162

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] B23/Nucleophosmin is involved in regulation of adenovirus chromatin structure at late infection stages, but not in its replication and transcription2012

    • Author(s)
      Abdus MD.Samad
    • Journal Title

      Journal of General Virology

      Volume: (In press)

    • DOI

      10.1099/vir.0.036665-0

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 分子間・分子内相互作用による核小体ヒストンシャペロンNPM1のRNA結合活性の制御2012

    • Author(s)
      奥脇暢
    • Organizer
      第2回新学術領域「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      千里ライフサイエンスセンター
    • Year and Date
      2012-01-24
  • [Presentation] 天然変性タンパク質Nucleolinによる核小体クロマチン制御機構2012

    • Author(s)
      早乙女愛
    • Organizer
      第2回新学術領域「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      千里ライフサイエンスセンター
    • Year and Date
      2012-01-24
  • [Presentation] Nopp140 regulates rRNA production in both RNA dependent and -independent manners2011

    • Author(s)
      上島州平
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2011-12-14
  • [Presentation] Function of homo- and hetero-oligomers of human Nucleophosmin/Nucleoplasmin family proteins, NPM1, NPM2, and NPM3 in sperm chromatin remodeling2011

    • Author(s)
      奥脇暢
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2011-12-14
  • [Presentation] Intramolecular regulation of the RNA binding activity of nucleolar protein nucleophosmin/B232011

    • Author(s)
      久岡美晴
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2011-12-14
  • [Presentation] ヒストンH1結合因子によるクロマチン動態制御機構2011

    • Author(s)
      加藤広介
    • Organizer
      核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2011-10-26
  • [Presentation] RNA-mediated chromatin association of a nucleolar histone chaperone NucleolinRNA-mediated chromatin association of a nucleolar histone chaperone Nucleolin2011

    • Author(s)
      Ai Saotome and Mitsuru Okuwaki
    • Organizer
      EMBO Workshop Nuclear Structure and Dynamics
    • Place of Presentation
      Isle sur la Sorgue, France
    • Year and Date
      2011-09-30
  • [Presentation] 熱帯熱マラリア原虫pf1-cys-prx遺伝子cis-elementに結合する新奇核内因子の同定およびその性状の解析2011

    • Author(s)
      駒木-安田加奈子
    • Organizer
      第80回日本寄生虫学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2011-07-19
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.md.tsukuba.ac.jp/younginit/okuwaki/Okul/Top.html

URL: 

Published: 2013-06-26   Modified: 2014-06-02  

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