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2012 Fiscal Year Annual Research Report

機能性小分子RNAの網羅的解析による筋線維型調節機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22580326
Research Institution独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構

Principal Investigator

室谷 進  独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 畜産草地研究所 畜産物研究領域, 上席研究員 (50355062)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
KeywordsマイクロRNA / 筋線維型 / ウシ
Research Abstract

本研究では、次世代DNAシーケンサーによりウシ骨格筋に発現するマイクロRNA(miRNA)を網羅的に解析し、肉質の差異に影響を与える筋線維型に関連するmiRNAを明らかにすることを目的としている。ウシ半腱様筋(速筋)と咬筋(遅筋)の間で発現レベルが有意に異なる計38種のmiRNAのうち、miR-1、miR-185、miR-196a、miR-885の発現を定量的RT-PCRで調べた結果、miR-185は咬筋で半腱様筋より高く、ほか3種は半腱様筋で高かった。この結果は次世代DNAシーケンサーにより得られた結果と一致した。特にmiR-196aとmiR-885の2種の発現は咬筋でほとんど認められず、半腱様筋に特異的であった。さらに、ホルスタイン種雌牛より採材した咬筋、横隔膜、半膜様筋、胸最長筋、半腱様筋の5筋肉においてmiR-196aについて定量的RT-PCRで解析すると、miR-196aの発現が半腱様筋と胸最長筋で特に高い結果となった。これに対し、miR-885の発現について同様に調べた結果、咬筋で最低値、半腱様筋で最高値を示し、他3種の筋で中程度の発現が認められたものの、部位間差は有意ではなかった。これらの結果は筋部位間差異がmiR-885よりmiR-196aと密接に関連することを示唆すると考えられた。また、miR-196aの標的として予測されたI型およびIII型コラーゲン各α鎖mRNAの発現は咬筋より半腱様筋で低い値を示し、miR-196aによる両コラーゲンmRNAの発現が制御される可能性を示唆した。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2013

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Profiling of differentially expressed microRNAs and the bioinformatic target gene analyses in bovine fast- and slow-type muscles by massively parallel sequencing.2013

    • Author(s)
      室谷進,谷口雅章,柴田昌宏,大江美香,尾嶋孝一,中島郁世,千國幸一
    • Journal Title

      Journal of Animal Science

      Volume: 91 Pages: 90-103

    • DOI

      doi: 10.2527/jas.2012-5371

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 次世代シーケンサーによるウシ骨格筋microRNAの網羅的発現解析2013

    • Author(s)
      室谷進,谷口雅章,柴田昌宏,大江美香,尾嶋孝一,中島郁世,千國幸一
    • Organizer
      日本畜産学会第116回大会
    • Place of Presentation
      安田女子大学(広島)
    • Year and Date
      20130328-20130330
  • [Presentation] 放牧飼養下における黒毛和種子牛の筋機能関連因子mRNA発現2013

    • Author(s)
      木戸恭子,室谷進,渡邊康一,麻生久
    • Organizer
      日本畜産学会第116回大会
    • Place of Presentation
      安田女子大学(広島)
    • Year and Date
      20130328-20130330
  • [Presentation] 放牧及び飼料イネWCS給与が黒毛和種去勢牛の肥育成績、筋肉内遺伝子発現に及ぼす影響2013

    • Author(s)
      柴田昌宏,松本和典,曳野泰子,室谷進,大江美香,中島郁世,千國幸一,大谷一郎,山本直幸
    • Organizer
      日本畜産学会第116回大会
    • Place of Presentation
      安田女子大学(広島)
    • Year and Date
      20130328-20130330

URL: 

Published: 2014-07-24  

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