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2010 Fiscal Year Annual Research Report

Multiplex定量LAMP法によるヘルペスウイルス迅速診断法の確立

Research Project

Project/Area Number 22590539
Research InstitutionFujita Health University

Principal Investigator

井平 勝  藤田保健衛生大学, 医療科学部, 准教授 (10290165)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 杉山 博子  藤田保健衛生大学, 医学研究科, 研究員 (10387714)
榎本 喜彦  藤田保健衛生大学, 医学研究科, 研究員 (00387713)
吉川 哲史  藤田保健衛生大学, 医学部, 教授 (80288472)
KeywordsLAMP / real-time PCR法 / HSV / Qprobe
Research Abstract

【目的】LAMP法は迅速、簡易という点では非常に優れており、臨床現場での迅速診断法として期待されている。しかし、定量的評価という点では課題が多く、現在スタンダードとされるreal-time PCR法に及ばない。そこでこれまで開発したHSV特異的LAMP法と、近年開発されたグアニン消光現象を利用した蛍光色素プローブ(Qprobe)を組み合わせてHSV DNA量の迅速な測定法開発を試みた。【対象と方法】HSV-1とHSV-2の特異的な遺伝子配列部位にprimerを設定し、標的領域をサブクローニング後、抽出したプラスミドのコピー数を決定し段階希釈してキャリブレーション系列とした。各定量的LAMP法のmixture10μlにサンプル15μlを加え、全体量を25μlとした。反応温度と時間は63℃、20分とし、Step one(ABI社)を用いて連続的に蛍光強度変化を測定した。基礎的検討として、5日間の日差再現性と5検体による同時再現性を検討した。臨床応用のための初期検討として、HSV陰性髄液に各ウイルスDNAをスパイクしたサンプルからDNAを抽出、real-time PCR法と定量的LAMP法を行い比較した。【結果】HSV-1、HSV-2特異的定量的LAMP法ともに感度は100コピー/反応であり、プラスミドのコピー数とThreshold time(Tt)との間で高い相関性を認めた。日差再現性、同時再現性の検討でも、CV%は約5%以内と良好な再現性を確認した。初期検討では、real-time PCR法により決定されたウイルスDNA量(HSV-1:10^8~655コピー/反応HSV-2:2×10^9~105コピー/反応)と、LAMP法によるTt値の相関を検討した。その結果、HSV-1でR^2=0.99、HSV-2でR^2=0.96と優れた相関を認めた。
【考察】今回開発した定量的LAMP法は、15分以内で測定可能でありLAMP法の長所である迅速性を保ちつつウイルスDNAの定量的評価が可能であった。また、日差再現性、同時再現性ともに良好で、髄液にウイルスDNAをスパイクした検体においてもreal-time PCR法との間に良好な相関がみられたことから、臨床応用への可能性も高いと考えられる。

  • Research Products

    (5 results)

All 2011 2010

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Different characteristics of human herpesvirus 6 encephalitis between primary infection and viral reactivation.2011

    • Author(s)
      Kawamura Y, et.al
    • Journal Title

      J Clin Virol

      Volume: 51 Pages: 12-19

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of reverse transcription loop-mediated isothermal amplification assays for rapid diagnosis of pandemic influenza A/H1N1 2009 virus.2011

    • Author(s)
      Nakauchi M
    • Journal Title

      J Med Virol.

      Volume: 83 Pages: 10-15

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Kinetics of cytokine and chemokine responses in patients with primary human herpesvirus 6 infection.2010

    • Author(s)
      Yoshikawa T
    • Journal Title

      J Clin Virol.

      Volume: 50 Pages: 65-68

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] The development of LAMP assay for quantification of HSV (herpes simplex virus) using quenching probe2010

    • Author(s)
      井平勝, ほか
    • Organizer
      35th Annual International Herpesvirus Workshop
    • Place of Presentation
      USA Utha
    • Year and Date
      2010-07-28
  • [Presentation] Kinetics of Cytokine and Chemokine Responses in Patients with Primary Human Herpesvirus 6 Infection2010

    • Author(s)
      吉川哲史, ほか
    • Organizer
      35th Annual International Herpesvirus Workshop
    • Place of Presentation
      USA Utha
    • Year and Date
      2010-07-28

URL: 

Published: 2012-07-19  

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