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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Multiplex定量LAMP法によるヘルペスウイルス迅速診断法の確立

Research Project

Project/Area Number 22590539
Research InstitutionFujita Health University

Principal Investigator

井平 勝  藤田保健衛生大学, 医療科学部, 准教授 (10290165)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 榎本 喜彦  藤田保健衛生大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (00387713)
杉山 博子  藤田保健衛生大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (10387714)
吉川 哲史  藤田保健衛生大学, 医学部, 教授 (80288472)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
KeywordsHHV6 / Qprobe / GCV耐性 / U69
Research Abstract

本年度は、Qprobeを用いた融解温度解析によるSNPタイピング法の開発を目的に基礎検討を行った。移植後ヘルペスウイルス感染症に対する抗ウイルス薬として用いられるガンシクロビル(GCV)は、HHV-6 U69遺伝子の一塩基置換により耐性をを示すことが実験的に証明されている。U69に存在するGCV耐性に関連するSNPsに対するQprobeを作成し臨床分離株を用いて検討した。【方法】Isegawaらにより供与されたGCV耐性HHV-6B、U69変異遺伝子(M318V、A447D、C448G、L450S、A462D、C463Y)DNAをサブクローニングし、各遺伝子変異を持つプラスミドを作製した。変異領域を3組のprimerで増幅し(region 1-3)、変異位置にQプローブを設定した(3種類)。臨床株は、造血幹細胞移植後に同一患者から反復して分離されたHHV-6B 25株(8名)である。【結果】Region 1での融解温度(Tm)は、HHV-6B標準株 Z29で 42.9℃、M318Vは49.1℃であった。すべての臨床株のTm値はZ29と同じであった。Region 2ではZ29 59.4℃、A447D 56.5℃、 C448G 56.0℃、L450S 53.4℃であった。臨床株のTm値はZ29と一致した。region 3では、Z29の53.5℃、 A462D 53.2℃、 C463Y 48.6℃、A462Dと野生株との判別は困難であった。臨床株のTm値は54.9℃とZ29異なっていたが、HHV-6B標準株HSTとは一致した。ダイレクトシーケンスによってregion 1-3の塩基配列を確認したところ今回スクリーニングした株においてU69耐性遺伝子変異は確認されずQプローブの結果と一致した。【考察】Qプローブ法によるU69変異遺伝子スクリーニング法は臨床分離株の解析に有用であった。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2013 2012

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Analysis of rotavirus antigenemia in hematopoietic stem cell transplant recipients.2012

    • Author(s)
      Sugata K, Taniguchi K, Yui A, Nakai H, Asano Y, Hashimoto S, Ihira M, Yagasaki H, Takahashi Y, Kojima S, Matsumoto K, Kato K, Yoshikawa T.
    • Journal Title

      Transpl Infect Dis.

      Volume: 14(1) Pages: 49-56

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Host factors associated with the kinetics of Epstein-Barr virus DNA load in patients with primary Epstein-Barr virus infection.2012

    • Author(s)
      Nakai H
    • Journal Title

      Microbiol Immunol.

      Volume: 56(2) Pages: 93-98

    • DOI

      10.1111/j.1348-0421.2011.00410.x.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of quantitative RT-PCR assays for detection of three classes of HHV-6B gene transcripts.2012

    • Author(s)
      Ihira Masaru
    • Journal Title

      J Med Virol.

      Volume: 84(9) Pages: 1388-1395

    • DOI

      10.1002/jmv.23350.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Posterior reversible encephalopathy syndrome in a child with post-transplant HHV-6B encephalitis.2012

    • Author(s)
      Kawamura Y
    • Journal Title

      Bone Marrow Transplant.

      Volume: 47(10) Pages: 1381-1382

    • DOI

      10.1038/bmt.2012.42.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Analysis of HHV-6 TRS copy numbers in clinical isolates: Possibility of superinfection2013

    • Author(s)
      Kato Yuri
    • Organizer
      8th International Conference on Human Herpesviruses 6 and 7
    • Place of Presentation
      Paris France
    • Year and Date
      20130407-20130411
  • [Presentation] Direct detection of HHV-6 DNA from serum by LAMP method using newly developed dry reagent2013

    • Author(s)
      Ihira Masaru
    • Organizer
      8th International Conference on Human Herpesviruses 6 and 7
    • Place of Presentation
      Paris France
    • Year and Date
      20130407-20130411
  • [Presentation] Cytokine and chemokine response in the blood and cerebrospinal fluid of human herpesvirus 6B associated acute encephalopathy with biphasic seizures and late reduced diffusion2013

    • Author(s)
      Kawamura Yoshiki
    • Organizer
      8th International Conference on Human Herpesviruses 6 and 7
    • Place of Presentation
      Paris France
    • Year and Date
      20130407-20130411
  • [Presentation] Dual roles of telomeric repeats in chromosomally integrated human herpesvirus-62013

    • Author(s)
      OhyeTamae
    • Organizer
      8th International Conference on Human Herpesviruses 6 and 7
    • Place of Presentation
      Paris France
    • Year and Date
      20130407-20130411
  • [Presentation] HHV-6重感染の可能性解析:TRS繰り返し回数の検討2012

    • Author(s)
      加藤友理
    • Organizer
      第7回日本臨床検査学教育学会学術大会
    • Place of Presentation
      愛知 日本
    • Year and Date
      20120822-20120824
  • [Book] 臨床工学講座 生体計測装置学(第3版)2013

    • Author(s)
      井平 勝
    • Total Pages
      337
    • Publisher
      医歯薬出版

URL: 

Published: 2014-07-24  

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