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2012 Fiscal Year Annual Research Report

アジアにおけるウイルス性胃腸炎起因ウイルスの分子疫学的研究

Research Project

Project/Area Number 22590620
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

沖津 祥子  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (10082215)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywords感染症 / ウイルス / アジア / 動物 / 下痢症
Research Abstract

1.2010~2011年、タイ・チェンマイでウイルス性下痢症の分子疫学を行った。411便検体中50%が陽性、ノロウイルスGIIが16%、A群ロタウイルスが15%、ヒトボカウイルスが6%、アデノウイルスが5%、エンテロウイルスが4%、ヒトパレコウイルスが1%であった。アストロウイルス、サフォルドウイルス、サポウイルス、アイチウイルス、コサウイルスは1%以下であった。ロタウイルスはG1P[8]が45%、G9P[8]が36%であった。ノロウイルスはGII/4の2010変異型が多数を占めた。2.2011~2013年、日本のウイルス性下痢症の分子疫学を731便検体で検討した。63%が陽性で、ノロウイルスが40%、ロタウイルスが10%、ヒトボカウイルスが10%、パレコウイルスが8%、エンテロウイルスが7%、アストロウイルスが5%、サポウイルスが4%、サフォルドウイルスが1%であった。ノロウイルスはGII/4が優勢で、特に2012年晩期では2012変異型が多く見られた。P2領域の4つのアミノ酸に置換が見られた。ロタウイルスはG1P[8]が54%、G3P[8]が36% 、G9P[8]が3%、G3+G9P[8] が3%、G3P[4] が2%、G1+G3P[4] が1%検出された。3.タイの198例の小児下痢症患者便検体でロタウイルス、アデノウイルス、ノロウイルス抗原同時検出キットの評価を行った。PCRと精度は同等だが感度がノロウイルス、アデノウイルスで低かった。4.チェンマイの下痢症の仔ブタのA群ロタウイルス4株について、全11ゲノムの解析を行った。遺伝子型間、遺伝子型内での遺伝子再集合が観察された。一方、遺伝子分節によっては約20年前の株の遺伝子が保存されていた。まれなNSP3 T7遺伝子型がタイで初めて検出され、これはこの遺伝子型がブタ由来であることを支持する結果であった。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (28 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (17 results) (of which Peer Reviewed: 14 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] Prevalence, seasonality, and peak age of infection of enteric adenoviruses in Japan, 1995-20092013

    • Author(s)
      Dey SK, Okitsu S, et al.
    • Journal Title

      Epidemiol Infect

      Volume: 141(5) Pages: 958-60

    • DOI

      DOI:10.1017/S0950268812001586

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reemergence of New Variant G3 Rotavirus in Japanese Pediatric Patients, 2009-20112013

    • Author(s)
      Thongprachum A
    • Journal Title

      Infect Genet Evol

      Volume: 13 Pages: 168-174

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2012.09.0.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Three clusters of Saffold viruses circulating in children with diarrhea in Japan2013

    • Author(s)
      Khamrin P
    • Journal Title

      Infect Gent Evol

      Volume: 13 Pages: 339-343

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2012.11.004

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular epidemiology and disease severity of human respiratory syncytial virus in Vietnam2013

    • Author(s)
      Tran DN
    • Journal Title

      PLOS One

      Volume: 8 Pages: e45436

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0045436

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Emergence of Norovirus GII/4 2006a and 2006b Variants in Hospitalized Children with Acute Gastroenteritis in Thailand2013

    • Author(s)
      Thongprachum A
    • Journal Title

      Clin Lab

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.7754/Clin.Lab.2012.120316

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete genome sequence analysis of novel human bocavirus reveals genetic recombination between human bocavirus 2 and human bocavirus 42013

    • Author(s)
      Khamrin P
    • Journal Title

      Infect Genet Evol

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      not assigned

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ウイルス性胃腸炎の検査・診断2013

    • Author(s)
      沖津祥子
    • Journal Title

      臨床検査

      Volume: 57 Pages: 65-72

  • [Journal Article] Sequence analysis of porcine kobuvirus VP1 region detected in pigs in Japan and Thailand2012

    • Author(s)
      Okitsu S, et al.
    • Journal Title

      Virus Genes

      Volume: 44(2) Pages: 253-257

    • DOI

      DOI:10.1007/s11262-011-0692-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection and molecular characterization of cosavirus in adults with diarrhea, Thailand2012

    • Author(s)
      Khamrin P,
    • Journal Title

      Virus Genes

      Volume: 44 Pages: 244-246

    • DOI

      10.1007/s11262-011-0700-y

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Circulating of human bocavirus 1, 2, 3, and 4 in pediatric patients with acute gastroenteritis in Thailand2012

    • Author(s)
      Khamrin P
    • Journal Title

      Infect Genet Evol

      Volume: 12 Pages: 565-569

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2012.01.025

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of human bocavirus 1 and 2 from children with acute gastroenteritis in Japan2012

    • Author(s)
      Khamrin, P
    • Journal Title

      J Med Virol

      Volume: 84 Pages: 901-905

    • DOI

      10.1002/1mv.23274

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Emergence of a new norovirus GII.6 variant in Japan, 2008-20092012

    • Author(s)
      Chan-It W
    • Journal Title

      J Med. Virol

      Volume: 84 Pages: 1089-1096

    • DOI

      10.1002/jmv.23309

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation and comparison of the efficiency of immunochromatography methods for Norovirus detection2012

    • Author(s)
      Thongprachum A
    • Journal Title

      Clin Lab

      Volume: 58 Pages: 489-493

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comparison of immunochromatography, PCR and culture methods for the detection of campylobacter bacteria2012

    • Author(s)
      Dey SK
    • Journal Title

      J Microbiol Methods

      Volume: 91 Pages: 566-568

    • DOI

      10.1016/j.mimet.2012.09.034

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transient heating of expressed breast milk up to 65℃ inactivates HIV-1 in milk: a simple, rapid, and cost-effective method to prevent postnatal transmission2012

    • Author(s)
      Hoque SA
    • Journal Title

      J Med Virol

      Volume: 85 Pages: 187-193

    • DOI

      10.1002/jmv.23457

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ノロ、ロタ、ピコルナウイルス2012

    • Author(s)
      沖津祥子
    • Journal Title

      臨床と微生物

      Volume: 39 Pages: 677-684

  • [Journal Article] ノロウイルス診断法の最近の知見2012

    • Author(s)
      牛島廣治
    • Journal Title

      小児科臨床

      Volume: 65 Pages: 2577-2582

  • [Presentation] Molecular characterization of human bocavirus isolated from children with acute gastroenteritis in Japan and Thailand2012

    • Author(s)
      Khamrin P
    • Organizer
      The 9th Japna-China International Conference of Virology.
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      20120612-20120613
  • [Presentation] Full genome analysis of rotavirus P[23] colleted from piglets with diarrhea in Thailand, 2006-20082012

    • Author(s)
      Okitsu S
    • Organizer
      The 9th Japna-China International Conference of Virology.
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      20120612-20120613
  • [Presentation] Novel picornaviruses in children and adults with diarrhea, Thailand.2012

    • Author(s)
      Ushijima H
    • Organizer
      The 9th Japna-China International Conference of Virology.
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      20120612-20120613
  • [Presentation] タイ国の健康なブタ血清中のブタコブウイルス

    • Author(s)
      沖津祥子
    • Organizer
      第53回日本臨床ウイルス学会
    • Place of Presentation
      千里ライフサイエンスセンター(大阪府)
  • [Presentation] Picornaviruses associated with gastroenteritis in Japan and Thailand.

    • Author(s)
      Thongprachum A
    • Organizer
      The 16th Annual meeting of Japanese Society for Neurovirology
    • Place of Presentation
      国立感染症研究所(東京都)
  • [Presentation] Reemergence of variant G3 rotavirus in Japanese pediatric patients.

    • Author(s)
      Thongprachum A
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場(大阪府)
  • [Presentation] Human bocavirus in children with respiratory infections in Vietnam

    • Author(s)
      トラン グエン
    • Organizer
      第44回日本小児感染症学会総会・学術集会
    • Place of Presentation
      西日本総合展示場・北九州国際会議場(福岡県)
  • [Presentation] Molecular epidemiology trend of diarrheal viruses circulating in Japanese pediatric patients, 2010-2011

    • Author(s)
      Thongprachum, A
    • Organizer
      第44回日本小児感染症学会総会・学術集会
    • Place of Presentation
      西日本総合展示場・北九州国際会議場(福岡県)
  • [Presentation] ロタウイルスワクチン導入移行期における同ウイルスのG遺伝子型の検討

    • Author(s)
      高梨さやか
    • Organizer
      第9回日本小児消化管感染症研究会・学術集会
    • Place of Presentation
      北浜フォーラム(大阪府)
  • [Presentation] LAMP法など遺伝子診断法によるカンピロバクターの診断-細菌培養との比較-

    • Author(s)
      牛島廣治
    • Organizer
      第9回日本小児消化管感染症研究会・学術集会
    • Place of Presentation
      北浜フォーラム(大阪府)
  • [Presentation] The emergence of norovirus GII/4 2012 outbreak in Japanese pediatric patients

    • Author(s)
      Thongprachum A
    • Organizer
      第9回日本小児消化管感染症研究会・学術集会
    • Place of Presentation
      北浜フォーラム(大阪府)

URL: 

Published: 2014-07-24  

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