2012 Fiscal Year Annual Research Report
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22590712
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| Research Institution | 独立行政法人国立国際医療研究センター |
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Principal Investigator |
河村 由紀 独立行政法人国立国際医療研究センター, その他部局等, その他 (10392391)
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| Project Period (FY) |
2010-04-01 – 2013-03-31
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| Keywords | 消化管 / 糖鎖 / エピゲノム |
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| Research Abstract |
消化管の慢性炎症では、傷害を受けた粘膜修復のために、急速な上皮細胞分裂と機能細胞への分化が起きている。申請者らは潰瘍性大腸炎の再生上皮細胞で見られる糖鎖変化と、その主たる原因として複数の糖鎖合成遺伝子がDNAメチル化亢進により発現抑制されていることを見出した。そこで、傷害を受けた再生上皮の分裂促進およびその後の分化誘導に重要な因子がエピジェネティックな発現制御を受けているのではないかと考え、本研究ではこれらの因子の同定と、その機能解明を目指した。
マウス腸炎モデルを用いて、レトロトランスポゾン抑制に関与する遺伝子とホメオボックス遺伝子の発現が再生上皮で低下していることを見出し、更に瘍性大腸炎においてもヒトホモログの発現低下が同様に起こっていることを明らかにした。正常粘膜ではレトロトランスポゾンの発現はDNAメチル化により抑制されていたが､潰瘍性大腸炎ではL-1トランスポゾンのメチル化レベルの低下が見られた。
最終年度は再生上皮におけるDNAメチル化の機能的意義を解明すべく、セルソーターを用いて分離した再生上皮細胞を、DNAメチル化阻害剤存在下で培養した結果、細胞増殖が著しく抑制された。再生上皮細胞の増殖亢進に関与するDNAメチル化標的遺伝子を網羅的に探索するため、10万個以下の少ない細胞を用いて次世代シークエンサー解析用ライブラリーを作製する方法を確立した。バイオインフォマティックス解析の結果、潰瘍性大腸炎手術組織より分離した上皮細胞において特異的にDNAメチル化修飾を受ける遺伝子群を同定した。オントロジー解析の結果、正常上皮でのみメチル化されている遺伝子には有意に濃縮されているGOは見つからなかったが、再生上皮でDNAメチル化亢進する遺伝子は、転写および分化に関わるものが多く、傷害上皮の再生のための増殖促進におけるエピジェネティック機構の重要性が示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Colonic epithelial cells express specific ligands for macrophage immunosuppressive receptors Siglec-7 and -92012
Author(s)
Miyazaki K, Sakuma K, Kawamura YI, Izawa M, Ohmori K, Mitsuki M, Yamaji T, Hashimoto Y, Suzuki A, Saito Y, Dohi T, Kannagi R
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Journal Title
J Immunol
Volume: 188
Pages: 4690-4700
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The monoclonal antibody HCM31 specifically recognizes the Sda tetrasaccharide in goblet cell mucin2012
Author(s)
Tsubokawa D, Goso Y, Kawashima R, Ota H, Nakamura T, Nakamura K, Sato N, Kurihara M, Dohi T, Kawamura YI, Ichikawa T, Ishihara K
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Journal Title
FEBS Open Bio
Volume: 2
Pages: 223-233
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Genome-wide epigenomic analysis of lamina propria mononuclear cells isolated from patients with inflammatory bowel disease
Author(s)
Kawamura YI, Otsubo T, Oshima K, Endo TA, Toyoda T, Hagiwara T, Kawamura YJ, Konishi F, Yano H, Saito Y, Hattori M, Dohi T
Organizer
The 6th Japan & US Collaboration Conference in Gastroenterology
Place of Presentation
Tokyo, Japan
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[Presentation] DNA hypermethylation of the Sda carbohydrate synthase gene as a possible biomarker for the prognosis of ulcerative colitis
Author(s)
Sakurai T, Kawamura YI, Hagiwara T, Otsubo T, Hirano Maeyasiki C, Kojima Y, Gotoda T, Yano H, Saito Y, Kawamura YJ, Konishi F, Dohi T
Organizer
Digestive Disease Week Annual Meeting
Place of Presentation
San Diego, USA
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[Presentation] IL-13 induces TWEAK-dependent activation of TNF-α and intestinal epithelial cell damage –a pathway associated with ulcerative colitis
Author(s)
Dohi T, Kawashima R, Kawamura YI, Oshio T, Yamazaki M, Hagiwara T, Okada T, Wu P, Szak A, Kawamura YJ, Konishi F, Miyake O, Yano H, Saito Y, Burkly LC
Organizer
Digestive Disease Week Annual Meeting
Place of Presentation
San Diego, USA
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[Presentation] Genome-wide epigenomic analysis of lamina propria mononuclear cells of inflammatory bowel disease
Author(s)
Otsubo T, Kawamura YI, Oshima K, Endo TA, Toyoda T, Hagiwara T, Kawamura YJ, Konishi F, Yano H, Saito Y, Hattori M, Dohi T
Organizer
Digestive Disease Week Annual Meeting
Place of Presentation
San Diego, USA
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