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2011 Fiscal Year Annual Research Report

常染色体劣性遺伝性家族性筋萎縮性側索硬化症の新規原因遺伝子同定

Research Project

Project/Area Number 22590923
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

高橋 祐二  東京大学, 医学部附属病院, 助教 (00372392)

Keywords脳神経疾患 / ゲノム解析 / 連鎖解析 / ALS
Research Abstract

若年発症,緩徐進行性で,上位運動ニューロン障害及び下位運動ニューロン障害を両方呈している,常染色体劣性遺伝性家族性筋萎縮性側索硬化症の小家系に対して,SNPアレイを用いたハイスループット連鎖解析システム(SNP HiTLink)を応用し,連鎖解析を行ったところ,ゲノム上に470.1Mbの候補領域を見いだした.さらに,同様の臨床像を呈した2家系の発端者について,ホモ接合性マッピングを行い,前述の小家系の候補領域と重なる134Mbの領域を見いだした.同領域に存在する遺伝子の全エクソンに対して,特異的なプライマーを作成し,直接塩基配列解析法による変異スクリーニングを行ったが,明らかな変異は認められなかった。これらの結果から,これら3家系は臨床的には類似しているものの,遺伝的異質性があるものと考えられた.そこで,連鎖解析を行った小家系に対して,次世代シーケンサーを用いたエクソーム解析を行い,全エクソンに存在する塩基置換を網羅的に同定することを試みた.全エクソンにおいて,データベース上に存在しない新規の塩基置換で,アミノ酸変化を伴うものを356個同定した.このうち,候補領域に存在し,複合ヘテロ接合性新規非同義塩基置換,あるいはホモ接合性新規非同義塩基置換を有する遺伝子を6遺伝子同定した.ただし,エクソームでキャプチャー出来ていないエクソンが641個存在し,これらに原因遺伝子変異が存在する可能性も否定できないため,今後これらのエクソンをどのように解析するのかが次年度への課題であると考えられた.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初直接塩基配列解析法のみで解析を行う予定であったが,次世代シーケンサーを用いたエクソーム解析を応用することが出来て,より確実に原因遺伝子変異を同定できる可能性が高まったと考えられるため.

Strategy for Future Research Activity

今後は,同定された塩基置換の,正常対照におけるスクリーニング,また他の家系における解析で変異を見いだすことが必要であると考える.そのために,正常対照260例におけるスクリーニングを行うとともに,原因遺伝子未同定のFALS 20家系における解析を追加する.ALSは遺伝的異質性が高いと考えられ,より多くの家系での解析が必要であるため,さらなる検体収集を目指す.

  • Research Products

    (9 results)

All 2012 2011

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Frequency of the C9orf72 hexanucleotide repeat expansion in patients with amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia : a cross-sectional study2012

    • Author(s)
      Majounie, E., et al.
    • Journal Title

      The Lancet Neurology

      Volume: 11 Pages: 323-330

    • DOI

      doi:10.1016/S1474-4422(12)70043-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Neurovascular changes in prolonged migraine aura in FHM with a novel ATP1A2 gene mutation2012

    • Author(s)
      Iizuka, T., et al.
    • Journal Title

      J Neurol Neurosurg Psychiatry

      Volume: 83 Pages: 205-12

    • DOI

      10.1136/jnnp-2011-300843

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comprehensive mutational analysis of LRRK2 reveals variants supporting association with autosomal dominant Parkinson's disease2011

    • Author(s)
      Seki, N., et al.
    • Journal Title

      J Hum Genet

      Volume: 56 Pages: 671-5

    • DOI

      jhg201179 [pii] 10.1038/jhg.2011.79

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluating Japanese patients with the marfan syndrome using high-throughput microarray-based mutational analysis of fibrillin-1 gene2011

    • Author(s)
      Ogawa, N., et al.
    • Journal Title

      Am J Cardiol

      Volume: 108 Pages: 1801-7

    • DOI

      S0002-9149(11)02435-0 [pii] 10.1016/j.amjcard.2011.07.053

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Adult-onset leukoencephalopathies with vanishing white matter with novel missense mutations in EIF2B2, EIF2B3, and EIF2B52011

    • Author(s)
      Matsukawa, T., et al.
    • Journal Title

      Neurogenetics

      Volume: 12 Pages: 259-61

    • DOI

      10.1007/s10048-011-0284-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Posterior column ataxia with retinitis pigmentosa in a Japanese family with a novel mutation in FIVCR12011

    • Author(s)
      Ishiura, H., et al.
    • Journal Title

      Neurogenetics

      Volume: 12 Pages: 117-21

    • DOI

      10.1007/s10048-010-0271-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A functional variant in ZNF512B is associated with susceptibility to amyotrophic lateral sclerosis in Japanese2011

    • Author(s)
      Iida, A., et al.
    • Journal Title

      Hum Mol Genet

      Volume: 20 Pages: 3684-92

    • DOI

      ddr268 [pii] 10.1093/hmg/ddr268

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Kesequencing-based case control study of SQSTM1 for sporadic amyotrophic lateral sclerosis based on common disease-multiple rare variant hypothesis2011

    • Author(s)
      Yuji Takahashi, Jun Goto, Shoji Tsuji
    • Organizer
      ASHG/ICHG 2011 Meeting
    • Place of Presentation
      Palais des Congres, Montreal Canada
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] Search for genetic risk factors and phenotypic modifiers for sporadic ALS based on extensive resequencing of causative genes for familial ALS2011

    • Author(s)
      Yuji Takahashi, Jun Goto, Shoji Tsuji
    • Organizer
      American Academy of Neurology 63rd Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center in Honolulu, Hawaii USA
    • Year and Date
      2011-04-13

URL: 

Published: 2013-06-26  

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