白血病における新規ＪＡＫ２関連融合遺伝子の同定とその分子病態の解明

2012 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 22591172
• Research Institution: Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science
• Principal Investigator: 川村 眞智子 公益財団法人東京都医学総合研究所, ゲノム医科学研究分野, 研究員 (80450592)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 滝 智彦 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (50322053)
• Project Period (FY): 2010-04-01 – 2013-03-31
• Keywords: JAK2遺伝子 / 染色体転座 / 白血病 / 融合遺伝子

Research Abstract

研究の目的:過去に報告のないt(9;17)(p24;q23)を持つ難治性急性リンパ性白血病(ALL)の発がん機構を解明し、その治療開発への糸口をつかむ．
研究成果：前年度までの研究で，その切断点から染色体9p24上のJAK2遺伝子の関与をFISH解析で確認した．JAK2遺伝子は，一部の白血病で転座と骨髄増殖性疾患とダウン症ALLで，各々別の部位の点突然変異が存在することが知られている．また造血器腫瘍において次世代シークエンサー(NGS)の発展により新たな融合遺伝子も次々と報告されている．PCRを使った方法では転座相手を同定できなかったため、NGSを用いた．白血病細胞からRNAを抽出し，mRNAを分離し，NGSによるpair end RNAシークエンス（Illumina HiSeq2000）で解析した．得られた情報をヒト遺伝子へマッピングし，17q21上にある新規遺伝子とJAK2遺伝子の融合を検出した．得られた融合遺伝子の情報から切断点を挟むプライマーを作成し，RT-PCRを行い，ダイレクトシークエンスを行った．配列から融合遺伝子の存在を確認した．このALLにおいて，JAK2遺伝子と融合する血液疾患としては10番目，ALLとしては7番目の新規遺伝子（論文投稿中）を発見した．またこの白血病の予後不良を決定づける可能性のある他の遺伝子の解析も行った。MLPA法を用いて，IKZF1，PAX5，CDKN2A/2B，BTG1遺伝子において欠失を確認した．近年，本例のようなチロシンキナーゼの活性化とIKZF1遺伝子の欠失を持つB-ALLが，BCR-ABL-ALLと似た遺伝子発現を示し，BCR-ABL (Ph1) like ALLと分類され，BCR-ABL阻害薬では効果が限られ，予後不良のため新しい治療法が待たれている．この融合遺伝子の研究は治療開発に応用できると考えられる．

Current Status of Research Progress

Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] NUP98-NSD1 related gene expression signature is strongly associated with a poor prognosis in pediatric acute myeloid leukemia: a study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group Cooperative Study Group (2013)
  • Author(s): Shiba N, Ichikawa H, Taki T, Park M, Jo A, Mitani S, Shimada A, Sotomatsu M, Arakawa H, Tabuchi K, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Hayashi Y
  • Journal Title: Genes Chromosomes Cancer Volume: 52 Pages: 683-693
  • DOI: 10.1002/gcc.22064
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] WT1 mutation in pediatric patients with acute myeloid leukemia: A study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group (2013)
  • Author(s): Sano H, Shimada A, Tabuchi K, Taki T, Murata C, Park M, Sotomatsu Tawa A, Kobayashi R, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Hayashi Y
  • Journal Title: Int J Hematol Volume: 98 Pages: 437-445
  • DOI: 10.1007/s12185-013-1409-6
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] DNMT3A mutations are rare in childhood acute myeloid leukemia, myelodysplastic syndromes and juvenile myelomonocytic leukemia (2012)
  • Author(s): Shiba N, Park M, Taki T, Shimada A, Tabuchi K, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Arakawa H, Hayashi Y
  • Journal Title: Br J Haematol Volume: 156 Pages: 413-414
  • DOI: 10.1111/j.1365-2141.2011.08879.x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] CBL Mutations in infant acute lymphoblastic leukemia. (2012)
  • Author(s): Shiba N, Park M, Taki T, Takita J, Hiwatari M, Kanazawa T, Sotomatsu M, Arakawa H, Ogawa S, Hayashi Y
  • Journal Title: Br J Haematol Volume: 156 Pages: 672-674
  • DOI: 10.1111/j.1365-2141.2011.08900.x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] RAS mutations are frequent in FAB type M4 and M5 of acute myeloid leukemia, and related to late relapse: a study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group. (2012)
  • Author(s): Sano H, Shimada A, Taki T, Murata C, Park M, Sotomatsu M, Tabuchi K, Tawa A, Kobayashi R, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Hayashi Y
  • Journal Title: Int J Hematol Volume: 95 Pages: 509-515
  • DOI: 10.1007/s12185-012-1033-x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] High WT1 mRNA expression after induction chemotherapy and FLT3-ITD have prognostic impact in pediatric acute myeloid leukemia: A study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group (2012)
  • Author(s): Shimada A, Taki T, Koga D, Tabuchi K, Tawa A, Hanada R, Tsuchida M, Horibe K, Tsukimoto I, Adachi S, Kojima S, Hayashi Y
  • Journal Title: Int J Hematol Volume: 96 Pages: 469-476
  • DOI: 10.1007/s12185-012-1163-1
  • Peer Reviewed