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2012 Fiscal Year Annual Research Report

ソフトバイオマス完全糖化を目指したデザイナブルセルロソームの基盤研究

Research Project

Project/Area Number 22612001
Research InstitutionMie University

Principal Investigator

三宅 英雄  三重大学, 生物資源学研究科, 助教 (50362364)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywordsセルロソーム / バイオマス / セルラーゼ / Clostridium / プロテオーム / 相互作用
Research Abstract

C. cellulovoransの培養条件や培地上清からのセルロソームの回収条件など、プロテオーム解析を行う上でのサンプル調製条件を決定した。京都大学の研究グループの協力で、回収したセルロソームを酵素消化により断片化し、LC-MS/MSで分離同定を行った。基本多糖類に対するセルロソームの解析を行ったところ、基質に応じたセルロソーム構成タンパク質の変化を検出することができた。さらに様々な多糖類、ソフトバイオマスに対して培養し、培地上清中のセルロソーマルタンパク質、およびノンセルロソーマルタンパク質について炭素源間での比較定量解析を行った。その結果、各炭素源間で変化せず一定量存在するもの、基質特異的に変化するものを同定することができた。
デザイナブルセルロソームの基盤研究として、新規足場タンパク質であるCbpBはセルロソーマルな酵素の一つであるManAと相互作用しており、セルロソームを形成することを明らかにした。さらに、CbpBが持つ1個のコヘシンをCbpAの9つのコヘシンと組み替えることで、CbpBをベースとしたCbpAのコヘシンとセルロソーマルな酵素との1対1の定量的な相互作用解析を行った。それらの親和力を比較することでCbpAのコヘシンが、セルロソーマル酵素との間で結合様式(並び方)に違いがあるのか、という疑問の解明へとつながると考えられる。そこでCbpBのコヘシンとCbpAのN末端側に存在するコヘシン1を置換した組換え体の足場タンパク質を構築し、セルロソーマルな酵素であるManAとの相互作用解析を定量的に行った。その結果、コヘシン間で親和力の違いを確認した。この結果からCbpAのコヘシンが、セルロソーマル酵素との間で結合様式(並び方)に違いがあることが推定された。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2013 2012

All Presentation (7 results)

  • [Presentation] 異なる糖で培養したセルロソーム生産菌Clostridium cellulovorans 743Bの比較RNA-seq解析2013

    • Author(s)
      高嶋和也、石川卓、黒田浩一、植田充美、三宅英雄
    • Organizer
      日本農芸化学会 2012年度大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20130325-20130327
  • [Presentation] バイオマス分解のためのClostridium cellulovorans の定量的セクレトーム解析2013

    • Author(s)
      松井一真, 江坂康平,森坂 裕信, 黒田浩一, 三宅 英雄, 田丸 浩,植田充美
    • Organizer
      日本農芸化学会 2012年度大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20130325-20130327
  • [Presentation] Clostridium cellulovorans 743Bが生産する新規セルロソーム骨格タンパク質CbpBの機能解析2012

    • Author(s)
      三宅英雄、中島大地、永野彰彦、森坂裕信、黒田浩一、植田充美、田丸浩
    • Organizer
      第64回 日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20121023-20121026
  • [Presentation] Focused proteome analysis of cellulosome of Clostridium cellulovorans2012

    • Author(s)
      Kazuma Matsui, Hironobu Morisaka, Kouichi Kuroda, Yutaka Tamaru, Hideo Miyake, Mitsuyoshi Ueda
    • Organizer
      15th European Congress on Biotechnology
    • Place of Presentation
      トルコ・イスタンブール
    • Year and Date
      20120923-20120926
  • [Presentation] Yeast cell surface display of xylose isomerase from C. cellulovorans toward efficient xylose fermentation2012

    • Author(s)
      Kouichi Kuroda, Miki Ota, Hironobu Morisaka, Hideo Miyake, Yutaka Tamaru, Mitsuyoshi Ueda
    • Organizer
      15th European Congress on Biotechnology
    • Place of Presentation
      トルコ・イスタンブール
    • Year and Date
      20120923-20120926
  • [Presentation] Characterization of the cellulosomal scaffolding protein CbpB from Clostridium cellulovorans 743B2012

    • Author(s)
      Hideo Miyake, Daich Nakajima, Akihiko Nagano, Hironobu Morisaka, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda, Yutaka Tamaru
    • Organizer
      2012 Clostridium International Meeting XII
    • Place of Presentation
      イギリス・ノッティンガム
    • Year and Date
      20120910-20120912
  • [Presentation] Characterization of the cellulosomal scaffolding protein CbpB from Clostridium cellulovorans 743B2012

    • Author(s)
      Daichi Nakajima, Akihiko Nagano, Hironobu Morisaka, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda, Hideo Miyake
    • Organizer
      112th American Society for Microbiology
    • Place of Presentation
      アメリカ・サンフランシスコ
    • Year and Date
      20120616-20120620

URL: 

Published: 2014-07-24  

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