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2011 Fiscal Year Annual Research Report

マイクロ流路での大腸菌の細胞伸長の表現型可塑性の解析:迅速な適応性

Research Project

Project/Area Number 22657006
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

嶋田 正和  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (40178950)

Keywordsフィラメント形成 / マイクロ流路 / 大腸菌 / 表現型可塑性 / 細菌の進化生態学
Research Abstract

細菌はしばしば伸長する現象(フィラメント形成)を示すが、これには富栄養の好適な環境条件で伸びる可能性があるが、逆に貧栄養の環境条件で伸びた報告もある。さらには、天敵テトラヒメナが出すカイロモンを感知し、細菌体が伸長することで天敵が食われにくくなる効果としての誘導防衛である可能性も根強い。そのためまず、捕食者テトラヒメナのカイロモンがバクテリア(ここでは大腸菌)の形状などの表現型に及ぼす影響を調べるための1細胞計測系を構築した。当初の計画では、ガラス基板上にレーザーで微細加工により作製したマイクロチャンバ中にバクテリアを閉じ込めることを予定していた。しかしこの方法では、細胞の増殖によりマイクロチャンバ中の細胞密度が上昇し、長時間の影響評価が難しくなる。よって、増殖しすぎた細胞を自動的に取り除けるように工夫した1細胞計測系を構築した(特願2011-156767)。この計測系は、細い溝で大腸菌が増殖すると、両側の出口から増えた大腸菌が培養液とともに流れていく構造になっている。そして、細い溝で増殖している大腸菌の細胞の輪郭を画像解析し、その細胞の長辺を計測することで、フィラメント形成のデータが自動的に蓄積するものである。この計測系を捕食者テトラヒメナ-被食者大腸菌の混合培養系に応用したところ、テトラヒメナ用の2種類の標準的な培地1/10PYG、およびCDM最小培地中では、テトラヒメナが存在しなくても大腸菌が伸長してしまうことを明らかにした。これらの標準培地ではカイロモンの影響評価が難しいため、改変培地の作製に取り組み、1/10PYGに0.5%NaClを加えた培地では大腸菌の伸長を抑えられることを確認した。この伸長が抑えられた系で天敵のカイロモンを流すことで、バクテリアの形状がどのように変化するかを観測することが可能となった。

  • Research Products

    (9 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (4 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Optimal lineage principle for age-structured populations2012

    • Author(s)
      Wakamoto, Y., Grosberg, A. Y., Kussell, E
    • Journal Title

      Evolution

      Volume: 66 Pages: 115-134

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1558-5646.2011.01418.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 確率的表現型変化によるがん細胞構成比の安定性2011

    • Author(s)
      若本祐一
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 29 Pages: 2980-2981

  • [Journal Article] Multitude of morphological dynamics of giant multilamellar vesicles in regulated nonequilibrium environments2011

    • Author(s)
      Tomita, T., Sugawara, T., Wakamoto, Y.
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 27 Pages: 10106-10112

    • DOI

      DOI:10.1021/la2018456

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] rial persistence based on epigenetically correlated stochastic gene expre2012

    • Author(s)
      Wakamoto, Y.
    • Organizer
      第85回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      長崎(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-28
  • [Presentation] lection based on stochastic gene expression and generality of phenotypic2011

    • Author(s)
      Wakamoto, Y.
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] Bacterial persistence based on epigenetically correlated gene expression2011

    • Author(s)
      Wakamoto, Y.
    • Organizer
      5th International Conference on Analysis of Microbial Cells at the Single Cell Level
    • Place of Presentation
      Carry-Le-Rouet, France
    • Year and Date
      2011-11-06
  • [Presentation] ell measurement toolbox for studying evolution of restriction-modificatio2011

    • Author(s)
      Wakamoto, Y.
    • Organizer
      The 11th HFSP Awardees Meeting
    • Place of Presentation
      Montreal, Canada
    • Year and Date
      2011-06-06
  • [Remarks]

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/shimada-lab/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 細胞培養装置、細胞培養方法、および細胞培養観察方2011

    • Inventor(s)
      若本祐一、橋本幹弘
    • Industrial Property Rights Holder
      科学技術振興機構(100%)
    • Industrial Property Number
      特願2011-156767
    • Filing Date
      2011-07-15

URL: 

Published: 2013-06-26  

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