2011 Fiscal Year Annual Research Report
原始真核生物を求めて:新奇真核微生物の形態・発現遺伝子・ミトコンドリアゲノム解析
| Project/Area Number |
22657025
|
|---|
| Research Institution | University of Tsukuba |
|---|
Principal Investigator |
稲垣 祐司 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (50387958)
|
|---|
| Keywords | 真核生物系統 / ミトコンドリア / 原始真核生物 / 細胞内微細構造 / EST解析 |
|---|
| Research Abstract |
ミトコンドリア(mt)は細胞内共生したバクテリアを起源とし、バクテリア型のミトコンドリアDNA(mtDNA)を保持する。mtは祖先真核生物で獲得されたとすると、祖先的真核生物のmtDNAは祖先的な特徴をもつ可能性が高い。ヤコバ類Reclinomonasはゲノムサイズ・遺伝子数が最大である「祖先的」mtDNAを持ち、祖先的真核生物の候補の1つである。ユーグレノゾア、ヘテロロボーサ、ヤコバ類は単系統であり、近年ディスコバ生物群と総称されている。これまでに我々が行った分子系統解析により、新奇真核生物Tsukubamonas globosa(TKB055株)はディスコバ生物群の新たなメンバーであることが判明している。本研究の目的は、T.globosaを(1)形態観察、(2)網羅的発現遺伝子(EST)解析と大規模分子系統解析、(3)mtDNAの全ゲノム配列の決定、を通じた原始真核生物細胞に関する新たな知見の獲得である。H23年度には以下の作業を行った。
1.次世代シークエンス用cDNAライブラリーを作製し、網羅的発現遺伝子(EST)解析を行った。
このデータからT.globosaのディスコバ生物群内での系統的位置を決定するため、系統解析に用いる160遺伝子程度を選定し予備的な系統解析を開始した。
2.Rolling Circle Amplification(RCA)法により増幅したmtDNAサンプルからDNAライブラリーを作製し、パイロシークエンスを行った。その結果T.globosa環状mtDNAゲノムの塩基配列を完全決定した。完全決定されたmtゲノムは約47kbpであった。
|
