2011 Fiscal Year Annual Research Report
インプリンティング遺伝子のゲノムワイドな同定法の開発と小児固形腫瘍解析への応用
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22659196
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| Research Institution | Gunma Institute of Public Health and Environmental Sciences |
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Principal Investigator |
林 泰秀 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (30238133)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
朴 明子 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (50450375)
大木 健太郎 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (50400966)
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| Keywords | 遺伝子 / ゲノム / マイクロアレイ / 癌 / インプリンティング |
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| Research Abstract |
今年度は、横紋筋肉腫(RMS)50検体(細胞株8株、新鮮腫瘍42例)を用い、発現解析、変異解析、SNPアレイによるゲノムコピー数の解析を行った。またALK阻害剤による、細胞株の増殖抑制効果も検討した。RT-PCRを施行した29検体中17検体(59%)でALKの高発現を確認し、SNPアレイでは胞巣型の1例でALK領域の高度増幅を検出した。この例では同時にPAX3とFKHR領域の高度増幅も検出されたが、ALK遺伝子の変異は検出されなかった。ALK阻害剤により一部の細胞株で増殖抑制効果が認められた。ALKはRMSで高率に発現し、高度増幅例も認められたことからRMSの発症・進展に関与している可能性が示唆された。
NOTCHシグナルは細胞増殖に関与し、白血病や脳腫瘍で異常が報告されているが、小児固形腫瘍への関与は不明である。今回、小児固形腫瘍の細胞株70株(神経芽腫40株、Ewing肉腫17株、RMS13株)、新鮮腫瘍248例(神経芽腫131例、Ewing肉腫56例、RMS61例)のNOTCH1/2の変異解析および発現解析を行った。またsi-RNAによるノックダウンの系を用いてNOTCHシグナルの細胞増殖に及ぼす影響を検討した。変異解析ではNOTCH1/2のHD domainとPEST domainに9個の一塩基置換を認めた。si-RNAによりNOTCHシグナルをノックダウンした結果、変異NOTCHを発現する細胞株では野生型NOTCHを発現する細胞株に比べて著しい細胞増殖制御効果が確認された。NOTCHシグナルは一部の小児固形腫瘍の発症・進展に関与する可能性が示唆され、今後小児固形腫瘍の新たな治療標的となる可能性がある。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
昨年度はALKのEwing肉腫における解析を行い、今年度は横紋筋肉腫における意義を検討した。さらにNOTCHシグナルの小児固形腫瘍における意義も検討し、研究は順調に進展している。
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| Strategy for Future Research Activity |
次年度は小児固形腫瘍におけるIDH1、IDH2の解析とALKの詳細な機能解析を行う予定である。また次世代シーケンサーを用いたエクソーム解析も行う予定である。
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[Journal Article] Identification of TRIB1 R107L gain-of-function mutation in human acute megakaryocytic leukemia2012
Author(s)
Yokoyama T, Toki T, Aoki Y, Kanezaki R, Park MJ, Kanno Y, Takahara T, Yamazaki Y, Ito E, Hayashi Y, Nakamura T
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Journal Title
Blood
Volume: 119
Pages: 2608-2611
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] DNMT3A mutations are rare in childhood acute myeloid leukaemia, myelodysplastic syndromes and juvenile myelomonocytic leukaemia2012
Author(s)
Shiba N, Taki T, Park MJ, Shimada A, Sotomatsu M, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Arakawa H, Hayashi Y
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Journal Title
Br J Haematol
Volume: 156
Pages: 413-414
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] CBL mutations in infant acute lymphoblastic leukaemia2012
Author(s)
Shiba N, Park MJ, Taki T, Takita J, Hiwatari M, Kanazawa T, Sotomatsu M, Ishii E, Arakawa H, Ogawa S, Hayashi Y
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Journal Title
Br J Haematol
Volume: 156
Pages: 672-674
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Aberrations of NEGR1 on 1p31 and MYEOV on 11q13 in neuroblastoma2011
Author(s)
Takita J, Chen Y, Okubo J, Sanada M, Adachi M, Ohki K, Nishimura R, Hanada R, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S
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Journal Title
Cancer Sci
Volume: 102
Pages: 1645-1650
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] IDH1 and IDH2 mutations are rare in pediatric myeloid malignancies2011
Author(s)
Oki K, Takita J, Hiwatari M, Nishimura R, Sanada M, Okubo J, Adachi M, Sotomatsu M, Kikuchi A, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S
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Journal Title
Leukemia
Volume: 25
Pages: 382-384
DOI
Peer Reviewed
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