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2010 Fiscal Year Annual Research Report

複数のモジュールで構成されるシグナル伝達経路の適応性、振動性及び周波数特性の解析

Research Project

Project/Area Number 22680024
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

澤井 哲  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

Keywords振動 / 適応 / 粘菌 / モジュール / シグナル伝達 / ネットワーク / ライブセルイメージング / 自己組織化
Research Abstract

粘菌細胞が互いに集合する際に用いる誘因物質サイクリックAMP(cAMP)は、細胞外cAMPの刺激によって細胞内で新たに生成され、放出される。この応答が細胞間でそろい、振動と波となって伝播し、細胞が移動する向きをガイドしている。これについて、本年度までに得られた知見について、年度の始めに論文として報告した。本研究期間では、この振動と波が、広い範囲の条件下で頑健に形成される仕組みの解明をすすめた。応答は一過的で、刺激が持続すると刺激前の状態に戻る、いわゆる「適応」という細胞応答に広く認められる特性を示す。この応答の適応からの回復、「脱適応」の時間依存性、濃度依存性、生きた細胞の細胞内のcAMPを可視化することで定量的に特徴付けた。その結果、脱適応には5から6分という一定の時間が必要であることが定量的に明らかにすることに成功し、加えてこのことが、5-6分の振動性を生み出す根源的な性質であることを示すことができた。さらに、この応答が刺激の濃度差を検出していることについても、定量的な測定をおこない、具体的な特性を明らかにした。以上の性質を実現するシグナル伝達経路のモジュールについても解析を進め、cAMP生成を担う酵素であるアデニール酸シクラーゼの活性化に必須の、PHドメインタンパクCRACの膜への局在化について、cAMPと同時に可視化することで応答の測定をおこなった。その結果、応答の立ち上がりについて、両者に強い相関がみられることを明らかにした。またCRACは自己組織的な波パターンとして局在し、今回、その幾何学的な特徴と周波数特性を明らかにした。適応性、興奮性、振動性をうみだすモジュールがどこにどんな構造であるかに関して、これまでに報告されているネットワークの知見を踏まえ、特に相対的な濃度差の検出を可能にする構造について理論的な検討を進めた。

  • Research Products

    (21 results)

All 2011 2010

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (19 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] The onset of collective behavior in social amoebae2010

    • Author(s)
      T.Gregor, N.Masaki, K.Fujimoto, S.Sawai
    • Journal Title

      Science

      Volume: 328 Pages: 1021-1025

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 細胞性粘菌にみるクオラムセンシングのアルゴリズム2011

    • Author(s)
      澤井哲
    • Organizer
      第49回日本生体医工学会 シンポジウム「生物のリズム戦略」
    • Place of Presentation
      大阪国際交流センター(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-25
  • [Presentation] 位相の特異点からみる細胞と細胞集団の運動特性2011

    • Author(s)
      澤井哲
    • Organizer
      アクティブマター研究会2011
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館(口頭発表)
    • Year and Date
      2011-02-07
  • [Presentation] 粘菌のcAMP振動と形態形成運動2011

    • Author(s)
      澤井哲
    • Organizer
      第1回新学術領域「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」公開シンポジウム「異分野の融合による新たな発生生物学の幕開け」
    • Place of Presentation
      九州大学(病院地区 コラボステーション)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-01-17
  • [Presentation] 粘菌細胞におけるcAMP応答の分子メカニズムの-細胞レベル解析2010

    • Author(s)
      神野圭太, 藤本仰一, 澤井哲
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-12-10
  • [Presentation] 細胞密度をリモートセンシングする興奮かつ振動的なシグナル応答2010

    • Author(s)
      藤本仰一, 澤井哲
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] Precise Tuning of Self-Organizing Waves of PIP3/Actin by SCAR/WAVE Complex2010

    • Author(s)
      大貫武彦, 谷口大相, 澤井哲
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] Adaptation and fold-change detection of CAMP response and the underlying molecular mechanism in Dicytostelium2010

    • Author(s)
      神野圭太, 澤井哲
    • Organizer
      第3回定量生物学の会年会
    • Place of Presentation
      東京大学(生産研)(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-11-27
  • [Presentation] 自己組織化するリン脂質パターンの位相特異点解析2010

    • Author(s)
      谷口大相, 石原秀至, 大貫武彦, 金子邦彦, 澤井哲
    • Organizer
      第3回定量生物学の会年会
    • Place of Presentation
      東京大学(生産研)(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-11-27
  • [Presentation] F-actin polymerization activator SCAR/WAVE complex regulates precise PIP3/F-actin wave nucleation and propagation2010

    • Author(s)
      大貫武彦, 谷口大相, 澤井哲
    • Organizer
      第3回定量生物学の会年会
    • Place of Presentation
      東京大学(生産研)(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-11-27
  • [Presentation] 粘菌の細胞分化と振動シグナルとの関連についての展望2010

    • Author(s)
      島田奈央, 澤井哲
    • Organizer
      第3回定量生物学の会年会
    • Place of Presentation
      東京大学(生産研)(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-11-27
  • [Presentation] Single-cell level analysis of adaptation in chemoattractant signaling in Dictyostelium2010

    • Author(s)
      神野圭太、澤井哲
    • Organizer
      International Conference on Systems Biology(ICSB2010)
    • Place of Presentation
      エジンバラ(英国)(オーガナイザー発表)
    • Year and Date
      2010-10-11
  • [Presentation] Phase singularity analysis of self-organizing phosphatidylinositol waves in Dictyostelium discoideum cells2010

    • Author(s)
      谷口大相, 石原秀至, 大貫武彦, 金子邦彦, 澤井哲
    • Organizer
      第48回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台)(口頭発表)
    • Year and Date
      2010-09-22
  • [Presentation] 細胞性粘菌の脱適応現象とその集団的振動における役割2010

    • Author(s)
      澤井哲
    • Organizer
      第48回生物物理学会 年会シンポジウム「システムレベルの生物物理学 多細胞ダイナミクス」
    • Place of Presentation
      東北大学 川内キャンパス(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] Single-cell level analysis of adaptive cAMP response and the underlying network topologies in Dictyostelium2010

    • Author(s)
      K.Kamino, S.Sawai
    • Organizer
      第48回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学 川内キャンパス(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] Mutational analyses of PIP3/F-actin wave nucleation and propagation2010

    • Author(s)
      大貫武彦, 谷口大相, 澤井哲
    • Organizer
      第48回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台)(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] Subthreshold Dynamics is Crucial for Remote Sensing of Cell Density2010

    • Author(s)
      藤本仰一, 澤井哲
    • Organizer
      第48回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学 川内キャンパス(口頭発表)
    • Year and Date
      2010-09-20
  • [Presentation] Single-cell level analysis of the adaptive cAMP response in Dictyostelium2010

    • Author(s)
      澤井哲
    • Organizer
      CBI学会2010年大会 オーガナイズドセッション「数理モデルとシミュレーション」
    • Place of Presentation
      学術総合センター 一橋記念講堂(招待講演)
    • Year and Date
      2010-09-17
  • [Presentation] 倍変化検出型の応答とその集団振動における役割2010

    • Author(s)
      澤井哲
    • Organizer
      第19回イメージング学会 シンポジウム「バイオイメージングと定量生物学」
    • Place of Presentation
      慶応大学 日吉キャンパス来往舎(招待講演)
    • Year and Date
      2010-09-10
  • [Presentation] Adaptation and de-adaptation kinetics underlying the synchronized oscillations in Dictyostelium2010

    • Author(s)
      澤井哲
    • Organizer
      第43回発生生物学会 年会シンポジウム"Quantitative biology of spatiotemporal dynamics in development
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(招待講演)
    • Year and Date
      2010-06-22
  • [Book] 生命科学の新しい潮流 理論生物学(望月敦史編)(3-2章 微生物の集団的な振る舞い)2011

    • Author(s)
      澤井哲
    • Total Pages
      116-136
    • Publisher
      共立出版

URL: 

Published: 2012-07-19  

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