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2012 Fiscal Year Annual Research Report

複数のモジュールで構成されるシグナル伝達経路の適応性、振動性及び周波数特性の解析

Research Project

Project/Area Number 22680024
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

澤井 哲  東京大学, 総合文化研究科, 准教授 (20500367)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywords適応 / 振動 / 粘菌 / 入出力関係 / 頑強性
Research Abstract

前年度に引き続き、リン酸化できない変異型のcAMP受容体について、ライブセル可視化法によってcAMP応答を解析をすすめ、野生型の受容体では出力が濃度に依存しない特性を示すのにたいして、変異型では濃度依存的に出力が増加することをつきとめた。この変異体は、cAMPの上昇が自発的に生じやすいことをこれまで明らかにしていたが、今回の結果により、それが細胞に内在性のAMPのパルス発生の増大によるものでなく、増幅率の増加によって細胞外にcAMPがたまりやすいことによっていること、出力を一定に保つ機構が受容体レベルであることが示された。またこれらに付随し、cAMP応答に関連するシグナル伝達経路について、変異体と薬剤処理により検証を重ね、調節回路の解析をすすめた。一方で、出力や振動を一定に保つ機構についても,細胞外cAMPを分解する酵素がcAMP依存的に転写制御されていることと、これによってcAMPが振動しやすいパラメータ領域が広がることを明らかにし、投稿論文として発表した。同様に、cAMP依存的なcAMPのパルス生成がcAMPの相対的な濃度変化によることを前年度まで明らかにしていたが、この性質がホスホチジルイノシトールの生成量レベルでも成り立っていることを可視化測定から明らかにした。また、こうした入出力関係が、集団的なcAMP振動が細胞密度によらないという頑強性を実現していることを示し、現在投稿論文を準備中である。こうした結果から、頑強性を維持している調整のモジュールが3つあり、これらが相互に保管しあって、システム全体の頑強性を高めている実態が明らかになってきた。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (26 results)

All 2013 2012

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (19 results) (of which Invited: 3 results) Book (4 results)

  • [Journal Article] Phase geometries of two-dimensional excitable waves govern self-organized morphodynamics of amoeboid cells2013

    • Author(s)
      D. Taniguchi, S. Ishihara, T. Oonuki, M. Honda-Kitahara, K. Kaneko and S. Sawai
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: Vol. 110, No. 13 Pages: pp. 5016-5021

    • DOI

      10.1073/pnas.1218025110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The green tea catechin epigallocatechin gallate (EGCG) blocks cell motility, chemotaxis and development in Dictyostelium discoideum2013

    • Author(s)
      K. J. McQuade, A. Nakajima, A. N. Ilacqua1, N. Shimada and S. Sawai
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: Vol. 8, No.3 Pages: e59275

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0059275

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robustness of Self-Organizing Chemoattractant Field Arising from Precise Pulse Induction of Its Breakdown Enzyme: A Single-Cell Level Analysis of PDE Expression in Dictyostelium2013

    • Author(s)
      N. Masaki, K. Fujimoto, M. Honda-Kitahara, E. Hada and S. Sawai
    • Journal Title

      Biophys. J.

      Volume: Vol. 104, No. 5 Pages: pp. 1191-1202

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2013.01.023

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Wave geometries and cell shape dynamics2013

    • Author(s)
      S. Sawai ( Tokyo Univ. )
    • Organizer
      The 10th NIBB-EMBL Symposium 2013 on Quantitative Bioimaging
    • Place of Presentation
      Okazaki Conference Center (愛知県、岡崎市)
    • Year and Date
      20130317-20130317
    • Invited
  • [Presentation] Design principle of group-level decision making in cell populations2013

    • Author(s)
      K. Fujimoto (Osaka Univ.), S. Sawai ( Tokyo Univ. )
    • Organizer
      The 1st annual winter Q-bio conference
    • Place of Presentation
      Hilton Hawaiian Village (米国、ハワイ)
    • Year and Date
      20130219-20130219
  • [Presentation] 細胞動態と自己組織化現象:反応-拡散-駆動系2013

    • Author(s)
      澤井哲(東京大学)
    • Organizer
      第51回東京大学物理学教室コロキアム
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス(東京都、文京区)
    • Year and Date
      20130113-20130113
    • Invited
  • [Presentation] 細胞性粘菌の1細胞レベルのcAMP応答におけるcAMP受容体のリン酸化の役割2012

    • Author(s)
      井元大輔, 本多麻衣, 澤井哲(東京大学)
    • Organizer
      第5回定量生物学の会
    • Place of Presentation
      東京大学生産技術研究所(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      20121124-20121125
  • [Presentation] マイクロ流路を用いて作り出した誘因物質の進行波に対する細胞の走化性運動の解析2012

    • Author(s)
      中島 昭彦, 石原 秀至, 澤井 哲(東京大学)
    • Organizer
      第5回定量生物学の会
    • Place of Presentation
      東京大学生産技術研究所(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      20121124-20121124
  • [Presentation] 細胞内分子を機能阻害した粘菌細胞のcAMP応答の解析2012

    • Author(s)
      福神史仁 , 神野圭太 , 澤井哲(東京大学)
    • Organizer
      第5回定量生物学の会
    • Place of Presentation
      東京大学生産技術研究所(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      20121124-20121124
  • [Presentation] マイクロ流路を用いて作り出した誘因物質の進行波に対する細胞の走化性運動の解析2012

    • Author(s)
      中島 昭彦, 石原 秀至, 澤井 哲(東京大学)
    • Organizer
      第2回日本細胞性粘菌学会年会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場Iキャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      20121118-20121118
  • [Presentation] 細胞内分子を機能阻害した粘菌細胞のcAMP応答の解析2012

    • Author(s)
      福神史仁 , 神野圭太 , 澤井哲(東京大学)
    • Organizer
      第2回日本細胞性粘菌学会年会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場Iキャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      20121117-20121117
  • [Presentation] 細胞運動中の形態変化の数理モデル2012

    • Author(s)
      石原秀至, 谷口大相, 澤井哲(東京大学)
    • Organizer
      第2回日本細胞性粘菌学会年会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場Iキャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      20121117-20121117
  • [Presentation] Simulating Dictyostelium Cell Deformation in Amoeboid Movement2012

    • Author(s)
      S. Ishihara , D. Taniguchi , S. Sawai ( Tokyo Univ. )
    • Organizer
      NOLTA2012
    • Place of Presentation
      Gran Melia Victoria (スペイン、マヨルカ島、パルマ)
    • Year and Date
      20121023-20121023
  • [Presentation] Analysis of protein translocation in a reconstituted Dictyostelium cell membrane on a solid substrate2012

    • Author(s)
      K. Takahashi , N. Shimada , T. Toyota , S. Sawai ( Tokyo Univ. )
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス(愛知県、名古屋市)
    • Year and Date
      20120924-20120924
  • [Presentation] Live-cell imaging and analysis of cAMP-induced cAMP response in Dictyostelium using microfluidics chambers2012

    • Author(s)
      F. Fukujin , K. Kamino , S. Sawai ( Tokyo Univ. )
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス(愛知県、名古屋市)
    • Year and Date
      20120923-20120923
  • [Presentation] Phase response of the collective cAMP oscillations in Dictyostelium discoideum and its implication to the adaptive properties2012

    • Author(s)
      D. Imoto , S. Sawai ( Tokyo Univ. )
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス(愛知県、名古屋市)
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] Modeling morphological dynamics of migrating cells governed by self-organized excitable waves2012

    • Author(s)
      石原秀至 , 谷口大相 , 澤井哲 (東京大学)
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス(愛知県、名古屋市)
    • Year and Date
      20120922-20120922
  • [Presentation] Geometries of phosphatidylinositol waves and large-scale membrane deformation during spreading and random movement of Dictyostelium2012

    • Author(s)
      S. Sawai (Tokyo Univ.)
    • Organizer
      International workshop on "Active Dynamics on Microscales: Molecular Motors and Self-Propelling Particles"
    • Place of Presentation
      Lorentz Center (オランダ、ライデン)
    • Year and Date
      20120920-20120920
    • Invited
  • [Presentation] Tuning collectivity in cell fate decision2012

    • Author(s)
      K. Fujimoto (Osaka Univ.), S. Sawai (Tokyo Univ.)
    • Organizer
      The 13th International Conference of Systems Biology
    • Place of Presentation
      University of Toronto (カナダ、トロント)
    • Year and Date
      20120821-20120821
  • [Presentation] Estimating the reaction diffusion equations for phosphatidylinositide waves in Dictyostelium from live cell imaging data2012

    • Author(s)
      S. Ishihara , D. Taniguchi , S. Sawai (Tokyo Univ.)
    • Organizer
      BayesComp 2012
    • Place of Presentation
      The Institute of Statistical Mathematics (ISM) (東京都、立川市)
    • Year and Date
      20120623-20120623
  • [Presentation] Estimating reaction diffusion equations for signaling dynamics in Dictyostelium2012

    • Author(s)
      石原秀至 , 谷口大相 , 澤井哲 (東京大学)
    • Organizer
      理研BSI研究会「次世代情報処理における揺らぎと確率2」
    • Place of Presentation
      理化学研究所 (埼玉県、和光市)
    • Year and Date
      20120619-20120619
  • [Presentation] Synchronized Onset of Quorum Sensing Transition2012

    • Author(s)
      K. Fujimoto (Osaka Univ.), S. Sawai (Tokyo Univ.)
    • Organizer
      Joint Meeting of The 45th Annual Meeting of JSDB and The 64th Annual Meeting of JSCB
    • Place of Presentation
      Kobe International Conference Center (兵庫県、神戸市)
    • Year and Date
      20120530-20120530
  • [Book] Collective Decision-Making and Oscillatory Behaviors in Cell Populations in "Engineering of Chemical Complexity"(A. Mikhailov & G. Ertl ed.)2013

    • Author(s)
      K. Fujimoto & S. Sawai
    • Total Pages
      19
    • Publisher
      World Scientific
  • [Book] 実験医学 31 (6) 「興奮系の自己組織化現象からみる細胞動態」2013

    • Author(s)
      澤井哲 石原秀至 中島昭彦
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      羊土社
  • [Book] 細胞性粘菌(研究の新展開)~モデル生物、創薬資源、バイオ~(阿部知顕、前田靖男 編)2012

    • Author(s)
      澤井哲
    • Total Pages
      19
    • Publisher
      アイピーシー出版
  • [Book] 細胞性粘菌(研究の新展開)~モデル生物、創薬資源、バイオ~(阿部知顕、前田靖男 編)2012

    • Author(s)
      中島昭彦 澤井哲
    • Total Pages
      22
    • Publisher
      アイピーシー出版

URL: 

Published: 2014-07-24  

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