• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2012 Fiscal Year Final Research Report

Structural Studies on Auto-regulatory Mechanism of Cyanobacterial Clock Proteins

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 22687010
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Biophysics
Research InstitutionInstitute for Molecular Science (2012)
Nagoya University (2010-2011)

Principal Investigator

AKIYAMA Shuji  分子科学研究所, 生命・錯体分子科学研究領域, 教授 (50391842)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Keywords生物物理 / 生物時計 / 分光学 / 小角散乱
Research Abstract

Dynamic structural change of the KaiC hexamer revealed in this study provides notable insights into the cyanobacterial circadian clock. Our model implies that KaiC ticks through expanding and contracting motions of the C2 ring. The timing of the accumulation of KaiC carrying the expanded C2 ring is coincident with that of accumulation of KaiC associated both with KaiA and KaiB. The conformational ticking of KaiC is likely to serve as a timing cue for assembly/disassembly of KaiA and KaiB.

  • Research Products

    (29 results)

All 2013 2012 2011 2010 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (17 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Structural and dynamic aspects of protein clocks: How can they be so slow and stable?2012

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Journal Title

      Cellular and Molecular Life Sciences

      Volume: 69 Pages: 2147-2160

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] タンパク質時計―時間と空間の狭間を漂うように―2012

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 52 Pages: 102-103

  • [Journal Article] Visualization of circadian ticking of cyanobacterial clock protein KaiC in real time2011

    • Author(s)
      Mukaiyama A, Kondo T, Akiyama S
    • Journal Title

      SPring-8 Research Frontiers

      Pages: 46-47

  • [Journal Article] Octuple Cuvette for Small-angle X-ray Solution Scattering2011

    • Author(s)
      Akiyama S., Hikima T
    • Journal Title

      J. Appl. Cryst

      Volume: 44 Pages: 1294-1296

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tracking and Visualizing the Circadian Ticking of the Cyanobacterial Clock Protein KaiC in Solution2011

    • Author(s)
      Murayama Y., Mukaiyama A., Imai K., Onoue Y., Tsunoda A., Nohara A., Ishida T., Maeda Y., Terauchi K., Kondo T. and Akiyama S
    • Journal Title

      EMBO J

      Volume: 30 Pages: 68-78

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] KaiCタンパク質による概日時間2011

    • Author(s)
      秋山 修志,近藤 孝男
    • Journal Title

      細胞工学

      Volume: 30 Pages: 1269-1276

  • [Journal Article] 時計タンパク質KaiCの概日性分子鼓動2011

    • Author(s)
      秋山 修志,向山 厚
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 29 Pages: 1281-1284

  • [Journal Article] Quality control of protein standards for molecular mass determinations by small-angle X-ray scattering2010

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Journal Title

      J. Appl. Cryst

      Volume: 43 Pages: 237-243

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] X線小角散乱でナノ空間を照らし出す2010

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Journal Title

      現代化学

      Volume: 468 Pages: 54-58

  • [Presentation] Tracking and Visualizing Intramolecular Feedback in Cyanobacterial Clock Protein KaiC2013

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Organizer
      The 5th Japan-Taiwan joint meeting on neutron and X-ray scattering
    • Place of Presentation
      Tokai, Japan
    • Year and Date
      2013-02-26
  • [Presentation] Tracking and Visualizing Intramolecular Feedback in Cyanobacterial Clock Protein KaiC2012

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Organizer
      The 12th KIAS Conference on Protein Structure and Function
    • Place of Presentation
      Seoul(Korea)
    • Year and Date
      2012-10-11
  • [Presentation] Kaiタンパク質時計の源振の分子科学的解明に向けて2012

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      第19回時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      2012-09-16
  • [Presentation] 時計タンパク質のダイナミクス2012

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      放射光将来光源利用サイエンス若手シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2012-08-18
  • [Presentation] 時計タンパク質KaiCの概日性分子鼓動2012

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      12蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場
    • Year and Date
      2012-06-22
  • [Presentation] Circadian ticking of cyanobacterial clock protein KaiC in solution2012

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Organizer
      Structure to Dynamics: for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      Nagoya, Japan
    • Year and Date
      2012-05-16
  • [Presentation] タンパク質時計に秘められた秩序ある遅いダイナミクス~ 源振の分子科学的解明と新光源への期待2012

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      第25回日本放射光学会年会
    • Place of Presentation
      鳥栖市民文化会館
    • Year and Date
      2012-01-07
  • [Presentation] Circadian Pacemaker of Cyanobacteria by Intra-molecular Feedback of KaiC ATPase2011

    • Author(s)
      Akiyama S. and Kondo T
    • Organizer
      GCOE International Symposium
    • Place of Presentation
      Nagoya, Japan
    • Year and Date
      2011-11-26
  • [Presentation] X線小角散乱を用いた動的構造解析 ~ シアノバクテリア時計蛋白質の概日性分子鼓動 ~2011

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      第1回名古屋大学反応科学超高圧電子顕微鏡ワークショップ
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2011-11-21
  • [Presentation] Kaiタンパク質時計に秘められた秩序ある遅いダイナミクスKaiタンパク質時計に秘められた秩序ある遅いダイナミクスKaiタンパク質時計に秘められた秩序ある遅いダイナミクス2011

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      分子研研究会 「実験と理論による高次分子システムの機能発現の分子論的理解」
    • Place of Presentation
      分子科学研究所
    • Year and Date
      2011-11-02
  • [Presentation] シアノバクテリア時計タンパク質KaiCの分子鼓動の可視化2011

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場
    • Year and Date
      2011-09-22
  • [Presentation] Quality Control of Protein Standards for Molecular Mass Determinations by SAXS2011

    • Author(s)
      Akiyama S.,
    • Organizer
      XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • Place of Presentation
      Madrid, Spain
    • Year and Date
      2011-08-23
  • [Presentation] シアノバクテリア時計タンパク質はどのようにして時を測るのか2011

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      理論計算領域オープンセミナー
    • Place of Presentation
      分子科学研究所
    • Year and Date
      2011-04-04
  • [Presentation] Circadian Ticking of Cyanobacterial Clock Protein KaiC In Solution2010

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Organizer
      GCOE International Symposium: Protein structure and dynamics; from molecules to assembly
    • Place of Presentation
      Nagoya, Japan (招待講演)
    • Year and Date
      2010-11-24
  • [Presentation] 時計タンパク質の構造変化と小角X線散乱測定による実時間解析時計タンパク質の構造時計タンパク質の構造変化と小角X線散乱測定による実時間解析変化と小角X線散乱測定による実時間解析2010

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      第1回高分子科学研究会
    • Place of Presentation
      Spring-8 (上坪講堂)
    • Year and Date
      2010-11-06
  • [Presentation] シアノバクテリア時計タンパク質はどのようにして時を測るのか2010

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      第1回バイオ単分子研究会
    • Place of Presentation
      ATI会議室
    • Year and Date
      2010-08-06
  • [Presentation] 時計タンパク質の複合体形成ダイナミクスと遅い構造転移 ~μs^<-1>からday^<-1>まで~2010

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Year and Date
      2010-06-17
  • [Book] 放射光が解き明かす驚異のナノ世界"タンパク質によって操られている体内時計"2011

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Publisher
      講談社ブルーバックス
  • [Remarks] ホームページ

    • URL

      http://bms.ims.ac.jp/AkiyamaG/index.html

  • [Remarks] (1)秋山 修志, "生物の不思議 ~ 体内時計 ~", サイエンスキャンプ, 2010年8月, SPring-8(普及棟) アウトリーチ活動

URL: 

Published: 2014-08-29  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi