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2012 Fiscal Year Annual Research Report

ナノポアDNAセンサーの実用化に向けてナノポア付近のDNA泳動制御

Research Project

Project/Area Number 22710117
Research InstitutionAoyama Gakuin University

Principal Investigator

三井 敏之  青山学院大学, 理工学部, 准教授 (40406814)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywordsナノバイオ / 生物物理 / マイクロ・ナノデバイス
Research Abstract

次世代のシークエンスとして期待されているナノポア付近のDNAの泳動を観測し、その物理的状況を調べた。ポアは、SiN(200 nm)の径100 nm程度で、SiNポアへの通過のパラメータ(電位差、イオン濃度)やポアの表面修飾(有機分子、金蒸着)、ポアのFET化(SiN-Au-SiO2)による泳動の違いを調べ、ポア付近の電場、流れ、DNAの詰まりやすさについて評価した。SiNポア付近では静電場のみで、その電場を定量的に3Dで求め、等位面が球対称であることをを2012年11月にACS Nano 2012,6,10090-7に発表した。その論文においてDNAのつまりについて、ポアの径、膜間電位差による頻度の違い、ナノポア付近の動的流れの存在を示唆した。イオン溶液内表面電位の遮蔽イオンが電場により動くことに起因するオズモシス流がこの現象に深く関わっているので、その研究を年度後半の課題の中心に置いた。オズモシス流の発生とその影響を定量化するために、①ナノポア膜表面を金蒸着し、その膜電位を制御し、また②金蒸着後に更にSiOをスパッタし、ポア内の表面電位のみ制御し、DNAの泳動の変化を観測した。①では有機分子修飾と同様にDNAのナノポア通過の頻度が激減し、①、②共にDNAのポアへの動きは球対称性ではなく、表面付近からポアに向かう頻度が激減した。また、これらの挙動にもオズモシス流の影響が観られた。そこで、最終年度はDNAのオズモシス流含むダイナミクスのシミュレーションを行い、実際の挙動との比較を行った。詰まったDNAをSiN-Au-SiO2ポアから取り除くパラメーターを決定した。膜間電圧-0.3V、Auに矩形波Vpp = 0.8V、20HzのACで、ほぼ100%の詰まったDNAの除去ができた。最後に超音波での詰まったDNA除去を目的とし、超音波の局所的発生の装置を作製し、細胞への影響を観た。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Directly Observing the Motion of DNA Molecules near Solid-State Nanopores2012

    • Author(s)
      Toshiyuki Mitsui (Genki Ando)
    • Journal Title

      ACS Nano

      Volume: 6 Pages: 10090-7

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Cell migration under ultrasound irradiations in micrometer scale2013

    • Author(s)
      Shinya Murakami(Toshiyuki Mitsui)
    • Organizer
      アメリカ物理学会
    • Place of Presentation
      ボルチモア、メリーランド州、アメリカ
    • Year and Date
      20130317-20130322
  • [Presentation] Interaction of DNA molecules with nanopore studied by fluorescence microscopy2012

    • Author(s)
      Genki Ando(Toshiyuki Mitsui)
    • Organizer
      The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] Evaluation of Ultrasound Irradiation effects on Cells by using Raman Spectroscopy2012

    • Author(s)
      Manabu Sugimoto(Toshiyuki Mitsui)
    • Organizer
      The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] Controlled cell migration with ultrasound2012

    • Author(s)
      Shinya Murakami(Toshiyuki Mitsui)
    • Organizer
      The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Remarks] 青山学院大学 研究者情報

    • URL

      http://raweb.jm.aoyama.ac.jp/aguhp/KgApp?kyoinId=ymdggkyeggy

URL: 

Published: 2014-07-24  

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