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2011 Fiscal Year Annual Research Report

マイクロRNAの発現量を制御する特殊環状ペプチド創薬

Research Project

Project/Area Number 22710210
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

加藤 敬行  東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教 (90567760)

Keywordsケミカルバイオロジー / マイクロRNA / 特殊ペプチド / mRNAディスプレイ / FITシステム / 遺伝暗号リプログラミング / 分子標的医薬 / ペプチド医薬
Research Abstract

平成23年度においては、前年度に引き続きヒトmiR-21前駆体を標的として特異的に結合する特殊環状ペプチド(非天然アミノ酸を含む環状ペプチド)のセレクションをRaPIDディスプレイ法を用いて行った。前年度までの課題点として、ターゲットとなるmiRNA前駆体に対してペプチド自体ではなくペプチドの鋳型となるcDNAがmiRNA前駆体と相補的な配列を持つ部分を介して結合してしまうという問題があったため、これを解決するために特殊ペプチドライブラリの改良を図った。具体的には、ペプチド鎖中にビオチン残基やFLAGタグ配列を挿入し、標的miRNAに対するセレクション後にビオチンやFLAGを介した精製を行うことで実際に翻訳されたペプチド鎖とそれをコードするcDNAのみを回収できるように改善した。さらに、ペプチド鎖中にエンドプロテイナーゼであるGlu-Cによる切断サイトを導入し、標的miRNAからのcDNAの溶出の際にGlu-Cを加えてペプチドを切断させることにより標的に直接結合したcDNAを排除し、ペプチドを介した標的への結合のみを増幅できるように改良を行った。その結果、核酸同士の相互作用によるセレクションの阻害を抑制することができた。
これまでに、FLAG配列とGlu-C切断サイトを有する特殊ペプチドライブラリからmiR-21前駆体に結合するペプチド配列を得ることに成功したため、現在それらのペプチド配列の標的miRNA前駆体特異性や結合力の評価を開始した状況である。in vitroでの標的への結合の評価が出来次第、培養細胞を用いたin vivoでの活性の評価に移る予定である。

  • Research Products

    (10 results)

All 2012 2011

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Selective thioether macrocyclization of peptides having the N-terminal 2-chloroacetyl group and competing two or three cysteine residues in translation2012

    • Author(s)
      Iwasaki K, Goto Y, Katoh T, Suga H
    • Journal Title

      Org Biomol Chem.

      Volume: (epub)(掲載確定)(未定)

    • DOI

      10.1039/C2OB25306B

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article]2011

    • Author(s)
      山口淳, 加藤敬行, 菅裕明
    • Journal Title

      Drug Delivery System

      Volume: 26 Pages: 584-592

    • DOI

      DOI:10.2745/dds.26.584

  • [Journal Article] Flexizymes for genetic code reprogramming2011

    • Author(s)
      Goto Y, Katoh T, Suga H
    • Journal Title

      Nat Protoc.

      Volume: 6 Pages: 779-790

    • DOI

      10.1038/nprot.2011.331

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ribosomal synthesis of backbone macrocyclic peptides2011

    • Author(s)
      Katoh T, Goto Y, Reza MS, Suga H
    • Journal Title

      Chem Commun

      Volume: 47 Pages: 9946-9958

    • DOI

      10.1039/C1CC12647D

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Charging of tRNAs using ribozymes and selection of cyclic peptides containing thioethers2011

    • Author(s)
      Reid PC, Goto Y, Katoh T, Suga H
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 805 Pages: 335-348

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-3790_19

  • [Journal Article] Natural product-like macrocyclic N-methyl-peptide inhibitors against a ubiquitin ligase uncovered from a ribosome-expressed de novo library2011

    • Author(s)
      Yamagishi Y, Shoji I, Miyagawa S, Kawakami T, Katoh T, Goto Y, Suga H
    • Journal Title

      Chem Biol.

      Volume: 18 Pages: 1562-1570

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2011.09.013

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ヒストンリシン脱メチル化酵素JMJD2Aに対する特殊環状ペプチド阻害剤のセレクション及び活性評価2012

    • Author(s)
      小嶋達矢
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      神奈川(慶應大学)
    • Year and Date
      2012-03-27
  • [Presentation] in vitroセレクションによる小分子結合性small non-coding RNAの探索2011

    • Author(s)
      寺坂尚紘
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] In vitro selection of macrocyclic peptide inhibitors against various target proteins by means of ribosome-expressed peptide library2011

    • Author(s)
      加藤敬行
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-13
  • [Presentation] 特殊環状ペプチドライブラリを用いた分子標的医薬の開発2011

    • Author(s)
      加藤敬行
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      大阪・ホテル阪急エキスポパーク(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-07

URL: 

Published: 2013-06-26   Modified: 2013-07-17  

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