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2011 Fiscal Year Annual Research Report

STM単分子可視化法を用いたDNA二重鎖を介した電荷移動度測定法の開発

Research Project

Project/Area Number 22750078
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

大城 敬人  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教(常勤) (10462665)

KeywordsDNA / トンネル電流 / 単分子
Research Abstract

本研究の目的は,DNA二重鎖を介した電子移動度の直接測定により単分子レベルで定量評価を行い,DNA配列中の塩基対の種類,塩基対ミスマッチの種類・数・位置依存的な電子移動度の変化といったDNA鎖の電気伝導性に関する基礎的な知見を得るとともに,これに基づきDNA鎖を介した電荷移動機構の理解とそれに基づく応用展開を目指すことである。本年度は,研究実施計画に基づき,DNA鎖の配列依存的なトンネル電流の流れやすさの定量評価をおこなった.22年度に構築した微小隙間電極によるDNA鎖の測定系を用いて(J.Apploohys., 108,064312,(2010)),マイクロRNA let7 familylyの共通配列の核酸塩基DNA/RNA鎖の電気計測し、その計測データを基に配列情報の再構成することに成功した(第72回応用物理学会,日本分析化学会第60回年会、Global Technology Congress, 日本化学会第92春季年会,ISIN2012による口頭・ポスター発表).この成果を他のRNA小分子の計測に展開するため,予備研究もおこなった(Bioconjugate Chem., (2011),22,2082-2092).また、配列決定を後天的修飾情報読み取りに広げる一環として、メチルシトシンやオキソグアニンなどの修飾塩基についても電気伝導度測定を行った(J. AmChem. Soc., 133,9124-9128,(2011)。これにより単分子計測によるエピジェネティック解析を広げることにつながると予想される。また核酸塩基識別能向上を目指した電気計測と光計測を同時に行うための計測系作成した(AIP Advance, 1,032102,(2011))。また、より長いDNA鎖への計測を行うためDNA鎖の三次構造を解消するなどの分子制御技術の開発の一環として、微小ポアをもつトンネル電流計測系の構築をおこなった(第59回応用物理学関連連合講演会の口頭発表)。これにより、分子制御と分子認識を同時に行う計測系へつながると期待される。

  • Research Products

    (10 results)

All 2012 2011

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Synthesis, Structure, and Biological Activity of Dumbbell-Shaped Nanocircular RNAs for RNA Interference2011

    • Author(s)
      Abe N, Abe H, Nagai C, Harada C, Hatakeyama H, Harashima H., Ohshiro T, Maeda M, Tsuneda S, Ito Y
    • Journal Title

      Bioconjugate Chemistry

      Volume: 22 Pages: 2082-2092

    • DOI

      10.1021/bc2003154

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electrical detection of single methylcytosines in a DNA oligomer2011

    • Author(s)
      Tsutsui M, Matsubara K, Ohshiro T, Furuhashi M, Taniguchi M, Kawai T
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc.

      Volume: 133 Pages: 9124-9128

    • DOI

      10.1021/ja203839e

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of microfabricated TiO2 channel waveguides2011

    • Author(s)
      M.Furuhashi, M.Fujiwara, T.Ohshiro, M.Tsutsui, K.Matsubara, M.Taniguchi, T.Kawai
    • Journal Title

      AIP Advances

      Volume: 1 Pages: 032102

    • DOI

      10.1063/1.3615716

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] トンネル電流を指標とした単分子DNA/RNA配列決定法の開発2012

    • Author(s)
      大城敬人
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応大学日吉キャンパス
    • Year and Date
      2012-03-28
  • [Presentation] Single-Molecule Identification of DNA/RNA Towards Tunnel-Current Based Genome Sequencing2012

    • Author(s)
      Takahito Ohshiro
    • Organizer
      International Symposium on Innovative Nano-Biodevices (ISIN2012)
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂
    • Year and Date
      2012-03-21
  • [Presentation] ゲーティングナノデバイスによる単一バイオ分子計測2012

    • Author(s)
      大城敬人
    • Organizer
      第59回応用物理学関連連合講演会
    • Place of Presentation
      早稲田大学
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] トンネル電流による単分子DNA/RNAの配列決定2011

    • Author(s)
      大城敬人
    • Organizer
      日本分析化学第60回年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス
    • Year and Date
      2011-09-14
  • [Presentation] トンネル電流を指標とした単分子DNA/RNA鎖の配列決定2011

    • Author(s)
      大城敬人
    • Organizer
      第72回応用物理学会
    • Place of Presentation
      山形大学
    • Year and Date
      2011-08-25
  • [Presentation] Single-Molecule Tunnel-Current Detection Towards a Sequencing of Oligonucleotides2011

    • Author(s)
      Takahito Ohshiro
    • Organizer
      Global Technology Congress, 1^<st> Next Generation Sequencer Congress
    • Place of Presentation
      ハイアットハーバーサイド、サンフランシスコ、米国
    • Year and Date
      2011-07-06
  • [Patent(Industrial Property Rights)] ポリヌクレオチドの塩基配列決定する方法および、ポリヌクレオチドの塩基配列を決定する装置2012

    • Inventor(s)
      川合知二、谷口正輝、大城敬人、筒井真楠、松原一喜
    • Industrial Property Rights Holder
      大阪大学
    • Industrial Property Number
      特願2012-77975
    • Filing Date
      2012-03-29

URL: 

Published: 2013-06-26  

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