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2011 Fiscal Year Final Research Report

Development of functional gene-based cell enrichment method for understating microbial community in wastewater treatment systems

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 22760404
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Civil and environmental engineering
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

KUBOTA Kengo  東北大学, 大学院・工学研究科, 助教 (80455807)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Keywords環境保全
Research Abstract

We developed a method to enrich microbial cells after CARD-FISH. Effects of solvents to microbial community were also investigated. Microbial community of a phenol-degrading anaerobic reactor was analyzed. Specific FISH probes were designed and applied to decipher spatial distribution of major microorganisms involved in phenol degradation.

  • Research Products

    (15 results)

All 2012 2011 2010 2008

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] Detection of single-copy functional genes in prokaryotic cells by two-pass TSA-FISH with polynucleotide probes.2012

    • Author(s)
      Kawakami, S., T. Hasegawa, H. Imachi, T. Yamaguchi, H. Harada, A. Ohashi, K. Kubota
    • Journal Title

      Journal of Microbiological Methods

      Volume: 88(2) Pages: 218-223

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] UASB-DHSシステムによる高濃度フェノール廃水の連続処理特性とUASB内微生物叢解析2011

    • Author(s)
      山田真義, 久保田健吾, 高橋優信, 田中秀治, 山口隆司, 長野晃弘, 原田秀樹, 山内正仁
    • Journal Title

      土木学会論文集G (環境)

      Volume: 67(7) Pages: III_75-III_84

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hybridization Chain Reaction (HCR)法を用いた新規高感度FISH法の開発2011

    • Author(s)
      山口剛士, 川上周司, 幡本将史, 高橋優信, 久保田健吾, 井町寛之, 荒木信夫, 山口隆司
    • Journal Title

      土木学会論文集G (環境)

      Volume: 67(7) Pages: III_93-III_98

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Two-pass TSA-FISH法を用いた微生物機能遺伝子の視覚的検出技術2010

    • Author(s)
      長谷川拓也, 川上周司, 井町寛之, 大橋晶良, 原田秀樹, 久保田健吾
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 10 Pages: 97-103

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Enano SIMSを用いた微生物機能解明のためのGISH法の開発2012

    • Author(s)
      久保田健吾, 諸野祐樹, 原田秀樹, 稲垣史生
    • Organizer
      第46回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      東洋大学
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] 未培養微生物群の新規rrnオペロン解析法の開発2012

    • Author(s)
      白取早恵, 久保田健吾, 原田秀樹
    • Organizer
      第46回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      東洋大学
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] フェノール廃水処理UASBグラニュール汚泥の微生物群集構造解析2012

    • Author(s)
      五十嵐慧, 久保田健吾, 山田真義, 長野晃弘, 原田秀樹
    • Organizer
      第46回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      東洋大学
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] LNA置換プローブを用いたFISH法における交雑時間の短縮2012

    • Author(s)
      塚越大祐, 久保田健吾, 原田秀樹
    • Organizer
      平成23年度土木学会東北支部技術研究発表会
    • Place of Presentation
      秋田大学
    • Year and Date
      2012-03-03
  • [Presentation] UASB-DHSシステムによる高濃度フェノール廃水の連続処理特性とUASB内微生物叢解析2011

    • Author(s)
      山田真義, 久保田健吾, 高橋優信, 田中秀治, 山口隆司, 長野晃弘, 原田秀樹, 山内正仁
    • Organizer
      第48回環境工学研究フォーラム
    • Place of Presentation
      大同大学
    • Year and Date
      2011-11-25
  • [Presentation] Hybridization Chain Reaction (HCR)法を用いた新規高感度FISH法の開発2011

    • Author(s)
      山口剛士, 川上周司, 幡本将史, 高橋優信, 久保田健吾, 井町寛之, 荒木信夫, 山口隆司
    • Organizer
      第48回環境工学研究フォーラム
    • Place of Presentation
      大同大学
    • Year and Date
      2011-11-25
  • [Presentation] CARD-FISH法を利用した未培養微生物の特異的回収技術の開発2011

    • Author(s)
      五十嵐慧, 久保田健吾, 原田秀樹
    • Organizer
      第45回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2011-03-18
  • [Presentation] 低分子触媒物質を用いた高感度FISH法の開発2011

    • Author(s)
      長谷川拓也, 久保田健吾, 原田秀樹
    • Organizer
      第45回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2011-03-18
  • [Presentation] Deciphering microbial functions in granular sludge by two-pass TSA-FISH targeting functional genes2010

    • Author(s)
      Hasegawa, T., S. Kawakami, K. Kubota, H. Imachi, A. Ohashi, H. Harada
    • Organizer
      The 12th World Congress on Anaerobic Digestion (AD-12)
    • Place of Presentation
      Guadalajara, Mexico
    • Year and Date
      2010-11-04
  • [Presentation] 機能遺伝子を標的としたtwo-pass TSA-FISH法による環境微生物の特異的検出2010

    • Author(s)
      長谷川拓也, 久保田健吾, 川上周司, 井町寛之, 大橋晶良, 原田秀樹
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学
    • Year and Date
      2010-06-21
  • [Presentation] Development of gene FISH with tyramide signal amplification and its application to environmental samples2008

    • Author(s)
      Kawakami, S., K. Kubota, T. Hasegawa, H. Imachi, T. Yamaguchi, H. Harada, A. Ohashi
    • Organizer
      13th International Symposium on Microbial Ecology (ISME-13)
    • Place of Presentation
      Seattle, WA, USA
    • Year and Date
      2008-08-21

URL: 

Published: 2013-07-31  

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