• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2011 Fiscal Year Final Research Report

Spatio-temporal dynamics of adaptive genes in Arabidopsis halleri subsp. gemmifera

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 22770013
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Ecology/Environment
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

MORINAGA Shin-ichi  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教 (80568262)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Keywordsアブラナ科 / シロイヌナズナ属 / 適応進化 / ゲノム基盤 / 次世代シーケンサー / 標本 / 時空間動態 / 環境変動
Research Abstract

I sequenced the genome of Arabidopsis halleri subsp. gemmifera by using next-generation DNA sequencer to explore the adaptive genes for local habitats. Furthermore, I examined the allele frequency changes from 100 years ago to the present in some functional genes related to environmental adaptation using specimen samples. As a result, rapid allele frequency changes during the last 20 years were detected in important functional genes.

  • Research Products

    (19 results)

All 2012 2011 2010 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (14 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Fine-scale flower-visiting behavior revealed by using a high-speed camera2012

    • Author(s)
      Sakamoto, R. L., S.-I. Morinaga, M. Ito, and N. Kawakubo
    • Journal Title

      Behavioral Ecology and Sociobiology

      Volume: 66 Pages: 669-674

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Selaginella genome identifies genetic changes associated with the evolution of vascular plants2011

    • Author(s)
      Banks, J. A. et al
    • Journal Title

      Science

      Volume: 332 Pages: 960-963

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic structure of lowland and highland ecotypes of Arabidopsis halleri ssp. gemmifera(Brassicaceae) in Mt2010

    • Author(s)
      Ikeda, H., H. Setoguchi, S.-I. Morinaga
    • Journal Title

      Ibuki. Acta Phytotaxonomica et Geobotanica

      Volume: 61 Pages: 21-26

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Ecological genomics of local adaptation in a wild species of Arabidopsis2012

    • Author(s)
      Morinaga, S.-I
    • Organizer
      International Workshop for initiating a global genetic diversity assessment, Kyushu University
    • Place of Presentation
      Fukuoka, Japan
    • Year and Date
      2012-03-14
  • [Presentation] 進化し続けるイブキ・ハクサンハタザオ:機能遺伝子の時空間動態2012

    • Author(s)
      森長真一・岩崎貴也・永野惇・伊藤元己
    • Organizer
      第59回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      大津市、龍谷大学
    • Year and Date
      2012-03-09
  • [Presentation] 訪花頻度に依存しない送粉貢献-季節変動する送粉者の効果と変動しない種子生産-2011

    • Author(s)
      坂本亮太・伊藤元己・川窪伸光・森長真一
    • Organizer
      第43回種生物学シンポジウム
    • Place of Presentation
      山梨県富士吉田市
    • Year and Date
      2011-12-10
  • [Presentation] シロイヌナズナ近縁種のゲノム解析:ゲノムを温ねて生態を知る2011

    • Author(s)
      森長真一
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京都目黒区、東京大学
    • Year and Date
      2011-09-18
  • [Presentation] ハイスピード動画撮影による送粉行動の解析2011

    • Author(s)
      坂本亮太・森長真一・伊藤元己・川窪伸光
    • Organizer
      Animal 2011(第71回日本動物心理学会・第30回日本動物行動学会・2011年度応用動物行動学会/日本家畜管理学会合同大会)
    • Place of Presentation
      東京都港区
    • Year and Date
      2011-09-11
  • [Presentation] シロイヌナズナ近縁種の分布と適応:ゲノムから生態現象へ2011

    • Author(s)
      森長真一
    • Organizer
      日本進化学会第13回大会
    • Place of Presentation
      京都市左京区、京都大学
    • Year and Date
      2011-07-31
  • [Presentation] 異なる標高におけるハクサンハタザオとイブキハタザオの紫外線によるDNA損傷とその防御メカニズム2011

    • Author(s)
      永野聡一郎・齋藤佳奈・Wenhui Zhang・矢野歳和・森長真一・日出間純・彦坂幸毅
    • Organizer
      第58回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      札幌市、札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2011-03-10
  • [Presentation] 適応遺伝子の時空間動態:イブキ・ハクサンハタザオにおける分子「古」生態学的解析2011

    • Author(s)
      森長真一・長谷和子・永野惇・伊藤元己
    • Organizer
      第58回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      札幌市、札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2011-03-09
  • [Presentation] 開花時期に伴い変動する複数訪花者の送粉貢献2011

    • Author(s)
      坂本亮太・森長真一・伊藤元己・川窪伸光
    • Organizer
      第58回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      札幌市、札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2011-03-09
  • [Presentation] 植物の分布と適応:ゲノムが語る低地と高地の形質分化2011

    • Author(s)
      森長真一
    • Organizer
      第10回日本分類学会連合公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京都、国立科学博物館新宿分館
    • Year and Date
      2011-01-09
  • [Presentation] 標高の上昇に伴う紫外線によるDNA損傷の増加と高標高生態型の適応的分化2010

    • Author(s)
      永野聡一郎・齋藤佳奈・Wenhui Zhang・矢野歳和・森長真一・日出間純・彦坂幸毅
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京都目黒区、東京大学
    • Year and Date
      2010-09-19
  • [Presentation] 植物標本から過去を紡ぐ:イブキ・ハクサンハタザオにおける分子「古」生態学的解析2010

    • Author(s)
      森長真一・永野惇・伊藤元己
    • Organizer
      日本植物学会第74回大会
    • Place of Presentation
      愛知県春日井市、中部大学
    • Year and Date
      2010-09-11
  • [Presentation] ハクサンハタザオとイブキハタザオの葉の解剖学的・生化学的特性の標高傾度に沿った変異とその生態学的意義2010

    • Author(s)
      永野聡一郎・森長真一・彦坂幸毅
    • Organizer
      日本植物学会第74回大会
    • Place of Presentation
      愛知県春日井市、中部大学
    • Year and Date
      2010-09-11
  • [Presentation] Ecological genomics of a wild species of Arabidopsis growing along an altitudinal gradient2010

    • Author(s)
      Morinaga, S.-I
    • Organizer
      International symposium, Eco-Evolutionary Approaches to Climate Changes : Rapid Adaptation to Climate Changes in Plants
    • Place of Presentation
      Kyushu University, Fukuoka, Japan
    • Year and Date
      2010-08-29
  • [Book] ゲノムが拓く生態学-遺伝子の網羅的解析から迫る植物の生きざま-2010

    • Author(s)
      永野惇・森長真一
    • Total Pages
      375
    • Publisher
      文一総合出版
  • [Remarks]

    • URL

      http://sites.google.com/site/simorinaga/

URL: 

Published: 2013-07-31  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi