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2011 Fiscal Year Annual Research Report

中性子結晶構造解析で見るフェレドキシン依存性ビリン還元酵素のプロトン化機構

Research Project

Project/Area Number 22770096
Research InstitutionIbaraki University

Principal Investigator

海野 昌喜  茨城大学, フロンティア応用原子科学研究センター, 准教授 (10359549)

Keywordsフィコシアノビリン / PcyA / 中性子結晶解析 / 水素原子 / 反応機構 / 大型結晶 / 宇宙実験 / 高分解能
Research Abstract

フェレドキシン依存性ビリン還元酵素PcyAは二段階の二電子還元・ニプロトン化を位置特異的かつ順特異的に繰り返し、ヘム分解産物であるビリベルジンからフィコシアノビリンを生合成する酵素である。フィコシアノビリンは光合成や植物の光応答に使われる生命にとって大切な色素である。この生合成機構を水素原子レベルで理解するために、我々は、中性子結晶解析を目指した、大型結晶作成に取り組んできた。
しかし、平成23年3月11日の大震災により、研究用原子炉やJ-PARCはしばらく稼働できない状況に陥り、中性子回折実験は一度も行うことが出来なかった。
それと並行して、JAXAとの共同研究で宇宙実験を試みたり、緩衝液の最適化など結晶化条件の検討、および創晶の新規結晶化キット等を用いたTop-Seeded Solution Growth法を試みることが出来た。
現在のところ、最大2.3X12X0.7mm^3の大きな結晶を得ることに成功している。
また、質の良い結晶を用いて、放射光を使ったX線結晶構造解析にも着手している。最高分解能1.1Aの構造を得て、一部の水素原子も同定できた。ただし、活性部位近傍は水素原子は見えていない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] 金属タンパク質のX線結晶構造解析:ヘム分解酵素の反応中間体2011

    • Author(s)
      海野昌喜、松井敏高、齋藤正男
    • Journal Title

      日本結晶学会誌

      Volume: 53 Pages: 213-218

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] S100 and S100 fused-type protein families in epidermal maturation with special focus on S100A3 in mammalian hair cuticles2011

    • Author(s)
      Kizawa, K., et al.
    • Journal Title

      Biochimie

      Volume: 93 Pages: 2038-2047

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2011.05.028

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors2011

    • Author(s)
      Unno, M., et al.
    • Journal Title

      J.Mol.Biol.

      Volume: 413 Pages: 667-683

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2011.08.043

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Refined Crystal Structures of Human Ca^<2+>/Zn^<2+>-Binding S100 A3 Protein Characterized by Two Disulfide Bridges2011

    • Author(s)
      Unno, M., et al.
    • Journal Title

      J.Mol.Biol.

      Volume: 408 Pages: 477-490

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2011.02.055

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] フェレドキシン依存性ビリン還元酵素PcyAの大型結晶作製の試みと高分解能結晶構造解析2011

    • Author(s)
      石川久美子, 他
    • Organizer
      日本化学会関東支部 茨城地区研究交流会
    • Place of Presentation
      東海村
    • Year and Date
      2011-11-04
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.fas.ibaraki.ac.jp/?page_id=827

URL: 

Published: 2013-06-26  

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