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2010 Fiscal Year Annual Research Report

In-situ光照射-固体NMRによる光受容膜タンパク質の構造解析手法の開発

Research Project

Project/Area Number 22770101
Research InstitutionYokohama National University

Principal Investigator

川村 出  横浜国立大学, 工学研究院, 研究教員 (20452047)

Keywords固体NMR / 膜タンパク質 / レチナール / 光異性化 / 脂質二重膜 / センサリーロドプシン / バクテリオロドプシン / 構造生命科学
Research Abstract

本研究ではレチナールタンパク質(ロドプシン類)の光活性構造を観測するために、In-situ光照射-固体NMR測定システムを開発および利用し、その機能発現メカニズムを明らかにすることが目的である。
1.光照射システムの開発およびその利用によって、NMR測定中に試料を光励起することが可能となった。これによって、フォボロドプシン(センサリーロドプシンII)中のレチナール分子の光異性化をNMRの化学シフト変化として直接観測した。特にフォトサイクル中の活性中間体(M中間体)を捕捉し、そのNMR信号は多重線になっていること、また変異体の信号と比較しても、野生型のフォボロドプシンでは複数の状態が存在することが示唆された。
2.真正細菌由来のアナベナセンサリーロドプシンについては、光活性構造およびトランスデューサータンパク質との相互作用を観測するための準備として、タンパク質NMR信号の連鎖帰属を試みた。均一^<13>C,^<15>N標識したASRを脂質二重膜に再構成した試料を測定した。1次元^<15>N NMRおよび^<13>C-^<13>C相関スペクトルから、線幅の狭いよく分離したNMR信号が得られ、レチナール結合部位であるシッフ塩基の^<15>N NMR信号からASRのレチナールはAll-trans型の配座のみをとっており、脂質膜中のASRは極めて均一性の高いことがわかった。さらに、3次元NMR測定を行い、アミノ酸残基間および残基内のスピン系を構築し、連鎖帰属を試みたところ、膜貫通領域においては約85%の信号帰属を達成し、結晶構造では観測できなかったBCループの構造をβシート構造と示すことができた。またH/D交換の実験からタンパク質の細胞質側は脂質二重膜からやや突出していることも明らかにした。(Angew.Chem.Int.Ed.(2011))

  • Research Products

    (15 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (12 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Conformation of a Seven-Helical Transmembrane Photosensor in the Lipid Environment2011

    • Author(s)
      L.Shi, I.Kawamura, K.H.Jung, L.S.Brown, V.Ladizhansky
    • Journal Title

      Angew.Chem.Int.Ed.

      Volume: 50 Pages: 1302-1305

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 固体NMRによる7本膜貫通型-光受容膜タンパク質の構造解析2011

    • Author(s)
      川村出, L.Shi, L.S.Brown, V.Ladizhansky
    • Organizer
      日本化学会 第91回春季年会
    • Place of Presentation
      神奈川大学 横浜キャンパス
    • Year and Date
      20110326-20110329
  • [Presentation] 光照射固体NMRを用いたppRのM中間体の観測と光異性化によるレチナールグループの構造変化の解析2010

    • Author(s)
      友永雄也、日高徹郎、川村出、和田昭盛、須藤雄気, 加茂直樹、内藤晶
    • Organizer
      BMB2010第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] Local structural change and dynamics at Tyr residues in Bacteriorhodopsin corresponding to two isomers of retinal as revealed by solid-state NMR2010

    • Author(s)
      堀籠美也子、川村出、辻暁、内藤晶
    • Organizer
      BMB2010第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 固体NMRによるアナベナセンサリーロドプシンの構造解析2010

    • Author(s)
      I.Kawamura, L.Shi, K.H.Jung, L.S.Brown, V.Ladizhansky
    • Organizer
      第49回NMR討論会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀
    • Year and Date
      20101115-20101117
  • [Presentation] 光照射NMRによるレチナールタンパク質の光中間体の観測2010

    • Author(s)
      内藤晶, 友永雄也、日高徹郎, 川村出、西尾拓道、大澤一弘、和田昭盛、須藤雄気、加茂直樹
    • Organizer
      第49回NMR討論会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀
    • Year and Date
      20101115-20101117
  • [Presentation] 光照射固体NMRによる光受容膜タンパク質ppR-pHtrII複合体の負の走光性発現に関わるTyr174の局所構造変化の解析2010

    • Author(s)
      日高徹郎、友永雄也、川村出、和田昭盛、須藤雄気、加茂直樹、内藤晶
    • Organizer
      第49回NMR討論会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀
    • Year and Date
      20101115-20101117
  • [Presentation] Solid-state NMR Structural Study of Anabaena Sensory Rhodopsin in the lipid environment2010

    • Author(s)
      I.Kawamura, L.Shi, K.H., Jung, L.S.Brown, V.Ladizhansky
    • Organizer
      3rd Japanese-French Joint Seminar on Organic Photochromism-Innovations in Photochromism-
    • Place of Presentation
      日石ホール,横浜
    • Year and Date
      20101021-20101022
  • [Presentation] 多次元固体NMRによるアナベナセンサリーロドプシンの構造解析2010

    • Author(s)
      川村出
    • Organizer
      第11回 若手NMR研究会
    • Place of Presentation
      検見川セミナーハウス、千葉
    • Year and Date
      20100916-20100918
  • [Presentation] Structural Change of Tyr residues in Bacteriorhodopsin corresponding to retinal configurations as studied by solid-state NMR2010

    • Author(s)
      I.Kawamura, M.Horigome, S.Tuzi, A.Naito
    • Organizer
      14th International Conference on Retinal Proteins (ICRP2010)
    • Place of Presentation
      UCPC, Santa Cruz, San Francisco, USA
    • Year and Date
      20100802-20100806
  • [Presentation] ^<13>C固体NMRによる暗順応状態バクテリオロドプシンの構造解析2010

    • Author(s)
      川村出、堀籠美也子、辻暁, 内藤晶
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      20100616-20100618
  • [Presentation] Protein-backbone conformations of archaeal-type rhodopsin as studied by solid-state NMR2010

    • Author(s)
      I.Kawamura, M.Horigome, S.Tuzi, A.Naito
    • Organizer
      Pacifichem 2010
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii, USA(一般英語口頭発表)
    • Year and Date
      2010-12-16
  • [Presentation] Three-dimensional Solid-state NMR study of Anabaena Sensory Rhodopsin in the lipid environment-Chemical Shift Assignments-2010

    • Author(s)
      I.Kawamura, L.Shi, L.S.Brown, V.Ladizhansky
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学 川内キャンパス
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Book] 拡がるNMRの世界~40人のNMR研究者からの熱いメッセージ~"レチナール蛋白質の固体NMR構造解析"分担執筆2011

    • Author(s)
      川村出
    • Total Pages
      78-81
    • Publisher
      コロナ社
  • [Remarks] 横浜国立大学 研究者総覧

    • URL

      http://er-web.jmk.ynu.ac.jp/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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