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2010 Fiscal Year Annual Research Report

枯草菌一般ストレス応答における情報伝達機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22770142
Research InstitutionJapan Synchrotron Radiation Research Institute

Principal Investigator

牧野 正知  (財)高輝度光科学研究センター, 利用研究促進部門, 協力研究員 (30529582)

Keywords蛋白質 / シグナル伝達 / 微生物 / X線 / 構造生物
Research Abstract

本年度はマンガンイオン要求性PPMホスファターゼRsbPに焦点を当て研究を進めた。RsbPはホスファターゼドメイン(PPMドメイン)のN末端側に、PASドメインとcoiled-coilドメイン(CCドメイン)を有するマルチドメイン蛋白質である。各ドメインの機能や分子内情報伝達の仕組みに迫るため、PASドメインを欠損させたコンストラクト、PPMドメインのみのコンストラクトを新たに調製した。PPMドメインについては大量発現系を構築し、精製方法・溶液条件・結晶化条件を検討した。その結果、塩を沈殿剤とする条件で結晶が得られた。大型放射光施設SPring-8にて回折データ収集を行ったところ、分解能は2.2A、空間群はP42_12、格子定数はa=b=104.0A,c=51.3Aで非対称単位中に1分子含まれていることが分かった。現在、分子置換法による構造決定を試みている。一方、RsbP全長蛋白質については、予備的な実験から容易に凝集を起こすことが分かっていたため、動的光散乱測定による溶液条件の改善を試みた。その結果、緩衝液に含まれる塩濃度を下げることで凝集を避けられることが分かった。それを踏まえ結晶化を行ったところ、3×3×30μm程度の針状結晶が得られた。このような微小な結晶から回折像を効果的に収集するためには、結晶以外の散乱体からのバックグラウンドノイズを可能な限り低減させる必要がある。そこで新たに微小結晶をマウントするための器具の開発も行った。また結晶構造解析によるアプローチに加え、本年度はX線小角散乱測定を実施した。予備的な実験結果から、溶液状態ではダイマーを形成していることが推測された。

  • Research Products

    (2 results)

All 2011 2010

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of the carbon monoxide complex of human cytoglobin2011

    • Author(s)
      Masatomo MAKINO
    • Journal Title

      Proteins

      Volume: Vol.4 Pages: 1143-1153

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] PASドメインを有するストレス応答ホスファターゼRsbPの構造生物学研究2010

    • Author(s)
      牧野正知
    • Organizer
      日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-17

URL: 

Published: 2012-07-19  

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